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《菜粉蝶颗粒体病毒基因组和odv蛋白组的研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、中文摘要杆状病毒(Baculovirus)是一类能够感染并最终杀死鳞翅目、膜翅目等农业害虫和双翅目蚊子的一类双链环状DNA病毒，其基因组大小为80-180kb，基因总量约为895个；该类病毒可用作生物农药，基因表达载体、基因治疗载体等，广泛应用于农业生产或医学研究等领域。目前已经有58种杆状病毒完成了基因组测序与注释，包括45种核型多角体病毒(NPV)，13种颗粒体病毒(GV)；然而，仅有5种杆状病毒蛋白组成得到鉴定，而且全部为NPV病毒，鉴定蛋白多为ODV％罄徽激?蠡白，仅1种为BV(buddedVirus)蛋白·
2、鉴于此，本研究选择菜粉蝶颗粒体病毒(PrGV,属GV病毒)为研究对象，重点分析该病毒基因组、ODV蛋白组成等，本论文主要结论如下：1．PrGV基因组分析该病毒基因组为闭合环状双链DNA，大小108，592bp，拥有120个ORFs，编码区占整个基因组91％；在120个预测的ORFs中，65个OREs与granulin基因具有相同的转录方向，另55个OREs的转录方向与其相反；PrGV基因组中最长ORE合有3402bp(oREz5，helicase．7)，推测编码l133个氨基酸残基的蛋白；含有2个重复基因(ODV-E
3、66a／b)；PrGV基因组存在基因间隔区和基因重叠现象，8个同源区分散在基因组不同位置。PrGV基因组存在杆状病毒科31种核心(保守)基因和鳞翅目杆状病毒31种辅助基因。PrGV基因组共线性分析揭示了该病毒与p．杆状病毒属基因组具有异常高的共线性，其中PrGV与云杉卷叶蛾颗粒体病毒(ChocGV)、杨扇舟蛾颗粒体病毒(ClanGV)、茶小卷叶蛾颗粒体病毒(AdorGV)等基因组共线性程度非常高，与八字地老虎颗粒体病毒(XecnGV)等基因组共线性程度相对较低；而与鳞翅目核型多角体病毒AcNPV共线性程度更低。蛋白质
4、同源比对分析揭示了PrGVORFs可分为四类：1)8个GV．特异基因这些基因同系物仅仅存在于GV基因组中，它们是off4,orfl2,orf2S,o啪Zo，f55,o矽sCLEE-3),o,f103,D棚12，表明这些保守基因是GV病毒结构与功能所必须；浙江大学博士学位论文2)33个基因存在于GV基因组和其它病毒基因组，但在NPV基因组中并不存在，黼是ory2,offS,or刀S,or．p9,orpO(PEPl)．or归4,or刀5,or归7,口鄙1．or筘5,0鄙6．orp7(Metalloproteinase)．
5、or：41．orf4e,or／48(39r)。or：4,orf62(FGF-1)。orf63．orfgT,or：83．or归4,or筘6,or徊9,off94,orJgZorfl02,od]04,o巾05．orfl06,orfl09,or：111，D印14,orfll5；3)4个基因仅存在于杆状病毒PrGV基因组中或其它物种中，它们是ory09,orj雪ZD萨只D印17；4)75个基因为GVs和NPVs共享基因。基因组进化分析显示：PrGV基因组无论在LCB(LocallyCollinearBlocks，局部共线区)
6、数目、方向、排列顺序、长度等方面与ChocGV基因组高度相似，暗示了PrGV与ChocGV在基因组进化上可能经历着相似途径；PrGV与PsunGV,XeniGV,HearGV对应的LCBs相比，在LCB序列长度方面存在较大差异，推测3种病毒(PsunGV,XeniGV,HearGV)在长期的选择压力下，通过在LCB区域“扩充”基因以“增添”新功能来更好地拓展生存空间；PrGV与AcNPV基因组对应LCBs相比差异显著，揭示了两种病毒在基因组进化方面分歧较早；PrGV与CunniNPV基因组相比，两者的LCBs一致性最
7、低，暗示了两者分歧时间更早，但都保留了“祖先’’基因组某些基因。PrGV种系发生研究表明：PrGV与ChocGV在种系进化树上距离最近；13种B．杆状病毒聚类在一起，形成1个分支；在分支内6种病毒(HearGV,XeniGV,PsunGV,SpliGV,AgseGV,PlxyGV)形成亚分支，7种病毒(AdorGV,PhopGVCrleGV,CypoGV,ClanGV,ChocGV和PrGV)形成另1个亚分支。2．PrGVoODV蛋白组分析利用3种质谱技术对PrGV-ODV蛋白分析共鉴定47种蛋白，其中MALDI-T
8、OF／TOFMS(matrix-assistedlaserdesorption／ionizationtime-of-flight／time—of-flightmassspectrometry：基质辅助激光解离串联飞行时间质谱)方法鉴定l6种蛋白，LC-LTQVelos(1iquidchromatography-lineariontrapquad
