马铃薯块茎形状基因的遗传定位与分子标记开发

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1、帝濟：．ｒ亂＇．、…－一－－？．一－省，．＇．Ｖ—寻密级著；论文编号：中国农兜科学惊：学位论文马铃著块茎形状基因的遠传定位与分子标记开发ＧｅｎｅｔｉｃＭａｐｐｉｎｇａｎｄＭｏｌｅｃｕｌａｒＭａｒｋｅｒｓＤｅｖｅｌｏｍｅｎｔｏｆｐＴｕｂｅｒＳｈａｐｅＧｅｎｅｉｎＰｏｔａｔｏ￥硕±研究生：朱文文．指导教师：金黎平研究员、？申请学位类别：农学硕±’专业：蔬菜学研究方向：马铃馨遗传育种，培养单位：中国农业科学院蔬菜花并研究所中国农业科学院研究生院与

2、，提交日期２０１５年４月密级：论文编号：中国农业科学院学位论文马铃薯块茎形状基因的遗传定位与分子标记开发GeneticMappingandMolecularMarkersDevelopmentofTuberShapeGeneinPotato硕士研究生：朱文文指导教师：金黎平研究员申请学位类别：农学硕士专业：蔬菜学研究方向：马铃薯遗传育种培养单位：中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院研究生院提交日期2015年4月Secrecy：No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationGeneticM

3、appingandMolecularMarkersDevelopmentofTuberShapeGeneinPotatoM.S.Candidate：ZhuWenwenAdvisor：ProfessorJinLipingMajor：VegetableScienceSpecialty：PotatoGeneticsandBreedingApril2015摘要本研究利用二倍体马铃薯块茎形状（薯形）分离群体材料基于马铃薯基因组序列信息结合分离群体分组分析法（BSA）开发标记，同时结合薯形分离群体表型鉴定结果构建了薯形基因Ro区域遗传图谱；利用四倍体材料对开发的分

4、子标记进行检测，获得了一个圆形薯形分子标记，可应用于马铃薯标记辅助育种。主要结果如下：1.连续4年对薯形分离群体进行了表型鉴定。利用二倍体长形亲本10618-01和圆形亲本320-02杂交，对获得的F1代薯形分离群体进行表型鉴定，结果做卡方适合性检验表明长薯形和圆薯形基因型比例符合1：1，证明薯形是由单基因控制的。另外，从薯形频率分布图可看出，块茎形状的分布比例并不呈现明显的长圆双峰形状而是倾向于圆形，说明除了基因Ro控制薯形外，还存在其它微效基因的修饰作用。2.开发了17个薯形分子标记。根据马铃薯基因组相关序列信息并结合分离群体分组分析法（BSA）开

5、发了17个与薯形基因Ro紧密连锁的分子标记。17个分子标记中包括13个CAPS标记、3个dCAPS标记及1个SCAR标记，13个CAPS标记和3个dCAPS标记均为共显性标记，SCAR标记为显性标记，其中6个标记是与圆形薯形性状以相斥相连锁的。3.构建了薯形基因Ro区域遗传图谱。利用开发的17个分子标记结合薯形分离群体表型鉴定结果，利用Joinmap4.0软件构建了Ro基因区域遗传图谱，该遗传图谱覆盖的区域长度为44.7cM，标记之间的平均图距为2.63cM，将Ro基因定位于542-CAPS和1137-CAPS2.8cM区间内，物理距离约为460kb，

6、其中1137-CAPS标记与Ro基因的遗传距离最近，约为0.2cM。4.开发了一个可应用于马铃薯分子标记辅助育种的标记。利用53份来源于51个杂交组合的四倍体品系对开发的17个与薯形紧密连锁的分子标记进行检测，获得了一个与四倍体马铃薯圆形块茎性状连锁的标记1137-CAPSVI，该标记与圆薯形吻合度达91.42%，表明该标记可应用于马铃薯分子标记辅助育种。关键词：马铃薯，薯形基因，标记开发，遗传图谱，标记辅助育种IAbstractInthisstudy,adiploidF1tubershapesegregatedpopulationwasusedtod

7、evelopmolecularmarkersandconstructageneticmapofRogeneregionthatdetermineround-shapetuberusingthegenomesequenceinformationandbulkedsegregationanalysis(BSA).Inordertodevelopmolecularmarkersthatcanbeappliedinpotatomarker-assistedbreeding,themarkerswereverifiedontetraploidclones.The

8、mainresultsachievedareasfollows：1.Tubershapeofs