cytophaga+hutchinsonii纤维素吸附突变株筛选及相关吸附蛋白的研究论文

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1、山东大学硕士学位论文摘要随着社会经济的发展，人类面临着由资源的匮乏和能源的短缺所带来的诸多挑战。另一方面，木质纤维素作为地球上最为丰富的可再生资源，将会给人类社会的进步以及经济的发展带来新的资源基础，每年地球上的植物通过光合作用能够产生高达1011吨的纤维素。然而，其特殊的结构特征如水不溶性、高度结晶、相邻纤维素链间强烈的作用力(包括氢键、疏水作用)等造成了木质纤维素材料的生物转化效率低下。因此，实现纤维素的高效降解已经成为可再生能源研究的一个主要关注点。1938年，Walker和Warren首次从土壤中分离得到了好氧的革兰氏阴性细菌Cytophagahutchinsonii。它能够

2、迅速的降解滤纸，具有高效的纤维素降解能力。初步研究表明，Chutchinsonii具有独特的纤维素降解机制，可能不同于其它两种已得到广泛研究的纤维素降解策略，即真菌游离纤维素酶系及厌氧细菌纤维小体复合酶系。Cytophagahutchinsonii同某些其他纤维素降解菌一样需要吸附到纤维素表面实现对纤维素的降解，因此，菌体细胞对纤维素底物的吸附可能是Chutchinsonii对纤维素进行有效降解的第一步。因此研究Cytophagahutchinsonii通过何种方式与纤维素进行吸附，阐明其吸附机制，将有利于深入了解其独特的纤维素降解机制，对纤维素这一丰富的可再生资源的利用具有重要的理

3、论意义。因此，本论文围绕Cytophagahutchinsonii吸附突变株的筛选及其生理生化表征，从以下几个方面进行了研究：1)突变株的诱变筛选。采用传统的物理化学方法如紫外线诱变、EMS诱变以及自发突变和转座子随机插入突变等方法对Chutchinsonii进行突变筛选，得到两株吸附突变株、两株滑动突变株及多株未知功能的突变株。所获得的吸附突变株其吸附能力出现稳定性的降低，对结晶纤维素吸附效率为野生型的20％-40％。突变株无论是在葡萄糖还是在纤维素为唯一碳源的培养基中，其生长能力均不如野生型，推测原因有可能是突变使细胞表面的某些蛋白功能发生缺失或变化，从而影响到糖的转运或者是菌体

4、对纤维素的吸附而对菌体的生长造成影响。有研究表明，Chutchinsonii可能需要通过在纤维素表面上的滑动来实现对纤维素的有效降解，而滑动性的增加有可能会增加菌体对纤维素的降解能力。通过紫外线诱变我们得到两株在琼脂培养基上生长扩散发生明显变化的菌株，但其在纤维素底物上的生长特征没有出现明显提高，具体原因有待进一步研究。通过转座子随机插入诱变得到几株突变株，但对其吸附、运动以及生长特性进行研究，均没有发现与野生型明显的差异。经质粒拯救得到其基因失活的座位，保守序列进行分析发现CHU0456含有一个FN3Superfamily结构域，而此结构域预测可能是与底物吸附相关的，但对其进行吸附

5、性质研究时却没出现吸附现象，CHU0456在基因组中发挥着怎样的功能，这有待于后续试验的进一步研究。2)Cytophagahutchinsonii膜相关蛋白提取方法的研究目前对膜蛋白的研究已经受到越来越多的关注。基因组序列分析表明，在Homosapiens，Escherichiacoli和Saccharomycescerevisae中有30％的编码蛋白质是膜整合蛋白。由于膜蛋白所具有的一些特有的性质如高疏水性，低丰度等，使其成为较难研究的对象之一。初步研究表明，Cytophagahutchinsonii对结晶纤维素的吸附降解极有可能与其膜表面的酶(蛋白)有关，因此我们对其膜蛋白的提取

6、方法进行了初步探索，包括总膜蛋白的提取以及膜蛋白的分级分离。结果表明，Cytophagahutchinsonii膜蛋白提取的最适去污剂为1％DDM。在4℃条件下处理3h可以释放最大量的膜蛋白，并通过实验表征了此两种方法的可行性。3)纤维素吸附膜相关蛋白的鉴定由于纤维素对吸附蛋白具有浓缩的作用，因此可以通过富集来鉴定与纤维素吸附相关的膜蛋白。通过将提取的葡萄糖培养外膜蛋白与纤维素混合进行吸附，随后SDS／PAGE电泳检测比较吸附前后富集的蛋白条带，发现有6条蛋白条带发生浓缩，将这些蛋白条带进行质谱鉴定，得到4个富集蛋白。其中3个是是功能未知的蛋白，另外1个是与滑动相关的蛋白。对此滑动蛋

7、白进行的异源表达尝试没有成功，可能是由于膜蛋白结构的特殊性使其难以表达。此外，为了比较吸附缺陷突变株与野生型膜相关蛋白的差异，通过SDS／PAGE电泳检测比较吸附缺陷突变株与野生型全膜蛋白与纤维素吸附之后相关差异膜蛋白。发现吸附缺陷突变株中有1条蛋白条带发生缺失，并在最上方出现一条明显的浓缩条带，将这些蛋白条带进行质谱鉴定，得到2个未知功能蛋山东大学硕士学位论文白。对此缺失蛋白进行的异源表达尝试同样没有成功。4)不同碳源培养条件下膜相关蛋白的双向电泳分析C