淹水胁迫下玉米幼苗的转录组分析及耐渍候选基因克隆

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1、分类号：华中农业大学硕士学位论文密级淹水胁迫下玉米幼苗的转录组分析及耐渍候选基因克隆TranscriptomeanalysisofMaizeSeedlingunderWaterloggingStressandCloningofCandidateGeneforWaterloggingTolerance研究生：耿存娟指导教师：邱法展副教授指导小组：郑用琏教授张祖新教授严建兵教授张方东副教授岳兵副教授专业：作物遗传育种研究方向：玉米分子育种获得学位名称：农学硕士获得学位时间：2014年6月华中农业大学植物科学与技术学院二0一四年六月学位论文不如需保密，

2、解密时间年月日是否保密a独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果．尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得华中农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，指导教师对此进行了审定．与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中做了明确的说明，并表示了谢意．研究生签名：译徽时间：二口lq-#∥月7日学位论文使用授权书本人完全了解华中农监大学关于保存、使用学位论文的规定，印学生必须按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本：学校有权保存

3、提交论文的印别版和电子版，并提供目录检索和

4、再览服务，可以采用影印．缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文．本人同意华中农韭大学可以用不同3-式在不厩媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，为存在馆际合作关系的兄弟高校用户提供文献传递和交换服务，同时本人保留在其他媒体发表论文的权力．注：保密学位论文(印涉及技术秘密、商韭秘密或申请专利等潜在需要提交保密的论文)在解密后适用于本授权书．学位做作者娩乍呱导师张即涵厥签名日期：≥。f争年‘月7日签名日期：pl≯年‘月7日淹水胁迫下玉米幼苗的转录组分析及耐渍候选基因克隆目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯iAbstract．．⋯．．⋯⋯．．．．．⋯．．⋯⋯．．．⋯．．⋯．．⋯⋯．．．．．⋯．⋯．．．．．⋯．．⋯⋯⋯．．．．⋯⋯⋯．．．⋯．．⋯．．．．．⋯⋯．．．．⋯iii缩略语表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯v1前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11．1渍害对玉米生产的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．1．1渍害对玉米生长发育、产量的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．1．2渍害对玉米生理生化特性的影响⋯⋯⋯⋯

6、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．2植物对淹水胁迫响应的转录组学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．41．2．1基于SSH技术转录组研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．41．2．2基于基因芯片技术的转录组研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯51．2．3基于高通量测序技术的转录组研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61．3转录因子在植物抗逆中的作用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．71．4作物耐渍基因定位和克隆研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．81．4．1作物耐渍相关性状QTL定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．81．4．2关联分析挖掘耐渍候选基因

7、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．101．4．3AP2／ERF类转录因子参与的淹水胁迫响应途径⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．1l1．5本研究的意义和目的⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯132试验材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．152．1植物材料和淹水处理、取样方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．2实验所用宿主菌、载体及试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．3转录组高通量测序和数据分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯162．4表达谱的差异分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯172．5Real

8、TimePCR．．．⋯．．．．．．．．．．．．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．．．．．．．．．．．．⋯⋯．．．．．．．．．．．．．⋯．．．．．172．5．1cDNA合成⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172．5．2RealTimePCR分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯172．6PCR引物的设计、扩增、产物回收与测序⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯182．7耐渍候选基因的筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯182．8耐渍候选基因启动子的克隆⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯19华中农业大学2014届硕士研究

9、生学位论文2．9耐渍候选基因序列的生物信息学分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．10功能标记的开发及遗传定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯