家猪和野猪大脑组织的比较转录组研究

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2、．？、／、Ｖ＊－．．？．．Ｉ．．？＇？／，，■■Ｊ？指导教师李学伟教授％三■＇－’，一．－：‘节－一＾学科专业动物遗传育种与巧殖嗚．■．；１，研巧方向猪的遗传育种乾—￣￣－％■ｒ－？＜Ｊ—２０１５年６月■，Ｉ＾ｅ？＼＇三ｒ．．－，、＊．軒？＊’一、＼？－、？？．、，．，．．．＇、’．■＇一ＶＶＶ；．，．ＳｉｃｈｕａｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ

3、ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＭａｓｔｅｒＤｅｇｒｅｅＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ乂ｃｏｍｒｅｈｅｎｓｉｖｅＣｏｍａｒｉｓｏｎｏｆｐｐ－－ｂａｓｅｄＲＮ乂ｓｅＴｒａｎｓｃｒｉｐ化ｍｅＡｎａｌｓｉｓｏｆｑｙｂｒａｉｎｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｗｉｌｄｂｏａｒａｎｄＤｏｍｅｓｔｉｃｉｐｇＡｕｔｈｏｒ：ＷａｎｇＹｕｅＳｕｅｒｖｉｓｏｒ：Ｐｒｏｆ．ＬｉＸｕｅｗｅｉｐＭａｏｒ：ＡｎｉｍａｌＢｒｅｅｄｉｎａｎｄＧｅｎｅｔｉｃｓｊｇＳｅｃｉａｌｔ：ＰｉｇＢ化ｅｄｉｎａｎｄＧｅｎｅ

4、ｔｉｃｓｐｙｇ２０１５．６论文指导小组成员姓名职巧料单位￣￣李学伟动物遗传育种与繁殖四川农业大学动物科技学院朱碼教授动物遗传育种与巧殖四川农业大学动物科技学院李明洲教授动物遗传育种与繁殖四川农业大学动物巧传育种研巧所蒋岸岸商级实验师动物遗传育种与繁殖四川农业大学动物遗传育种研究所牛莉丽讲师动物遗传育种与繁殖四川农业大学动物科技学院唐茜子助理研巧员动物遗传育种与巧殖四川农业大学动物遗传育种研究所马继登助理研巧员动物巧传育种与巧殖四川农业大学动物遗传育种研巧所

5、本研究得到教育部长江学者和创新团队发展计划（ＩＲＴ１３０８３）资助＂四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验＂室完成论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体己经发表或撰写过的研巧成果，也不包含为获得四川农业大学或其它一教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研巧生签名；％

6、（Ｔ年＜￥月／ｒ曰关于论文使用授权的声明目本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定，Ｐ；学校有权保‘留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电于版，允许论文被查阅和借阅，可采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可＾；１用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。！□本论文不保密。□本论文保密。，在＿＿年解密后适用本授权＂＂（请在Ｗ上□内划Ｖ）研巧生签名：兴（Ｔ年６月度曰一导师签名：山唯年月／〇曰摘要脊椎动物中枢神经系统的髙级部位是大

7、脑，它是生命机能的主要调节器。本（ＷＢ－Ｊ（ＲＣ））的大脑为研究对象，通过１＾人５研巧｜＾？荣昌猪和野猪巧测序技术检测了ＲＣ和ＷＢ大脑的ｍＲＮＡ表达谱，鉴定新的ｍＲＮＡ转录本、可变剪切、ＳＮＶｓ和ＩＮＤＥＬｓ；通过差异分析筛出在ＲＣ和ＷＢ的大脑组织中差异表达的基因，分析了关键基因与功能差异的关系。为ＲＣ和ＷＢ的相关研究提供新的参考数据，同时也为家养动物起源与驯化的研究提供参考。ＲＮＡ－利用ｓｅｑ测定２个组织的转录组，共获得Ｕ４Ｍ脚ｉｌｌｉｏｎ）、测序读长为ｂ３．３８Ｇｂｉａｂａｓｅｓ的数据ｌＯＯｐ的双末

8、端序列，产生大约２（ｇｇ），共鉴定出１１６４６６个，转录本，其中ＲＣ中有巧７９７个、ＷＢ中有５８，６的个，并在民Ｃ和ＷＢ中分别发现了７，９６８和８，０６２个新转录本；分析２个转录文库的序列变异共发现３７，８９９个可变剪