藏猪高原适应性相关基因的鉴定及其dna甲基化调控规律

《藏猪高原适应性相关基因的鉴定及其dna甲基化调控规律》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、＇巧分类号Ｓ８２８８＿级—＿、ＵＤＣ学号醒２碰＿—＿苗瑪沁，冷乐＇管１＾＊雙咖義雞：四川巧业大学，淵，片■，４．一．私，＇龜热唐高原适应性相关基因的鉴定及其ｉｖＤＮＡ甲基化调巧规律、、＼＇＇．．：．＇－＇．考＼餐＼：＇．，＇．＂．、．‘、．‘＇兮．Ｖ．．、；０．、呼＇‘、’麵采乂‘：．，ｙ＇？＊．？．－？？＇＇＊■．Ｙ｜．？＿、■．导巧＇稀六＾巧李学無摘霞满．ｔ舉輸巧壤護若势：貨獲学首

2、专业／‘舞物遗传育与赃―气調—怒雙＞巧如方ｋ巧：‘，’、１５．０５？巧论文挺辩时间．２０，＞ｖ主巧＾東庆教授（四川农业大学）幸ｔ資，答辩委巧会？Ｉ＂｜—ＩＩＩ．、、＂ＩＪ＊．ｔ＊＇－＇．．．＇’■＾／／Ｖ、、占：；占：‘＇＾＇．．＂＇；＇＾＇＾＃；，．、．克＾：＾＾５年５月；：．寮為；，把葦巧齡’’＇’：１－－；－．ｉ、：巧早嫉ｔｉ；：品當群棘賊九：濟譯速緊、净直鸿臺掉货獄沾攀叛接；．－，．麵義馬＇４操！龜１１誦

3、讓．；一蠻讓嗎ｉｉ誦Ｓｉｃｈｕａ田ＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＤｏｃｔｏｒＤｅｒｅｅＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏ打ｇ－ｗ－ＧｅｎｏｍｅｉｄｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆｈｉｈａｌｔｉｔｕｄｅｇｒｅｌａｔｅｄｅｎｅｓａｎｄＤＮＡｍｅｔｈｌａｔｉｏｎｒｅｕｌａ村ｏｎｇｙｇｏｆｅｎｅｅｘｒｅｓｓｉｏｎｉ打ＴｉｂｅｔａｎｉｓｇｐｐｇＪｉｎｌｏｎｇ（ＡｎｉｍａｌＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＢｒｅｅｄｉｎｇ）ＤｉｒｅｃｔｅｄｂＰｒｏ化ｓｓｏｒＬ

4、ｉｘｕｅｗｅｉｙ２０１５．０５论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机一构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：年＾月处日矣于论文使用授权的声明、本人完全了解四川农业大学有关保留使用学位论文的

5、规定，即：学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被査阅和借阅，可采用影印、缩印或扫推等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。。□。本论文不保密本论文保密，在＿＿年解密后适用本授权＂＂（请在Ｗ上□内划Ｖ）研究生签名：年月／日＿￥导师签名：Ｓ年（月日又《么ｆ四川农业大学博±学位论文摘要摘要藏猪是青藏高原地区驯化起源的较为古老的地方猪种一，为我国唯的高原猪种，一也是世界

6、少有的微型猪种之。目前对藏猪的相关研究大多停留在表型特征、地理分布和生活习性等方面，而对藏猪高原适应性和重要经济性状的分子机理研究报道不多，严重影响了藏猪资源的合理利用。本研究的立意与基本思路是利用高通量基因组测序技术，从基因组水平出发寻找藏猪高原适应性的遗传变异与相关功能基因。本研巧主要通过将藏猪和其他地方猪种进行比较分析，从线粒体ＤＮＡ、基因組ＤＮＡ、ｍＲＮＡ转录组水平全面解析藏猪高原适应性的分子机制，并且通过藏猪的移居实验，构建骨骼肌全基因组ＤＮＡ甲基化图谱－，结合ＲＮＡＳ巧数

7、据进行联合分析，试图探索藏猪高原适应性的表观遗传机制。主要结果如下：（１）获得了６个不同地区藏猪的全线粒体ＤＮＡ序列，长度约为１６．７化，发现藏猪线粒体ＤＮＡ大部分区段的核昔酸多样性高于其他地方猪种。（２）藏猪１６ｓｒＲＮＡ受到了负向选择Ｗ适应高原环境，＾巧６基因在藏猪的进化过程中经历了正向选择。Ｃ３）包括藏猪和四川地方猪种在内的所有个体重测序共产生６５９．４Ｇｂ数据，不同群体的ＳＮＰ检测结果显示，藏猪群体拥有８巧０５０１个ＳＮＰ位点与中国其他家猪共，，，享ＳＮＰ数目为４

8、，９０９，５６４，高于所有猪种共享的ＳＮＰ数目３，０２０，３８６。（４）基于全基因组ＳＮＰ信息位点的系统发育分析结果思示，所有个体先按照地理位置的不同聚为欧洲猪和亚洲猪，中国猪种按照区域的不同聚类为西南地区家猪和东南地区家猪一，藏猪则分别按照６个不同群体各自聚为小支。一（５）群体遗传结构的分析结果与系统发育分析结果致，６个藏猪群体中，甘孜地一区与迪庆地区藏猪的祖先单倍型更加单，说明这两个区域的