萝卜nbs-lrr与stk类抗病基因同源序列鉴定及表达特征分析

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1、分类号尴!_学号a?為谦農每义營硕:t学位论文、NBS-萝ILRR与STK类抗病基因同源序列鉴定及表达特征分析宋朝辉-*■八---=..‘.??-、,_..,、.一’—■‘--指导教师柳李胚教授二':■■专业名称蔬菜学研究方向遗传育种与生物技术答辩日期二零一五年六月二日',1IDENTIFICATIONANDCHARACTERIZTIONOFNBS-LRRANDSTKTYPERESISTANCEGENEANAL

2、OGSINRADISHiRAPHANUSSATIVUSL.)ByZhaohuiSongSupervisedbyProfessorLiwanLiugTheDissertationSubmittedtoNaninAriculturalUniversitjggyInPartialF山filmentoftheRequirementsForMasterDereeofAriculturalSciencesggComletedinMa2015py,Commencem

3、entinJune2015,原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果,。除文中己经注明引用的内容外本论文不包含任何其它个人或集体己经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均己在文中W明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者(需亲笔)签名:訓辉乂年^月>日学位论文版权使用授权书.本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版,允许

4、论文被查阅和借阅。本人授权南京农业大学可,^^^将可^^1本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索采用影。印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文,在。本学位论文属于不保密口。保密□_年解密后适用本授权书""(请在上方框内打V)学位论文作者(需亲笔)签名:年^月J日导师(需亲笔〉签名以弁《月曰分乂^目录目录B录i摘要IABSTRACTIll缩略赋V引胃VII11植物抗病反应的理论学说及其机理11.1基因对基因假说11.2植物的主动防卫反应2

5、2植物抗病基因克隆的方法32.1图位克隆法3.22转座子标签法32.3同源序列克隆法33植物抗病基因研兄43-.1植物中NBSLRR抗病基因研巧进展53.2植物STK类抗病基因研究进展64RGAS在植物中的应用75本研究的目的意义8S-LRR类第二章萝h基于转录组测序的NB抗病基因同源序列的鉴定及特征分析91材料与方法101.1试验材料及处理101.2RNA的提取和cDNA的台成101.3NBS类民sRGAs的挖掘与鉴巧111.4民波GAs相互之间序列分析

6、、比对和系统发育树的构建12--.15NBSLRR类民S民GAs的民TPC民分析12q2结果与分析132-.1NBSLRR类民化GAs的鉴定和序列分析132.2序列的多重比对和聚类分析132-.3NBSLRR类RsRGAs序歹!J分析17-2.4NBSLRR类民sRGAs的进化分析18-2.5NBSLRR类民波GAs的表达分析18320第H章萝h基因纪型抗病基因同源序列分离鉴定及系统发育分析231材料与方法241.1植物材料24I-硕±学位论文:萝hN

7、BSLRR和STK类抗病基因同源序列分离、进化及表达分析1.2DNA提取和引物设计241.3PC民扩增体系和目的片段克隆251.4序列分析25、比对和系统发育树的构建1.5RsPtos型基因的进化分析262结果与分析262.1基因组中RsP防S的分离2622RsPtos氨基酸n.序列的同源性比较和系统进化树分析2-RGAA.3戶化s与番茄o抗病基因氨基酸序列遗传多样性分析2824戶-RGAs与番茄戶化抗病基因.化氨基酸序列多重比较分析2925巧o-RGAs序列间的进30

8、.化分析3W论31第四幸萝>!转表组中RGA分子标记的开发与应用331材料和方法341DNA提取.1植物材料与34--1.2

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