《衡阳地区镰形扇头蜱分布和带菌情况调查》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
。,“、-’、'':.‘'■.-?.巧,.■龄:妙,:京综茂緊辑城-灣:’.'‘".V-立V'...;'導轉顏/..嶺鑽‘f?:,,、;全日制硕±专业学位论文心.,;-'''、::.:?-:v.巧,;审7''’.-:节人禪满蜡:;衡阳地区编形扇头蜗分布和带菌情况调查I./>:誘謎.和fm麵;.…刘瑞昆……_?細;、‘命’-:Ir指导教师程天印教授:,.'.乂.;^巧审诉科甲V'副指导教师■.'’'',乂责矿.|去>;.皆’'/;学化类型兽医硕古',’’f.'.’.■’.I.....i.;‘'/,'/学科领域——二’:這诘古右辨.巧岳'研巧方向寄生虫分子生物学’f.…1''.■'乂'‘V片乂、‘.占I'':‘一'‘?’一‘...,.':.;V一'’.^.^'....\;.L古V。..:.::.V^.-I'.;'V/'.茲蟲編參?.;i霜:::.:游縫常靖教雜;;韻脚養賓鑄靖;‘话殺帛班:遊游幾宇戟顯祭蒂篆議塵鴻嶺難:鶴觀傑礫 分类号糾55.9密级UDC单位代码10537顯斋农巫夫緣全日制硕:±:专业学位研究生论文衡阳地区镶形扇头蜗分布和带菌情况调查SurveyOnDistributio田andCarrierbyRhipicephalushaemaphysaloidesinHengyang研究生姓名刘瑞昆指导教师程天印教授副指导教师学位类型兽医硕古学科领域硏究方向寄生虫分子生物学论文答辩日期2015年6月6日答辩委员会主席刘毅论文评阅人刘道新、卿上田、刘进辉二0—五年六月 独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中持别加W标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得湖南农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间:。年月良导‘V/如外却关于论文使用授权的说明本人完全了解湖南农业大学有关保留、使用学位论文的规定,目P:学校有权保留送交论文的复印件和电子档,允许论文被查阅和借阅,可y?采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意湖南农业大学可W用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容,并同意将由此产生的收益捐赠给学校教育基金会用于发展研究生教育。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名;时陆年月。抑起oM/川*2^导师签名:时间:年月,曰占/i了 摘要摘要本研究形态学方法和分子生物学方法对采自湖南省衡阳地区山羊体表的蜡虫进行了鉴定PCR-DGGE技术;采用对嫌形扇头婢雌成婢携带细菌情况进行了分析,结果如下;1.体视显微镜观察显示:采自湖南省衡阳地区山羊体表的婢虫假头基六角形、具眼。与文献记述的鎌形扇头碑形态结构、肛后沟;雄成婢侧肛板成嫌刀形一致特点。2-1-.扩増S和Cox1、克隆、测定了采自湖南省衡阳地区山羊体表婢虫的口;enBank-与G库中的序列比对显示:衡阳地区采集的婢虫的口S1与DQ8395522(嫌-形扇头婢)同源性是100%Cox1enBank7370化(镶形扇头婢)同;其与G中JQ源性为99.3%。3.通过DGGE分析嫌形扇头婢携带细菌,9条明显条带的序列分别与柯克斯氏体属(CoxieJJasp.)、假单胞菌属(化eudoflonassp.)芽抱杆菌属化aciJJus’(tlocjVt.)、葡萄球菌属SaphyoccusS9.)、eserenkoma、邓J涅斯捷连科氏菌属()共生菌(Symbioticbacteria)和未培16SrDNAV养王壤细菌的3区序列高度相似。分离到2株细菌,为模仿葡萄球菌和蜡样芽抱杆菌。形态-1ox-1DGGE关键词:蜡;ITSC列分析;;;序;I 湖南农业大学硕±学位论文AbstractI打thisstudthetickscollectedfromtheoatsinhunanhe打anreio打arey,ggyggidentifiedbymorholoicalandmolecularbioloicalmethod.Thebac1;eriacarriedpgg-bthefemaleadulttickisa打alzedwithPC民DGGEtheresultsareasfollows:yy,1Thtttts.eickscollecedfromhegoai打hunanhe打gyangreionwasobservedgt-mltunderthesereoicroscoeitschiefmorhoocharacterisicsare:thebasisp,pgycaituliishexaonal化eanalrooveisbehindtheanusEesisresentheshaepg,g,yp,poftt.heararocinmalesisfalciformpp2--.Afteramlificatio打clo打i打andseuenci打theITS1andCox1seuencesp,,gqgqofthetickfromthegoatinhunanhengyangareaareveri打ed;thealignme打twithuencet-theseqintheGe打良ankdaabaseshow:thehomologybetweentheITS1and-D8395522is100%thehomolobetweentheCox1andJ737085is99..3%Q,gyQ3.thebacteriacarriedbyRhipicephalushaemaphysaloidesareanalyzedwithPC民-uencesDGGE化eresultsshow化at化eseinnineclearlstrie,qypresectivelarere.latedtoCoxiellaCoxiellasPseudomonasenusseuspyp,gPdomona{sp.)Bacillusgenera{Bacillussp.)^Staphylococcusaureus,Staphylococcussp.,?別足om幻,Symbioticbaderiaandthesoilbac化dal.2strainsbaderiaisolatediinthispaperareStaphylococcussimulansandbaclluscereus.-Kerds-wo:RhiicehalushaemahsaoidesIT1ox1DGGEpppylS;C;y;II 目录目录一第章文献综述11.1婢虫的形态学鉴定及其相关方法21.2婢虫的分子生物学鉴定方法31.23.1核酸序列分析技术第二章婢的形态学和分子生物学鉴定626.1材料与方法2.1.1材料62.1.2方法72.2结果与分析112.2.1待检婢的形态结构112--.2.2待检婢ITS1和Cox1克隆、测序152.2.3衡阳地区嫌形扇头婢的分布202.3讨论22第H章嫌形扇头婢带菌情况分析24324.1材料与方法3.1.1材料243.22日.1方法3.2结果分析273.2.1细菌16SrDNAVs区扩增27III 湖南农业大学硕±学位论文3.2.2DGGE检测结果283.2.3优势条带的测序和比对结果293.2.4细菌的分离鉴定293.3讨论30结论32参考文献33致谢39作者简介40IV 第一章文献综述第一章文献综述IW婢又名扁或,属节肢动物口、蛛形纲、婢蝴亚纲、婢、草爬子、狗豆子W一一。蝴目,是类W吸血为生的体外寄生虫婢类个生命周期包括卵、幼婢、一若碑和成婢四个阶段,除卵其外,其他各阶段的进步发育均需吸化、获取营养。一W19世纪之前,学术界对魄系统分类意见不太致,1952年,Bakar和Wh一arron将婢类提升为婢峨目中的个亚目(Ixodkies),根据成虫躯体背面有无Wl壳质化盾板,婢类分为软蜡科和硬婢科。2009年,Krantz和Water发表的《A7tlofAcaroo。,Manuallgy》将婢定为婢蜡总目婢婢亚目W下的分类阶兀学者基一本同意设立个婢总科Ixodoidea,下分硬碑科Ixodidae,软婢科Argasidae及纳W婢科Nuttalliellidae等3个科。在软婢科和纳婢科下分属,但硬婢科下又设亚一科阶元。硬婢总科W下的分类系统,学术界至今没有统定论,但对主要各属的分类意见渐趋一致。M已知全球有魄计899多种,且硬蜡占最大多数。硬婢科包括12属共约W一t700种软婢科包括4属共约100种纳婢科种类最少,属;;目前只记录了一tW种,,,。我国幅员迁阔,自然条件复杂种类较多解放前共记录婢类41种但实际只有31种,而且有的种是否分布在我国尚为未知。解放后婢类调查工作12[]26亚10成绩显著,现己确定9,,:我国有蜡共11种分属于科科属其中血u一ti,约25种,牛婢属种最少,只有种婢属种类最多。tW软碑属多寄生于鸟巢和人类房屋的缝、野生动物的生活的巢穴中;硬峭大多寄生在类似于荒原、草场、热带雨林W及灌木化林的开阔自然界环境tW自然界中,能捕食婢类的动物很多,例如:家禽、嘶踢或蜘蛛。魄对人类和动物既有直接危害,也有产生间接危害,。两种危害相比间接危害一 ̄■传播多种人和动物传染病的危害更大婢类叮咬宿主、吸取血液将致宿主贫血,可引起动物、痒痛、消瘦、麻蒋和皮炎等直接危害数量巨大时;一动物死亡无论是宿主婢还是多宿主魄,不同阶段都会更换宿主,这很容tW易造成人畜共患病在宿主间扩散,因为它们是自然界中第二大可携带病原微PW生物的传染媒介,能携带包括病毒、螺旋体、立克次体、细菌和原虫等病原1 湖南农业大学硕±学位论文,传播着森林脑炎微生物。我国分布有H十种具有公共卫生意义的啤、新疆出血热、脾媒回归热、莱姆病、Q热、北亚蛛传立克次体病、细菌性疾病、无形体病、红肉过敏症、己贝西虫病、泰勒虫病和边虫病等人、兽疾病,造成损失1P1难预算。1995年联合国粮农调查显示世界上有4/5的牛被牌侵袭过,给裔牧业每年造成的损失大约70亿美金近年,蜡类在我国危害有加大的趋势,stt尤其是发热血小板减少综合征(SFTS,everfeverwhhhrombocyopeniasndrome)在很多地区造成了恐慌,据国家疫病检测报告显示2012年1月至y,2012FTS病12113年月,在河南信阳S例25例,死亡8例。江苏省、湖北省、psi迂宁省、安徽省、山东省、云南省等地也时有发生。婢类成虫在不同动物体表的聚集部位不同,例如:在水牛,主要寄生在水牛的耳壳内缘,少量见于颈部、脸部、阴囊基部、耳壳外颈、尾根或者股内侧腹下出等处在黄牛,主要寄生于其腹下、股内侧、颈部、耳廓处;在犬,7P'主要发现于头部和耳壳内部在猪和山羊主要寄生于耳壳。;8-29Pl镶形扇头婢是南亚地区的常见婢种,从文献看中国西藏、贵州、河北、河南、江苏、安徽、江西、湖北、广东、广西、福建、云南等省、迂宁、浙江PW都有鎌形扇头魄分布,台湾地区也有发现。但迄今尚无湖南地区存在嫌形扇头婢的记录和报道,本人在长沙地区的犬体表和衡阳地区的山羊体表发现了、经鉴定为鎌形扇头碑。PU鎌形扇头蜡侵袭的对象有哺乳动物、鸟类、爬行类和两栖类等多类动物,可传播双芽己贝斯虫病、环形泰勒虫病和边虫病等我国对婢类鉴定研究比较薄弱尤其最近30年几乎处于停滞状态,对记PW一录的婢种分子标记序列更少,送情况严重制约着婢分子生物学鉴定的发展。本研究将形态学鉴定和分子生物学鉴定结果相互论证,使得银形扇头婢的鉴定结果更为可靠。11.婢虫的形态学鉴定及其相关方法1国内对嫌形扇头婢鉴定研究比较薄弱,可鉴资料较少:978年版科学出版社出版的《中国经济昆虫志》第35册对嫌形扇头魄的绘图不甚精确,且只画出SP1鎌形扇头婢部分器官的特征,这不利于我们准确的去鉴定鎌形扇头婢。福建林开铅等发表的《福建省鎌形扇头婢的扫描电镜观察》中利用电子显微镜把嫌形扇头婢的化区小孔数、气口板杯状突数、哈氏器囊孔裂隙等进行了细致的观察,2 第一章文献综述让人们更直观的了解了嫌形扇头婢的细致结构,但是婢类鉴定资料并非基于超微结构,且很多实验室条件有限,不具备电子显微镜,故其参考意义不大体视显微镜及照相系统是在普通解剖镜基础上加配配高分辨率的摄像头而成,可W对蜡虫进行显微放大观察、照相体视显微镜观察蜡经济、实用,相片比插图更直观、准确。1.2魄虫的分子生物学鉴定方法11.2.核酸序列分析技术1.2丄1核糖体rDNA内转录间隔区基因PSDNA内1核糖体r转录间隔区基因,其具有足够的遗传信息优势、序列长度适中、两端的序列保守、设计引物扩增方便、进化速度快、种间变异大而种内pgi变异小、多拷贝髙度相似等优势。所W,核糖体内转录基因序列被广泛的用。-1于婢种间分类研究通过测序,L.Ch扣mia等人发现硬蜗种内序列差异在0.5%2-25---(IT12之间,种间差异在.2%之间S与ITS结果分别是3.821.9%和40[]2-25--.2%)DtI1ITS.0。.marginaus等人对四个不同地理种群间TS、2序列差异["]--.7101..marrem等人来鉴别热带区1分别为0.4%、.92%。M.t5个花蜡种选用42][---的是ITS2序列。15种热带区花婢的ITS2序列长度都在9561207bp之间,1--.528IT种间差异在.8%之间。张艳艳等人分析四种璃眼蜡利用S2序列,其中盾糖璃眼婢和残缘璃眼婢,亚东璃眼婢和亚洲璃眼婢指名亚种处在两个分支上,W其同源性达到99%。1.2丄2线粒体瓜NA与rRNA编码2个rRNA与rDNA均存在于线粒体DNA中,种间关系和发生学方面的分析主要使用rDNA中的12S、16S片段12SrDNA片段被Humair等人47tl用之鉴定镜子硬婢种间的亲缘关系。吕继洲等经过测序比对,发现亚洲璃眼婢16SrRNAenBank16SrRNA、小亚璃眼婢样本序列与G中已知相应婢虫序列48RNA[1聚类,和残缘璃眼蜡之间基于16Sr序列的K2P遗传距离均为8%左右。Beati等用12srDNA序列结合63种形态特点来分析属于7个属的36种硬婢,测定扇头碑属各种和扇头蜡与牛婢属之间的系统关系。高东亚等人使用12srDNA、16srDNA等片段准确地鉴定了铃头血婢和褐黄血婢这两种形态学特征非常相近的碑种,,送两种婢进行同源性分析显示铃头血婢和褐黄血婢同源性分别为tW90.4%、90.8%,这充分显示了此技术的实用性。为了鉴定在河南、湖北两地3 湖南农业大学硕±学位论文收集的婢,覃新程等人将12SrDNA片段和形态学相结合,其分子生物学鉴定结s一tw果与形态学鉴定结果致,与微小扇头婢和长角血牌聚类。12.丄3细胞色素氧化酶基因技术在研究鉴定亲缘关系较近的婢种,因为细胞色素氧化酶基因进化速度快,所5-315[o---W常将细胞色素氧化酶基因(CI、CoII、Co曲)与其他基因相结合1为了区别昆±竺全环硬婢的地理种型-I,Simon等人通过分析硬婢种内Co的差SWf-异,最终发现硬牌种内Co1差异性小于化86%。为了比较长角血魄与嗜群血婢是血婢属中亲缘关系较近的2个有效种,支持传统形态学的分类地位,古小彬o----等人比较其CI和CoII基因序列,长角血婢与嗜群血蜗CoI和CoII基因序口5]列相似性分别为89.0%和88。.4%12.丄4变性梯度凝胶电泳DGGE变性梯度凝胶电泳(denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)创立于pel一twi1,983年是种目前用于研究微生物群落结构的主要分子生物学方法。变性梯度凝胶电泳的原理是基于16SrRNA或18SrRNA等基因片段序列具有多样性。在梯度变性剂的影响下,巧螺旋结构解开但不完全分离,不同序列的DNA片段在凝胶的不同位置形成特异性的泳带,从而达到分离不同DNA的目的。而’‘‘。5端连接上30b-50bGC夹子(GC-cDNA在引物pp的lamp),可使双螺旋分子在电泳时更好的分离。根据不同细菌泳带的位置、数目、丰度,可W判断微生58'59]t物种类多少、构成比例等信息。ttWPCR-DG畑技术己广泛应用环境微生物气食品等领域的菌群结构分析,e-但用来分析婢的带菌情况则很少。GubblsMJ等将DGGE与semiquantitativeRLB结合研究婢(寄生于环形泰勒虫患牛)体内环形泰勒虫的种群结构,证明wiiC-宿主可能将特殊基因型的环形泰勒虫传递给碑laudia等利用PCRDGGE对;wit镜子硬婢全蜗检测,发现篤子硬蜗体内存在立克次氏体、己尔通氏体属Bartonella、包柔氏螺旋体、血己通氏体属Haemobartonella、葡萄球苗属()口taphylococcus、红球菌属Rhodococcus、假单胞菌属Ps州domonassp、莫拉)()()菌属Moraxella似及共生菌柯克斯氏体属和立克次氏体属等多种菌属;Overbeek(LtW等证明不同地区镜子硬婢体内细菌种群结构不同;TvetenAK等检测到篇子sma硬婢体内除了己报道的常见病原外还存在螺原体(piroplas),并首次发现65a[]Segniliprusruosus感染镜子硬婢的情况。g分析婢类的带菌情况对研究婢类生理和婢传病具有重要意义,因为峭携带4 第一章文献综述66一一[1有多种微生物,其中些对人和动物具有致病性,另些则与婢有共生关系其中消化系中的共生菌能产生多种活性物质,如维生素和其他营养物质,这些对婢类生长发育具有重要贡献;婢消化道的正常菌群结构对抵御外来菌侵入与定殖67[]至关重要。病原生物在吸血过程中进入蜡类消化系,繁殖、发育后,从中肠--转移至唾液腺,随唾液注入宿主,故消化系是病原传播媒介宿主三者的关键接触点,中肠内微生物研究具有公共卫生意义。至于其他部位的细菌及其意义则因缺少资料尚难定论。 湖南农业大学硕±学位论文第二章蜡的形态学和分子生物学鉴定为确定采自湖南省衡阳地区山羊体表雌雄成婢,本研究采取形态学方法和分子生物学方法结合策略进行鉴定。ITS-婢的形态学观察借助体视显微镜进行。婢的分子生物学鉴定通过1和--Cox1ITSlIntemalTranscribedSacers打S基因片段分析实现。(p,)是不成熟核糖-体,Cox1是细胞色素氧化酶的基因。由于这两个基因分别在不同寄生虫虫属和属种间具有明显的差异性,被广泛用来鉴定寄生虫种属和同种属的亲缘关系远近-分析,但存储了大量的遗传信息。另外,Cox1细胞色素氧。虽然基因长度较短化酶基因由于在进化的过程中容易出现变异,导致该基因呈多样性,因此适合用一-1-1物种的亲缘关系,于鉴定同。本研究通过对ITS和Cox基因分析设计特异性引物用于鉴定嫌形扇头魄,为嫌形扇头婢的鉴定研究提供材料。2.1材解与方法2丄1材料2丄1.1待检婢实验用牌来自衡阳市毛个县21个乡镇的山羊体表。1)主要试剂(①柱式PC民产物纯化试剂盒:天恩泽生物工程公司;PMDT试剂念②18;大连宝生物科技有限公司;:TaqDNA聚合酶、Min旧ESTPIasmidPurificationKit:大连宝生物公司③酶;④K蛋白酶:Merk公司;TDNA连接酶;Promea⑤4g公司;lO感受态细胞:大连宝生物科技有限公司⑥Top;口)主要仪器tam2306①体视显微镜(Moic):麦克奥迪实业集团有限公司;一-6C②电泳系统(DYY:北京六实验仪器有限公司);:Tanon公司③凝胶成象系统;④高速台式离也机(LEGENDMICR017):Thermo科学仪器厂;6 第二章轉的形态学和分子生物学鉴定BCD-254I⑤恒温冷藏箱(:德国SMENS股份有限公司);⑧梯度PC民扩增仪(2720ThermalCycler):AppliedBiosystems公司;⑦恒温隔水培养箱:湖北恒丰实验医疗器械公司;⑨紫外透射仪:广州深华生科公司;⑨超净工作台:AIRTECH实验设备有限公司;⑩微量取液器:上海DRAGON科学仪器有限公司;2.1.2方法2丄2.1待检婢的形态学鉴定取新采的活婢W70%的酒精洗洛干净,于体视显微镜下观察体表的各器官、结构,并拍照。2丄2.2待检碑的分子生物学鉴定enBankS--基于G中鎌形扇头婢IT1和Cox1两基因序列(KW58385、-0835%IT-KM),WDNAMAN软件设计S1和Cox1扩增引物,由博尚生物科-技公司合成。引物信息见表21;表2-1ITS-和C-11ox扩増引物及其信息-foTabiifhiihaluidhhdle21InrmatonfsictoRceshaemahsaloesaemalidbaseopecpppypysaoesonITS--1andCox1’名称序列信息产物长度退火溢度CITS-ITCATAAGCTCGCGTTGATTf1774bp52ITS-1rAGCTGGCTGCGTTCTTCATCox-IGGAACAATATATTTAATTTTTGGf755bp53Cox-1rggctcttttttacctgtattataaclDNA提取()①取饱血雌成魄3只,用70%酒精洗緣,滤纸吸取银形扇头碑体表残余酒.,,研磨成粉末状5mrin精加入液氮;加入SDS裂解液0^4000;放入研体p5mn,取上清。离也i°②加卽L蛋白酶K,于56C水浴中作用化,12000rpm离也3min;移上清液至离也管,加入等体积的酶,振荡混合成乳状,12000rpm离也Imin。一⑤将上层水相层移至另只洁净的离瓜管加入等体积的氯仿/异戊醇溶液,;一、混匀12000rpm离必Imin将样液上层水相转移到另洁净离也,加入上层;管7 湖南农业大学硕±学位论文2.50.1体积的乙酸钢溶液(3mol/LH52水相液倍体积的无水乙醇和,p.),上°4-52000m下轻缓颠倒离也管次,使溶液充分混匀C,1rlOmin,;4p离也弃上清液。④加入原始样品2倍体积预冷的70%乙醇至试管中,离也12000rpm,离也5min,弃上清液。5一⑤室温放置1min,待样液中的艺醇完全挥发,最后加入定体积的TE溶液或双蒸水重新溶解使DNA沉淀。2ITS-1Cox-()和1扩增一L-2洁净的〇.5i试管,按表2依次加入各试剂,制备反应体系15iL。①取^^表2-2PC民反应体系Table2-2PreparationofPCRreactionsystem试剂体积HL化9酶0.30buffer1.50dNTP0.80T--ISI或Cox.fIf)030(打--0S.301r或Cox1r)(DNA模板0.50ddH2〇补至15②按下列程序进行PC民扩增:"94C预变性5min""94C变性1min°^35个循环53C退火30s°721.4一C延伸5min/5s°72C延伸7mmPC民6.(L.5产物,加至%琼脂糖凝胶点样孔中,于120V下电泳③取上述V120min〇④借助凝胶成像系统观察、拍照。3PC民产物纯化()天恩泽公司的柱式DNA胶回收试剂盒回收PC民产物扩增电泳,具体操作方8 第二章婢的形态学和分子生物学鉴定法和步骤见下:一新的①将胶方至紫外透视仪下,用刀片切取含有目的条带,放入ImL离也管内。,称重°R3-5ffer②向PC反应管中加倍体积的Bindingbu,混匀50C水浴,溶胶液,10min。,室温下静置3mm,12000rmmin,③移至离也吸附柱,套上液体收集管p离也I弃废液。④加入0.8mL洗柱液,室温静置2min,12(K)0rpm离也Imin,弃废液。一⑤将离必柱装入洁净塑料离必管,加入100[iL通用洗脱液,室温静置3mm,12000rpm离也Imin。°-⑧洗脱液,于20C保存。4-1ox-1TA打S和C:()与克隆载体连接—一①取洁净的1.5m旧P,按下表配制反应体系管。表2-3TA克隆连接体系T2-3SabIeystemfor化evigation试剂体积HLMD⑥-1TVecr1.p9to0ITS-1C-150或ox片段0.加H203.50So山tionI5.0②混匀°,16C下连接过夜。例转化MD--①取p19TITS(或MD19TCoxl)连接液5.0,加入lOO^LToplO感p阵,受态细胞,冰浴30min期间数次摇动离也管。°立即插入42s②取出离必管,C温水中90。,解育°2mhL的LB37③取出离必管,插入i入80(i,C冰水中;加H液体培养基于进行振摇ISOrpm培养30min。④取出培养液,4500rpm离也5min,弃上清液。⑤加入10011^1^6培养液菌滴管反复吹打,使之成为悬液。^,^灭⑥取悬液0.5ml,滴于含氨节霉素的LB固体培养板上,用L型涂布棒将菌°液涂布均匀,倒置平放,37C培养箱内培养16h。9 湖南农业大学硕±学位论文佑)培养°LB培养C、培24hLB5①挑取白色菌落,接种于液,37养。取培养液.0mL,12000rpm离也5min,弃上清液。天恩泽试剂盒提取质粒,过程如下:②将溶液A液与RNaseA溶液混匀。25③移上述溶液(HiL至细菌沉淀,W吸头反复吹打,使沉淀完全悬浮。加入25(HiL溶液B,颠倒混匀直至溶液变粘;冰浴,静置5mm。④加入溶液C350叫颠倒混匀5次,见到白色沉淀物产生后,置于冰面操作台上5min。°⑤4C下,12000rpm离也5min;将上清液转移到离也吸附柱静置5min。在室温下,12,000rpm离也Imin,弃废液。50011^的通用洗柱液11@加入,室温,12000巧〇111加^,离也弃废液。⑦重复第6,12000rm离必Imin,。步。室温,p弃废液(TCDNA,⑨将离也吸附柱放入大号塑料离也管中,加入10〇nL8的洗脱液室温,放置2inin。12,000巧m离必Imin,离也管底部即质粒DNA。(7)鉴定---①取质粒PMD19TITS1或pMD19TCoxl,表24中的引物进行扩增,扩增产物电泳。表2-4ITS-1和Cox-1扩增引物及其信息T-I--iR.hiddondabIe24nfbrmationofsecficoaemahsaloesbaseITS1anCox1ptpy名称序列信息退火温度’cM13fcgccagggttttcccagtcacgac55M13ragcggataacaatttcacacagga12.2参数扩增。扩增产物于1.5②按..2琼脂糖凝胶电泳。有预计大小扩增片段者视为阳性。8测序及序列分析()MD19T-ITS1和pMD-oxl①取经鉴定为阳性的质粒P19TC各10叫送往华大基因公司进行测序。②下载Genbank的其他扇头婢的基因序歹!J,用DNAStar软件中Megalin程序对序列进行同源性分析。2丄2.3衡阳地区嫌形扇头婢的分布调查衡阳地区下辖7个县、市,21个乡镇。为了确保调查不发生遗漏,本研究10 第二章碑的形态学和分子生物学鉴定,每乡选3个村,每村查3只羊。2.2结果与分析2.21.待检蜗的形态结构21.2丄嫌形扇头婢雌虫雌成婢假头短;假头基背观六角形,宽约为长的2.2倍。侧沟明显,有零散。粗刻点联串,末端延至眼后孔区呈直立卵形,间距约为短径的1.5倍。口下短--,21。板,齿式3I3每纵列约1011枚。见图違誦图2-1雌蜡的假头和假头基F-1easeig2falsehdand杞Iheadoffemaleticks雌成碑盾板卵圆形一眼点呈长卵,,长略胜于宽后缘圆铺。盾板两侧各有,-2圆形。见图2。图2-2雌蜗盾板、眼点F2-2Femaeaeeessilticksshieldltotg,ypp雌成婢肛沟位于肛口之后,具肛后中沟。后端有缘巧11个,且十分明显。2-见图3。11 湖南农业大学硕壬学位论文 ̄岡哪图2-3雌蜗的化沟和缘操F2-landcrFemaeknaldndcrig3Femaleticksanadi化hiblticsai化haib-雌成婢足粗细均匀,v有短粗外距。基节I外距直较内距稍短。基节iii,一-iv按节序渐小后内角均扁锐,。谢节n腹面末端有略微的尖齿亚末端具短;小的纯齿2-4。。爪垫中等大小。见图图2-4雌婢的内距F-4Femaecrvlig2ltikintea。帷成碑气口板短逗点形,长大于宽(包括背突),背突短粗,末端几乎平纯-5见图2。,图2-5雌蜗的气板F2-li5Feeticksaslaegmagpt2.2丄2嫌形扇头婢雄虫12 '第二章婢的形态学和分子生物学鉴定,,,雄成婢假头基呈六角形宽约为长的2.2倍侧角明显约位于前1/3的水-,末端稍尖2。平基突相当粗大。见图6;图2-6雄蜗的假头基F2-Maecsseig6ltikofba一雄成婢盾板卵圆形,长略胜于宽,后缘圆纯。盾板两侧各有卵圆形眼点,-7略微凸起。见图2。2-7雄蜡的盾板图、眼点-MaFi2leticktt.7sshieldplaeeesog,yp,。雄成碑侧沟窄而深,有粗刻点联串自眼后延伸后中沟前前窄后宽,约为1/3盾板长的,末端伸达当中的缘煤。后侧沟短,呈不规则的H角形。内缘中部2-8强度凹入,其下方凸角明显;后缘与外缘略直或微弯。见图。13 湖南农业大学硕±学位论文■隆一一图2-8雄蜗的阻沟和缘巧-Fi28Maleanalditchandedetkscribggic足粗细均匀。基节I外距较内距短。基节II、III外距短粗;后内角扁锐。基一-节IV外距和内距均短。附节IIIV腹面末端和亚末端各具齿突。爪垫约及爪长2-之半。见图9。'’豚.渐化始切.满::Mm图2-9雄蜗的内距F2-Mlig9aetickin化rval气口板水滴形,,,长大于宽(包括背突)背突短粗末端几乎平纯。见图2-10。戀>^雜2-图10雄婢的气板F2-10Maeeiglticksaslatgp14 第二章婢的形态学和分子生物学鉴定由雌雄成婢假头基六边形可肯定:待检婢属扇头婢属。由雄婢肛侧板呈鎌刀形可W确定:待检婢属扇头婢属待检碑应为嫌形扇头婢。--2..22待检蜗ITS1和Cox1克隆、测序22打S--11..2.1待检婢和Gox的扩增打S--W特异性引物扩增,1和Cox1750b产生片段,产物大小分别为p和一2000b-与预计大小。详见图211。p,致Mai2CKX}^i画^Hg ̄ ̄I贿0—1000 ̄750>-^7S〇OO-^HS500-^^m250^2-^50-!00>-n>1002-图11采集蜡虫的ITS!和Coxl基因扩増结果-F.211ICT1iollec1:edticksofIS1andCoxeneamlificatio打resultsggp注:a为ITSl基因PCR产物电泳图,b为Coxl基因PC民产物电泳图Note,:aenefbrelectrohoresisITSlofPCRroductsbisCoxleneelectrohoresisofPC民roductsgppgpp--2.oxl.2.22待检婢ITSl和G的克隆-ox-,培养后分别将ITS1和C1与T载体连接产物转化巧10,长出大量;白色菌落-。,挑取白色菌落进行PCR鉴定。结果见图212MaMb2—^CXM}--JhIII呼—>5觀sm,阮'-n?*-250250^I--MD-图212MD19TITSl和19TCoxl质粒电泳图pp"F2-12MD1T-ITl-Clresi9SandMD19Toxlasmidselectrohoisgpppp-泳图-;aMD1oxMD注为p9TCl质粒电,b为p19TITSI粒电泳图Nob--:alasmidforMD19TCoxlelectrohoresisbisMD19TITSlrainelectrohoresis,ppppgp15 湖南农业大学硕±学位论文IT--211.22.3S和Cos基因测1序结果--经测定,打S1序列长度为1774bp;Cox1基因序列长度为75化P。-ITS1测序结果:102030405060TCATAAGCTCGCGTTGATTGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT708090100110120AAGTACATGCCGAAATAAGGCGAAACCGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTT017013014015016180AGATCGTTTCTTCCTACTTGGATAACTGTGGCAATTCTAGAGCTAATACATGCAGTGAGC190200210220230240CTGGAGCCCTTTGGGTAACGGGTGCTTTTATTAGACCAAGATCGATCGGGTTTCGGCCCG250260270280290300TATTGTGTGGTGACTCTGGATAACTTTGTGCTGATCGCATGGCCACGAGCCGGCGACGTT310320330340350360TCTTTCAAGTGTCTGCCTTATCAACTTTCGATGGTAGGTTACTTGCTTACCATGGTTGTT370380390400410420ACGGGTAACGGAGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACA430440450460470480TCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAA490500510520530540AAATAACAATACGGGACTCTTTTGAGGCCCCGTAATTGAAATGAGTACACTCTAAATCCT550560570580590600TTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCA610620630640650660ATAGCGTATACTAAAGCTGCTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTCAGTTCCAGACG670680690700710720AGTAGTGCATCTACCCGATGCGACGGCTCGGACTGAACATCATGCCGGTTCTTTCTTGGT730740750760770780GCACTTCATTGTGTGCCTCGAGATGGCCGGTGCTTTT八CTTTGAAAAAATTAGAGTGCTC790800810820830840AACGCAGGCGAGTCGCCTGAATAAACTTGCATGGAATAATAGAACAAGACCTCGTTTCTG16 第二章蜡的形态学和分子生物学舊定850860870880890900TTCTGTTGGTTTTTGGAATACGAGGTAATGATTAAGAGGGACGGACGGGGGCATTCGTAT910920930940950960TGCGGCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGACCGTCGCAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTG970980990100010101020CCAAGAATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCG300401050106010701080101CCCTAGTTCTGACCATAAACGATGCCAACCAGCGATCCGCCTGAGTTACTCAAATGACTC002030401090110111111111GGCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTATTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGC110011501601170180119012TGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTG223040250260110122011211ACTCAACACGGGAAAACTTACCCGGCCCGGACACTGGGAGGATCGACAGATTGAGAGCTC112701280129013001310320TTTCTTGATTCGGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTG600380133013401350131371GTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTAGCCTATTAAATAGGTGCGGGGTTCCCAGCACC113904001410142014301440TTACAACCTTCTTAGAGGGACAAGCGGCTCCTAGCCGCACGAAACAGAGCAATAACAGGT145014601470148014901500CTGTGATGCCCTTAGATGTCCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAAGCAGCGTGTC400601510152015301515515TTTATCCCTGTCTGAAAAGACTGGGTAACCCGTGGAACTTCTTTCGTGATTGGGATAGGG115701580159016001601620GCTTGCAATTGTTCCCCTTGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGCGTI63016401650166016701680TGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGATTTAG111690170017101720730740TGAGGTCTTCGGACCGATGTCCGGCGCGGCCTTTCGGTTGCGCCGGTCTGTTGGAAAGAT11750176017701780I79080017 湖南农业大学硕-±学位论文GACCAAACTTGATGAATGAAGAACGCAGCCAGCTCox-1测序结果:102030405060GGAACAATATATTTAATTTTTGGGGCATGATCCGGAATATTAGGGTTAAGAATAAGAATA708090100110120CTAATCCGAATAGAACTAGGGCAACCTGGAACTTTAATTGGTAACGATCAAATTTACAAT130140150160170180GTAATTGTAACAGCCCACGCATTTATTATAATTTTTTTTATAGTTATACCAATCATAATC902002102202302401GGAGGGTTTGGAAACTGATTAGTCCCCATTATGTTAGGTGCACCAGATATAGCATTTCCA250260270280290300CGAATAAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCTCCTTCATTATTTATATTAATTAATTCT310320330340350360TCATTAGTTGAATCAGGAGCTGGAACGGGATGGACAGTTTATCCTCCTCTATCTTCTAAC370380390400410420CTATCCCACTACGGACCTTCTGTAGATTTAGCCATTTTCTCTCTTCATTTAGCCGGAGCA430440450460470480TCTTCAATTTTAGGTGCAATTAATTTTATTACTACCATCATTAATATACGATCTATTGGT490500510520530540ATAACAATAGAACGAATACCTCTATTTGTTTGATCAGTTTTAATTACCGCTATTTTATTA550560570580590600CTTTTATCTCTTCCTGTACTTGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACAGATCGAAATTTC106206306406506606AATACCTCATTTTTTGATCCTTCTGGAGGAGGAGACCCAATTTTATATCAACATTTATTT670680690700710720TGATTTTTCGGTCACCCTGAAGTATACATTTTAATTTTACCAGGATTTGGTATAATTTCT730740750760770780CAAATTATTTGTTATAATACAGGTAAAAAAGAGCC22--IT1ox1.2..4待检婢S及C基因同源性分析IT-本研究测出的S1基因序列与Genbank内所登录的鎌形扇头婢(登录号为DQ839552巧同源性为100%;囊形扇头婢(登录号为AJ003816);血红扇头峭18 第二章婢的形态学和分子生物学鉴定(登录号为AJ003815LX987497L76342)图兰扇头婢(登录号为KF958447,,,;95845299%左右I-KF958451,KF)的同源性均为。待检婢TS1序列与本属其他--12脾ITS序列比较结果如图13。1PercentIdentity_12345巧7巧9IIIII!I!II寒贾度卒舜99.999.999.999.999.999.999.31|防.2Q,.O99.999.999.899.899.899.72I纖S|滋树刪00999993kss30.1100.100.0100.010.0..8巧刪!!農患杂親§40.10.10.0m100.0100.0100.099.999.84星桌惠某巧54S5q.,j50.10.1日.00.0日日.0100.0白9.999.85k巧姐巧冲,B非桌帛洁該!壓坛0.....呈巧S某銳.10.2000000Ml品^9999986!晦I99自:??58巧.,70.10.20.00.00.00'0■I.999.371立度头兹[|80.10.20.10.10.10.10.199.88;丘註哀头5,赛fiXS7437l90.20.30.20.20.20.20.20.2Bn&丘包磨其該山s泌|—13456783jII2II[2--图13ITSI序列与其他蜗种的序列同源性分析F--mai213ITS1seuenceanauench化tieciesgqlysisofseqeomologyW她0ercksppCox-本研究测出的1(序列号KM083593)的序列与Genbank内登录的扇头(碑的序列进行比对分析,发现所采集的婢种序列信息与嫌形扇头婢JQ737085)的同源性为99.3%,而与短小扇头婢(AY008684,HM19%77,HM19%78),血红扇头婢(JQ737084,KF200112,KF200113,KF437543),图兰扇头婢(JQ737086,KM235717,KM235718,KM235719)等其他扇头婢种的同源性在--86.41。.7%89%之间。表明ITS基因在扇头峭属内相对保守P斜说能松够—'^2345J91Qj11i1213''[‘辆4312Ckm3互刊?:1巧7Sg〇S14召1351I弓38911縣5滅51愛莫庶黑該.2,^1—三J:’:203m991狗巧?90?削989cT2疼黒煮崇臻ckm王巧7巧" ̄ ̄.'’15■■^§4鼓3而4§0本而40?!99D3孤5削各縣a絲24犀当运其諮(km三巧?巧:,100吞的9I呂9谷5‘g化.5HII縣名淵也8贫?訓865.5立替方茄综;片《1三7乂立:^.'!" ̄ ̄t式—心,——……聋L…§6l〇39i024苗自六三WL。:,T7BT骑孩矿航担注房去詰〔KF.I?_H1西7!¥^…^-章—*眷'导苗日.2而8;>品;:致?言早’安?:7^^己立窝把該:苗門放担t:."‘'*辩‘SS6S-8,05.80.305038T54獄1良呑88赛68丘若:度其該好ii3:.I119重互的?巧1991-一料巧3巧?>.18W21391401341393?客。8619巧户垣其該:;‘'’—一….… ̄而巧而互^马r皆而而而而而。■B取而Tf而巧旁茜該:恍-化巧巧受巳." ̄ ̄’’'?-:,li:T1ri化〇^做巧^IJ专§.奪1攝T复e34存玄洁nFiTe留PBfsiT运户璋争姨'uT2i巧2V,S7314613;7请51车348旅涼誠近了',>>[;与卸'麵:—査蚕互;1"t《131Z邑—120.712每tsa本847U3S614D巧4化713者寅绘字魏編觀挽3X:;^:HH_^J<图2-14Cox-1序列与其他赠种的序列同源性分析F--cemowoercsecesi214Cox1analysisofsequenhologyiththtikpig22rrS--.2..5lCoxl基因系统进化树分析,91 湖南农业大学硕±学位论文-W灯S1基因序列为基点,绘制进化树如图。本实验所采集的嫌形扇头婢的基因序列与登录号为DQ839552的亲缘关系最近,与种间的图兰扇头婢、囊性扇头牌、血红扇头婢差异也很小。.云安兹?另,II巧巧妄头级DQE巧巧2L;__.'-—vvvvvwvvv、—…通了—星吉.;烹妾漁!—星iMI悄空M巧扭I2签旱羣爭譚辦巧担巧.,!SiS-'ift击S■tiTVOaS*ci1i左包B其AX£巧i:i[邱^-互US其試哪識巧.,直扛哀其襄;_175542:,■I0Nucleotide如bstitutiofis3d如()2-IT-图15S1序列与其他蜡种的进化树分析--Fi.215ITS1seuencew0riecesloangqith也etckspihen幻icalsispygyox-WC1基因序列为基点,绘制进化树如图。本实验所采集的嫌形扇头牌-1基因的进化树显示737085Cox,本实验所采集的嫌形扇头婢与登录号为JQ的鎌形扇头婢亲缘关系较近,,而与其他种的扇头婢亲缘关系较远具有明显的分支。CKM2357i7:?'一、f!T山*占isI"■,,,w?I。>冷巧抓一芒S支、n。:;巧;,S巧乏;I—、.I、<WWVWVI:圍y。—屋嘉獻殘:立泣袁头簽巧躬巧-广C43:^如’巧'L写头怒?Ani!;备一去5,?、?>?-.—..—二.?,一^M只4巧;'L:巧公拓li2:—己达哀其誤刀'。.-?A:-:J.切妨-'^——:空〇:佈11?2口3寅头譯:一.一':、,!*占.-A.W—?.—…'味―*_'、广W広5d巧;,1T,AS3SE.'一一?、一’.,....化汾、l.11.J《K从游' ̄^一玄去运亨巧;村拇55巧3:19.II1I64202--图16Cox1序列与其他魄种的序列进化树分析F--.2161uencewieuencersioeneissigCoxseqththesqsofothetickpecesphyltcanalyig2.2.3衡阳地区编形扇头虫卑的分布2.2.3.1分布调查情况与结果20 第二章婢的形态学和分子生物学鉴定2014年5月,对衡阳地区下辖7个县、市21个乡镇各点山羊进行体表检查,2-5采集婢虫。采样时间、地点和结果如表。结果表明:本次检查的7个县市的21个乡镇的散养山羊身上均发现婢虫寄生。表2-5衡阳地区山羊体表蜗采集情况Ta2-5reonoascbileHenangitkintikthecollectongygg采集地采婢情况采蜡时间县乡总数雄婢雌婢5503218集镇衡南县花桥镇2014.5.1482117254咸塘镇111山都镇161632来阳市大市乡20H.5.43213194南阳镇12615松柏镇341222常宁市塔山乡2014.5.8362214罗桥镇281711粮市镇514]10祁东县洪桥镇2014.5.11472314双桥镇352312向阳镇4332112014.5.1衡阳县H1355405塘镇西渡镇25169营洲镇342311衡山县白果镇2014.5.17281216东湖镇321913城关镇40832衡东县大浦镇2014.5.26281018H321319棒乡2.2.3.2鎌形扇头碑在衡阳地区分布示意图21 湖南农化大学硕±学位论文===将婢带回实验室,形态学法进行鉴定,。体视显微镜下观察似嫌形扇头魄者,视此地有鎌形扇头婢分布:除个别乡外衡阳绝大部分县乡的山羊均有。发现2-1嫌形扇头婢寄生,该碑在衡阳地区的分布如图8。?山"街巧%巧/巧-、'、f。》\狂1—^.V有鎌形扇头婢,市.f和一T2-阳地区分布示意图图18编形扇头轉在衡-Fig.218RhipicephaUisticksdistributiondiagraminHengyang2.3讨论形态学方法和分子生物学方法鉴定表明,采自湖南省衡阳地区山羊体表的大多数待检蜡为嫌形扇头婢。通过体视显微镜观察嫌形扇头婢雄婢与雌婢的假头、假头基、盾板、眼点、肛沟、缘操、内距、气板的形态结构符合《中国经济昆虫志》(1978年版,35册,基本可W确定采自湖南省衡阳地区山羊体表的婢)中嫌形扇头婢的形态特点为鎌形扇头碑。考虑到观察着对肛侧板形态判断的主观性,笔者进行了分子生物学法鉴定。本研究测出的-1enbankITS基因序列与G内所登录的嫌形扇头婢同源性为100%;与种内的囊形扇头婢、血红扇头婢、图兰扇头蜗的同源性均为99%左右。IT-1-1基因的进化树其同源性比较显示,S分子序列种内同源性差异较小。ITS显示,本实验所采集的鎌形扇头婢的基因序列与登录号为DQ839552的亲缘关系TS-最近,与种间的图兰扇头魄、囊性扇头婢、血红扇头婢差异也很小。综上,I1基因相对保守,不适合做婢种间鉴定。-待检婢Cox1序列与Genbank内所登录的扇头婢的序列进行比对分析,发93%,现所采集的婢种序列信息与雜形扇头蜡的同源性为9.而与短小扇头婢、血红扇头牌--、图兰扇头婢等其他扇头脾种的同源性在86.7%89.4%之间。表明Cox122 第二章婢的形态学和分子生物学鉴定一x-1基因在扇头碑种内存在定差异性。Co基因的进化树显示,本实验所采集的德形扇头碑与登录号为JQ737085的嫌形扇头婢亲缘关系较近,而与其他种的扇-1头蜡亲缘关系较远,具有明显的分支,蜡种间的Cox序列差别较大,可。综上适用于种间鉴定。通过对湖南省衡阳地区的山羊体表婢类调查,发现鎌形扇头婢在衡阳地区是普遍存在的,,填补了镶形扇头婢没有在湖南地区分布的空白丰富了文献资料。一本研究形态学鉴定方法借助的体视显微镜价格便宜,般实验室均有配备能力,。体视显微镜可完全满足观察碑体表器官结构的需要借助照相系统拍摄的照片较手绘插图更全面、直观,比用电子显微镜观察更简单、易行,故认为本研究的方法和结果更具参考和利用价值。23 湖南农业大学硕±学位论文第H章编形扇头蜗带菌情况分析变性梯度凝胶电泳(denaturinradientelelectrohoresisDGGE)创立于gggp,一1983年,是种目前用于研究微生物群落结构的主要分子生物学方法W通"6SrRNA18SrRNA-用引物扩增1或,通过带GC夹子(GCclamp)的引物扩增DNAV’1化之3的5端使片段在DG畑时分离更好。在梯度变性剂的影响下,不同序列的DNA片段在凝胶的不同位置形成特异性的泳带,根据泳带的位置、-数目和丰度,获得微生物种类多少DGGE、构成比例等信息。PCR技术已广泛twi应用环境微生物、食品等领域的菌群结构分析,但用来分析婢的带菌情况则很少,本研究拟采用DGGE技术分离、纯化,进而研究雜形扇头婢携带的优势茵种。3.1材料与方法3.1.1材料3丄1.1待检魄本实验用的鎌形扇头婢,来自衡阳市击个县21个乡镇的山羊体表。3丄1.2试剂及仪器W仪器一①恒定电压恒定电流电泳仪:北京六电气公司;一YY-6C②电泳系统(D:北京六实验仪器有限公司;)③凝胶成象设备:Tanon公司;化EGENDMIC民017):Thermo科学仪器厂④高速台式离也机;⑤恒温隔水培养箱:湖北恒丰实验医疗器械公司;⑥超净工作台:A1RTECH实验设备有限公司;⑦微量取液器:上海DRAGON科学仪器有限公司;⑨DGGE变性梯度凝胶电泳仪系统:北京君意东方电泳设备有限公司;倒试剂①Aciylamide:Promega公司;24 第s章巧形扇头婢带菌情况分析②Bisacrylamide:Promega公司;③TEMED:TEMED;:华美生物技术有限公司④过硫酸钱;⑤细菌生化鉴定管:杭州天和微生物试剂有限公司;’’--⑥引物:318F:5ACTCCTACGGGAGGCAGCAG3’’907R--3:5CCGTCAATTCCTTTGAGTTT,34FGC5-1CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGG’GCCTACGGAGGCAGCAG-3’’5--18民:5CCTACGGAGGCAGCAG3⑦其他试剂:见第二章。312..方法3丄2.1婢体内细菌提取取饱血雌性成婢,0s于乃%乙醇浸泡婢9;移至研体中,加液氮,研磨成粉;加无菌生理盐水5(K)|xL,混匀,20〇xg离也Imin,取上层液。3丄2DNA提A.2细菌基因组取试剂盒提取细菌DN①取上述上层液ImL,12000rm离也Imin,弃上清液p;200^缓冲液GA②向沉淀中加入,用移液器吹打使菌体彻底悬浮叫;③向管中加入20以L的蛋白酶K(10mg/mL),颠倒混匀;°④向管中加入220曲缓冲液GB,震荡15WC,70C水浴lOmin,待溶液变清亮后,简短离也;220^⑤向管中加入,充分混匀,简短离也叫无水乙醇;一⑧将溶液和絮状沉淀都转移至个吸附柱CB3中,12000rm离也30sec。p弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中;⑦向吸附柱中加入500阵GD缓冲液,12000rpm离必30sec,弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中;⑨向吸附柱CB3中加入600阵PW漂洗液,12000rpm离也30sec,弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中;⑨重复步骤8;⑩将吸附柱CB3放回收集管中,12000巧m离也2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温数分钟,W彻底瞭干吸附柱材料中残余的漂洗液;25 湖南农业大学硕±学位论文3一⑩将吸附柱CB放入个干净的离必管中,向吸附膜中央部位悬空滴加-TE2-2m50200mm,12000rmin阵洗脱缓冲液,室温放置5p离必,将溶液收集到离必管中;)m离必2min喔将离必得到的溶液再加入吸附柱中,室000r温放置2min,12p,滤出的溶液即细菌基因组DNA,收集到离必管中。3丄2.3细菌基因组DNA16S出NAV3区扩增(1)细菌16SrDNAV2一V4区制备①W样品基因组DNA为扩増模板,W318F和907R为引物,扩增细菌16S出NA。反应体系为20阵:样品DNA叫L、上流弓I物(341F)1曲、下流弓I物°2x巧07民)1、()EsayTaMixture10阵、超纯水7iL。反应程序参数:94C,冲p^°〇‘005mm30sec572.07m.;94C,;61.C,30secC,Msec72.(TC,in4(TC,。;;;循环32次。.5%,电泳条件为80V、100mA、50min琼脂糖凝胶电泳;于凝②产物于1;胶成像系统下观察。2细菌16S瓜NAV3区制备(),341FGC518R①W上述PCR反应体系为扩增模板W和为引物,扩增细菌制备16SrDNAV3区。反应体系为50阵:上述PC民样品DNA2曲;上流引物34^〇1流引物518艮1曲巧]\4^2521。(分阵;下()咕;祖;超纯水阵反应程序参°°°°.:5min;%C,30sec66C,30sec20C12sec72.0C,in数;;7,;7m;°4.0C,循环35次。5,②产物于1.%琼脂糖凝胶电泳电泳条件为:80V、100mA、50min凝;于胶成像系统下观察。3丄2.4细茵16S瓜NAY]片段变形梯度凝胶电泳①取lOOmL小烧杯2只,分别配制30%变性剂胶和60%变性剂胶;其中30%变性剂胶的配制方法如下:尿素2.52g,去离子甲醜胺2.4mL,40%丙赌醜胺3.575mL,50xTAE400_iL20mLTEMED17LAPS,加水定容至,i,10%85阵。||60%变性剂胶配制方法如下:尿素5.04g,去离子甲醜胺4.8mL,40%丙稀醜胺x3.575mL,5〇TAE40(VL,加水定容至20mL,TEMED17|iL,10%APS85|iL。②将島浓度胶和低浓度胶分别倒入左右进胶杯中,打开蠕动累,制备变性梯度胶板;静置20min,令胶凝固。26 第H章潇形扇头婢带菌情况分析⑨将16SrDNAV3区样液加入点样孔;于6(TC,180V,50mA下预电泳15min,再电泳化电泳结束后,将胶剥离、展开、于稀战液(10xL/400mL)20min。|中染色④观察、拍照。3丄2.5切胶回收、克隆和测序,ddH〇洗洛3次,捣碎①切取DGGE凝胶中清晰明显的条带2,加入无菌’生理盐水40iL,4C过夜;|②12000xg离也过夜产物5min,取上清液5阵,W341f和518r为引物,扩增,扩增条件同1.21。.琼脂糖凝胶电泳检测WDNA片段快速纯化/回收试剂;盒回收PC民产物;°-③取回收产物4咕、PMD18T载体1叫So山tionI5阵,16C条件下连接12hr。连接产物转化于EcoDHX-a、.li5a感受态细胞GlIPTG和氨节;涂布于含青霉素的LB固体培养基,37C振荡培养12h。挑选单个白色茵落于含Amp的°LB液体培养基,37C振荡培养12h;④W高纯质粒小提试剂盒提取质粒;取质粒7叫Eco民I、XhoI各liaL°10xHBu抵r2阵,dd&O9mL,37C酶切1h。,有预计大小片段者视为阳性⑤电泳检查。酶切检测阳性质粒送生工生物工程股份有限公司测序。3丄2.6数据处理将所测序列与GenBank登录序列blast,寻找亲缘关系最为相近的菌种及克隆anitOne4.6.2。用Quty对DGGE图谱进行分析。3丄2.7细菌的分离、鉴定1,、无菌水条件下将经^%酒精浸泡消毒的饱血雌成婢研磨液接种于LB°培养平板-72h,30C培养48;2、挑选单菌落,按照《实用临床微生物学检验与图谱》观察细菌形态结构,测定细菌理化特性。3.2结果分析3.2.1细菌16SrDNAV区扩増3一V①细菌1化rDNAV24区制备W318F和907民为引物,扩增婢细菌基因组DNA,产物大小约为600bp,27 湖南农业大学硕±学位论文一-与预计大小致,结果见图31。123^师HP^1胃1甲^PpS^SSRWB1、,2000b。t,—_;以.t;*,[节;f■(!";l〇〇i巧,本产:知?^資縣7巧削-巾,'巧。谢",-I2沒〇(》H1〇〇1>1>騷子H3-116SrDNA一V图蛛细窗V24区扩增片段F-menV一iFaof化e16^化ebacrfrom化ig.31rgtss瓜NA2\4ofteia6tck②细菌16SrDNAV3区制备W341Fgc和518民为引物16SrDNAV200b,扩増制备3区,产物大小约为p,一-与预计大小致,结果见图32。123ii"fs片;Bp麵巧外?,ipSt巧t%巧巧;i^巧*S"咖W'13-2蜗6S图细菌IrDNAV3区扩增结果-2F巧3ramentsofthe16sDNAVof化6bacteriafromthetick咨grs3i.2.2DGGE检巧l吉j果银形扇头婢饱血雌成魄细菌-。16SrDNAV3区片段DGGE结果如图33圓二■二PgY6V7Y8—Y93-316SrD图蜗细菌NAV3区DGGE结果Fi3-3DGGErofiePC民roV1NArrcglsofductsof3of6S瓜ofbacteiafom化etikspp28 第H章鎌形扇头婢带茵情况分析■3.2.3优势条带的测序和比对结果-比对结果如表31所示,9条明显条带的序列与GenBank数据库中某些序列高度相似。3-表1DGGE胶中回收条带序列分析结果Tab-rnale31IdentificationofBacteiaObtainedbySequencinAlsisofDGGEBandsgyBandsAcce%ionNearestmarchIdentityY1KC776318UnculturedCoxiellasp.100%Y2JQ480824Coxiellaendosymbiont98%Y3GU339297Pseudomonaslecolossicida98%pgY4AM237088Pseudomonassp.99%Y5AY342036Haemaphysalislongicomissymbiont97%Y6KJ6853%Bacilluscereus99%Y7HE%2283Pseudomonasaeruginosa100%Y8NR044527Nesterenkonia96%Y9JF369125Unculturedsoilbac化rium97%3.2.4细菌的分离鉴定---从饱血雌婢分离(Rh12)。Rh1、纯化获得2株细菌和趾细菌在普通琼脂-1平板上形成圆形凸起,表面光滑,,边缘整齐不透明的白色菌落。Rh为革兰氏l阳性球菌,菌体直径.Oim。j一Rh-2细茵在普通琼脂平板上形成圆形、有光泽的白、边缘不规则、大小不-x色菌落。趾2为革兰氏阳性杆菌,菌体大小为1.05鄭m,产芽抱。-??一RW?i-Rh*?*?//、?'心.trV*>-、???,?、*八之,?、、々*、、,?、护,??I>,\吃拳.??3-4细菌革兰巧染色结果i*-eFi.34Theresultsofiamssininggg29 湖南农业大学硕±学位论文--h-32Rh1和R2细菌的生化特性如表。表3-2Rh-1和Rh-2细菌的生化特性-2--Table3BiochemicalcharacteristicsofRh1andRh2MM^革兰氏染色++氧化酶一+触酶++半纤维素酶+无精氨酸+无尿素酶+无0-乳糖+无甘露醇+无旗糖+无D-葦糖+无丙丽酸+无一一D-木糖甘露醇一-淀粉支链淀粉一无()阿拉伯糖一无鸟氨酸脱幾酶一无卵磯脂酶无+酪蛋白水解无+明胶水解无+硝酸盐还原无+D-海藻搪无+葡萄糖无+呵嗯反应无一发酵搪类产气无一VP试验无—-1-综合两株2株细菌(Rh和Rh2)的菌落特点、菌体形态、理化特点,认--为Rh1为模仿葡萄球菌,Rh2为蜡样芽袍杆菌。3.3讨论镶形扇头婢广泛分布于我国的河北、广东、江苏、浙江、江西、福建、台湾、安徽、广西、湖北、海南、湖南、河南、贵州、云南、迁宁、西藏等地,在国外分布于印度、细甸、斯里兰卡、马来西亚、印度尼西亚、己基斯坦等国家,侵袭30 第H章谦形扇头碑带菌情况分析水牛、黄牛、猪、驴、犬、山羊、绵羊、野猪、猫、黑熊、狼、野兔、水鹿等,有时也侵袭人:是马己贝斯虫病、牛己贝斯虫病、吉氏己贝斯虫病、梨形虫病的传68Wt]播媒介。本研究结果表明;湖南省衡阳地区大量存在鎌形扇头蜗,提示今后本地发展草食动物养殖业应注意防治该碑传播的疾病。研究结果表明,在鎌形扇头婢雌成婢中至少存在4个属(9株)、3个属(52株)、个属(4株)的微生物。巧!I序、比对分析的9个明显条带序列,与假单胞菌属eudomonass.、涅斯捷连科氏菌属Nesterenkonia、、柯克斯氏体属Psp芽抱杆一菌属Bacillus的细菌16S瓜NA有较島相似性,与前人结果基本致。Claudia等-DGGE对镜子硬利用PCR婢全婢检测,发现篇子硬婢体内存在立克次氏体、己尔通氏体属Bartonella、包柔氏螺旋体、血己通氏体属Haemobartonella、葡萄球菌属Staphylococcus、红球菌属Rhodococcus、假单胞菌属Pseudomonas巧.莫拉菌属7G]TvMoraxellaW及共生菌柯克斯氏体属和立克次氏体属等多种细献etenAK;tW等报道了柯克斯氏体、假单胞菌及婢共生菌在篇子硬婢体内寄生的情况。与他人结果有相似之处,如;徐兴莉WDGGE法研究微小牛蜗中肠菌群结构,认为:微小牛魄中肠有:普氏立克次体、蒙他拿立克次体、孔雀立克次氏体、图兰扇头婢体内的共生柯克斯氏体、犬埃立克体、假单胞菌、黄单胞菌等8种微生物。杨亚发现:立、;獨黄血婢中肠的常在菌为克次氏体属柯克斯氏体属、假单胞菌属、72^[葡萄球菌属、大肠杆菌属等。李春红从H种未吸血硬碑(长角血碑、亚洲璃Pseudomonasaerunosa眼蜡、鎌形扇头婢)肠道内分离出铜绿假单胞菌gi、芽抱杆tni菌属2种细菌。一本试验中DGGE回收条带结果与细菌培养结果不尽致,可能是因为回收的DGGE条带为优势条带和优势条带对应的细菌为不可培养所致。嫌形扇头婢雌成婢的4株细菌分别为:CoxiellaendosymbiontofRhipicephalusturanicus,Pseudomonasplecoglossicida^Haemaphysalislongicomis巧mbiont,Pseudomonassp。Node等认为引起Q热的病原菌贝氏柯克斯氏体化oxiellaburnetii)能感染40多种婢,可分布于婢体的卵巢、马氏管内、唾液腺、中肠和血淋己,Kachko并通过繁殖在种群内扩飯气ly等证实柯克斯氏体菌可在花碑的卵巢、马氏管内、唾液腺、中肠寄生,与其呈共生关系气31 湖南农业大学硕古学位论文结论1.通过形态学方法和分子生物学方法鉴定采自湖南省衡阳地区山羊体表的婢虫进行鉴定,结果表明:在衡阳地区采集的碑虫是嫌形扇头婢,也证明了在衡阳地区是普遍存在镶形扇头蜗的。2-1nk.衡阳地区采集的婢虫的ITS与Gen純a中的DQ8395522(嫌形扇-头碑)同源性是100%。衡阳地区采集的婢虫的Cox1与GeneBank中化737085(嫌形扇头婢)同源性为99.3%。暗示:它为嫌形扇头魄。--ITS1比较保守,不适于种的鉴定Cox1测序种间差异较小,;测序种-间差异较大,Cox1可W适用于种间鉴定。3R-DGGE.通过PC技术对鎌形扇头婢雌成婢的菌群结构分析,可W得出:嫌形扇头婢雌成婢中至少存在4个属(9株)、3个属(5株)、2个属(4株)的微生物。本研究对鎌形扇头婢的自带菌群分析对其传播媒介的维生素合成,营养物质吸收,抵御外来菌侵入与定殖,W及公共卫生方面具重要意义。32 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致谢致谢本论文的撰写工作是在我的导师程天印教授的耐也指导下完成的。在研究生""一学习阶段,先生朴诚奋勉,且直,求实创新这八字校训教导我W实际行动影响我,坚持艰苦朴素,勤俭自强,实实在在做人做事,踏踏实实求学创新的原则。在此,衷也感谢我的导师程天印教授两年来给我的关也和指导。本论文的采样阶段是在衡阳地区地区的衡阳县、衡南县、祁东县、来阳市、常宁市、衡山县、衡东县的28个乡镇进行的。在此,我要特别感谢衡南县的刘交良、刘盛良两位前辈,因为在当地只有在很偏僻的乡镇才放养山羊,他们在百忙之中步行20多里到达当地的山羊养殖基地。两位前辈在采集山羊身上婢虫时一,传授抓婢虫的技巧直无私的分享他们几十年的饲养山羊的经验,W及婢虫的生活习性,在此,我向两位辛勤的农民伯伯献上我崇高的敬意。实验过程中得到几位学长的指导和帮助,徐兴莉师姐、严芬师姐和杨亚师姐一从显微镜观察到PCR切胶、跑胶、克隆等每个细节都是从头教起,认真、细致,。同时唐吴、廖正慧、周宇駿、伏健等同学在我不暇时给予帮助。感谢湖南农业大学动物医学院预防实验室的屈泰龙师兄、葛猛师兄、刘晓波同学、杨涛涛同学、危冰玉同学、王先坤同学、胡玉立同学、吴海超同学、赵壞同学、罗璋同学、杨宇同学、李海锦同学、陈荣华同学、李晓文同学在撰写论文时给予的指导。一特别感谢我的爸爸妈妈,他们在我读研究生苦恼无助的时候直默默的支持,。关也我,没爸爸妈妈默默无私的付出我不可能取得今天的成就正是因为他们一直W来的支持和无微不至的关爱,我才能顺利完成研究生学业。刘瑞昆2015年4月39 湖南农业大学硕上-学位论文作者简介基本情况说明:作者姓名:刘瑞昆性别:男出生年月:1990年5月17日籍贯:湖南衡阳专业:预防兽医学研究方向:兽医寄生虫教育经历:?2008/092012/06在湖南农业大学动物医学院08级本科动物医学创新班学习。 ̄2013/092015/06在湖南农业大学动物医学院预防兽医系预防分子试验室学习。40
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