肠炎沙门氏菌感染引起的白来航蛋鸡脾脏全基因组表达谱分析

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1、关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文，是在导师指导下，独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体，均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定，同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存诊寸知旷编木拳脚淤奇l吾I时拇．k+x--j,小国吞I肖挂率佶白缸肃昕、睃+当胁．：△专；o，-’-‘。·-7··q

2、’-·*ru^，I’．J—JJ^’n-目’I．1丁从／l、1日，∞哕I／u，／I’I’J产r丁阻吧人收录到《中国学位论文全文数据库》，并向社会公众提供信息服务。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名：螳儿导师≤名：趣纯导师签名：丞＼型蕾阿／日期：趋!选J3符号说明SE：salmonellaenteritidis，肠炎沙门氏菌PD：pullorumdisease，鸡白痢FT：fowltyphoid，禽伤寒DT：paratyphoid，副伤寒SPI：Salmonellapathogenicityisland，毒力岛TTSS：typelIIsecretionsystem

3、，III型分泌系统NB：nutrientbouillon,营养肉汤RV：Rappaport·Vassiliadis，增幅肉汤WHO：worldhealthorganization，世界卫生组织ELISA：enzymelinkedimmunosorbcntassay,酶联免疫吸附测定法GO：GeneOntology,基因本体论MF：。m。--．!。．．．。．-Im--盒试晶。远分了功能BP：biologicalprocess，生物学过程CC：cellularcomponent,细胞组分LOWESS：locallyweightedscatterplotsmooth，局部加

4、权线性回归QRT-PCR：quantitativerealtimePCR,实时荧光定量PCRIIlllIlllIlllrillIIIIIY2303633中文摘要Abstract1前言目录IIH2．1。6试验试剂及其配制2．1．7分析工具及其网站1718l12345679O024562．2试验方法2．2．1血液生理指标的检测2．2．2总RNA的提取2．2．3RNA变性琼脂糖凝胶电泳法检测RNA质量2．2．4双标芯片实验操作流程2．2．5QRT-PCR及数据分析2．2．6聚类分析2．2．7差异表达基因的GO和PATHWAY分析3结果与分析．．3．1血细胞计数3．2RNA提

5、取3．3芯片数据的预处理与归一化3．4芯片结果分析3．5芯片结果验证3．6免疫相关基因的聚类分析3．7差异表达基因的GO和PATHWAY分析3．8不同时间点的差异表达基因分析4讨论4．1肠炎沙门氏菌对蛋鸡血液生理指标的影响4．2RNA的质量对芯片结果的影响4．3芯片结果的验证及分析4．4差异表达基因的GO和PATHWAY分析4．5肠炎沙门氏菌感染随时间的变化一4．6免疫相关基因在抗病机理中的作用5结论参考文献致谢89367801245245679)》郴瑚邶∞仍蕊∞凹勰∞m记舛"铊钳钻％钉钞如钞山东农业大学硕士学位论文中文摘要沙门氏菌属肠杆菌科，为革兰氏染色阴性杆菌，对

6、蛋鸡生产和食品安全造成重大影响。蛋鸡沙门氏菌病主要是由沙门氏菌引起的一种以蛋鸡出现零星死亡，产蛋率下降的慢性消耗疾病，时间一长，容易引起蛋鸡消化道功能紊乱，鸡群抗病力下降，继发感染其它疾病。一些沙门氏菌含有携带耐药因子的遗传质粒，耐药因子传递的对多种抗生素的耐药性，给治疗沙门氏菌污染造成困难。从鸡本身出发，研究其对沙门氏菌感染抗性的分子机制是缓解沙门氏菌病对蛋鸡生产危害的有效途径之一。本研究以开产蛋鸡为研究对象，用肠炎沙门氏菌感染后，采集血液，用全血自动分析仪分析肠炎沙门氏菌对血液生理指标的影响，利用Agilent鸡4"44KV2全基因组表达芯片检测感染后8天和16天

7、脾脏组织的基因表达，筛选出由沙门氏菌感染引起表达差异的基因，并对筛选出来的差异表达基因进行聚类分析，同时利用DAVID数据库对其进行生物学功能分析。此外，我们利用QRT-PCR方法对芯片结果做了验证，同时把筛选出来的差异表达基因与免疫相关某厌I讲行关联分析．并把两含时问_占筛诜出来的差异基因进行了对比．结果垦示：(1)对照组和试验组的血液样品中白细胞的数量都普遍高于正常值，但同一时间点试验组和对照组的比较差异不显著；感染后8天的试验组红细胞数量明显高于对照组，但在感染后16天这种差异未达到显著性水平。(2)为了验证芯片结果的可靠性，选择了11个差异表