ncⅱ群体qtl定位软件包gas_ncⅱ的研制

《ncⅱ群体qtl定位软件包gas_ncⅱ的研制》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号８＿＿ＱＭ＿＿学号２０１２１０１１５９為请泉邊义每学术型硕壬学位论文■ＮＣＩＩ群体Ｑ化定位软件包ＧＡＳＮＣＩＩ的研制＿易灿？．指导教师章元明教授■学科口类农学专＇业名称作物遗传育种研究方向统计基因组学答辩日期二〇—五年五月ＴＨＥＤＥＶＥＬＯＰＭＥＮＴＯＦＴＬＭＡＰＰＩＮＧＱＳＯＦＴＷＡＲＥＰＡＣＫＡＧＥＧＡＳＮＣＩＩ＿ＢｙＣａｎＹｉＡＤｉｓｓｅｒｔ；ａ村ｏｎＳｕｂｍｉｔｔｅｄｔｏＮａｎｉｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｊｇｇ

2、ｙ＾Ｉｎ化ｅＩａｒｔｉａｌＦｕｌｆｉｌｌｍｅｎｔｏｆ化ｅＲｅｑｕｉｒｅｍｅｎｔｓＦｏｒ’ＭａｓｔｅｒｓＤｅｇｒｅｅＳｕｐｅｒｖｉｓｅｄｂｙＰｒｏｆ－Ｚｈａｎ．ＹｕａｎＭｉｎｇｇＣｏｍｌｅ化ｄｉｎＭａ２０１５ｐｙ，ＣｏｌｌｅｅｏｆＡｒｉｃｕｌｔｕｒｅｇｇ，ＮａｎｉｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｊｇｇｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ２１００９５，Ｐ？化Ｃｈｉｎａ原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研巧Ｉ作。所取得的成果除文中己经注明引

3、用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重嬰贡献的个人和集体，均己在文中Ｗ明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。＾学位论文作者（駕亲笔）签名：年月３日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，化许论文被查阅和借阅。本人授权南京农业大学可Ｗ将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印。、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文保密□，在年解密

4、后适用本授权书。本学位论文属于不保密口。＿＿＂＂（请在１Ｖ）：＾上方框内打学位论文作者（需亲笔）签名；年导师（需亲笔）签名：年月曰目录ｇ＾ｉ摘要ＩＡＢＳＴＲＡＣＴＩｌｌ主要缩略词Ｖ一第部分文献综述１一第章文献综述１１．１数量性状１１．２关联分析的研巧进展２１．２．１关联分析的概念２１．２．２关联分析的线性模型方法３１．２．３关联分析的混合线性模型方法３１．２．４关联分析的快速算法５１．２．５关联分析的多ＱＴＬ方法６１．３遗传交配设计的研究进

5、展７１．３．１遗传交配设计７１．３．２遗传交配设计的种类８１．３．３遗传交配设计的经典数量遗传学分析方法与作物育种９１．３．４遗传交配设计的分子数量遗传学分析与作物育种１２１．４关联分析软件包研究进展１３１１．５本研巧的目的与内容５第二部分研究报告１９第二章ＧＡＳＮＣＩＩ软件包的原理和方法１９＿２．１理论与方法１９２丄１遗传模型１９ｉＮＣＩＩ群体ＱＴＬ定位软件包ＧＡＳＮＣＩＩ的研制＿２丄２参数估计２０２ｅｓ２０丄２．１经验Ｂａｙ２．１ＥＢＬＡＳＳＯ２．２．

6、２１２丄２．３海量效应的极端分组与卡方相结合方法２２２丄２．４海量效应的参数估计２２２丄３似然比检验２３２．２ＮＣＩＩ遗传交配设计遗传分析的主要算法模块２３２．２．１极端分组的快速排序算法２３２．２．２ＥＢＬＡＳＳＯ中的交叉验证算法２４２．３ＧＡＳ＿ＮＣＩＩ软件包的所需软硬件配畳与运行环境２５２．３．１ＰＣ软硬件基本配置２５２．３２ＧＡＳＮＣＩＩ软件包运行环境２５．＿第Ｈ章软件的设计目标２７３１．软件系统分析２７３．２软件系统设计２７３．２．１总体目标２７３．

7、２．２计算流程图２７３．２．３开发的关键技术。３．２．４支持数据文件格式２８３．２．５功能设汁２８３．２．６主界面设计３０第四章软件的验证３３４．１海量效应估计模块的ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ模拟研究３３４．２经验Ｂａｙｅｓｉａｎ模块的验证３３４．３ＥＢＬＡＳＳＯ模块的验证３４第五章软件操作巧ｉｉ５．１经验Ｂａｙｅｓｉａｎ模块的使用操作３９５ＥＢＬＡＳＳＯ４３．２模块的使用操作５．３海量效应估计模块的使用操作４５第六章讨论４７６．１软件内部算法的意义

8、４７６．２软件的稳健性４７６．３软件的应用范围、优点和限制４７６．４同类遗传分析比较４８