结核分枝杆菌环介导恒温扩增_lamp_快速检测方法的评价

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1、2011年1月第33卷第1期·47··论著·结核分枝杆菌环介导恒温扩增(LAMP)快速检测方法的评价戴广明122231111曹以诚杜正平陈洵黄曙海逄宇周杨黄海荣赵雁林(1.北京结核病胸部肿瘤研究所北京101149;2.华南理工大学广州510640;3.广西疾病预防控制中心南宁530000)摘要:目的对国内建立的结核分枝杆菌DNA环介导恒温扩增(loop-mediatedisothermalam-plification,LAMP)快速检测方法进行了介绍和评价。方法实验菌株来源于北京结核病胸部肿瘤研究所。以结核分枝杆菌作为研究对象,设计了4条LAM

2、P引物特异地识别结核分枝杆菌中gyrB基因的6个特殊区域。所有的菌株样本提取DNA作为模板,加入LAMP反应管后,65℃恒温反应60min即可。其结果可以通过肉眼观察到的颜色变化来判断。结果实验共验证了79株临床和标准菌株。对于菌株的培养物,LAMP实验的灵敏度为100%,特异度为92%。结论结核分枝杆菌LAMP快速检测方法是一种快速、可靠的结核分枝杆菌诊断方法。关键词:分枝杆菌,结核;核酸扩增技术通讯作者:赵雁林(zhaoyanlin@tb123.org)Evaluationofloop-mediatedisothermalamplifica

3、tion(LAMP)inrapiddetectionofMycobacteriumtuberculosis1,CaoYicheng1,ChenXun2,DuZhengping2,HuangShuhai3,PangYu1,DaiGuangming1,HuangHairong1,ZhaoYanlin1ZhouYang(1.Beijingchesthospital,Beijing101149,China;2.SouthChinaUniversityofTechnology,Guangzhou510640,China;3.CDCofGuangxipro

4、vince,Nanjing530000,China)Abstract:ObjectiveToevaluatethevalueofloop-mediatedisothermalamplification(LAMP)inrapiddetectionofMycobacteriumtuberculosis.MethodsAsetoffourLAMPprimerswerede-signedforrecognizingsixdistinctregionsonthetargetDNA(gyrB).TheDNAsofM.tuberculosisstrainsf

5、romBeijingChestHospitalwereextracted,amplifiedat65°Cfor60min,andtheirreactionresultswereobservedbysimplenakedeye.ResultsAtotalof79clinicalisolatesandstandardstrainswerestudied.ThesensitivityandspecificityofLAMPwas100%and92%,respectively.ConclusionsLAMPisarapidandreliablealte

6、rnativemethodfordiagnosingM.tuberculosisinfec-tion.Keywords:M.tuberculosis;nucleicacidamplificationtechniquesCorrespondenceto:ZhaoYanlin(zhaoyanlin@tb123.org)基金项目:1.北京市科技新星计划(2007B039);2.中-法梅里埃基金会结核病防治项目。·48·2011年1月第33卷第1期细菌学检查是发现结核病传染源的主要途径和株,48株临床结核分枝杆菌。手段,是确定结核病诊断和化疗方案的重要

7、依据。1.1.2结核分枝杆菌(LAMP法)基因快速检测试但由于敏感性低或所需时间过长等原因,致使结核剂盒(以下简称LAMP检测试剂盒)由我们和华南病细菌学检查一直不能满足临床诊治的需求,存在理工大学共同研发,基因组DNA纯化试剂盒(Ge-延误诊断和误诊情况,同时也耽误了患者得到及时nomicDNAPurificationKit)购自Promega公司。治疗的时间,影响了治疗效果,也使得疾病的传播难1.2方法于控制。因此,缺乏早期、准确和廉价的诊断技术是1.2.1检测目标菌株和靶标引物结核分枝杆菌制约全球结核病控制的严重障碍。基因快速检测方法的目

8、标菌株确定为结核分枝杆菌近年发展起来的环介导等温扩增技术复合群,包括结核分枝杆菌(Mycobacteriumtubercu-(LAMP),完全突破了传

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