中国汉族特发性肌萎缩侧索硬化全基因组关联分析

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1、学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得直昌太堂或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名(手写)：印书签字日期汐f)年‘月／日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解南昌大学有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权南昌大学可以将学位论文的全部或部分内容编

2、入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制、手段保存、汇编本学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所和中国学术期刊(光盘版)电子杂志社将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》和《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》中全文发表，并通过网络向社会公众提供信息服务。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位黻储签名c矧：呻书锄签名c矧：桫签字日期：切f烽‘月／日签字日期：p／)#--6月／日摘要目的：肌萎缩侧索硬化是一种运动神经元变性性疾病，目前发病机制尚不明确，但遗传因素在发病机制中可能起很大作用。基因组筛查是一种有效寻找易感基因的方法，前期研究已发现了一些候选基因，但其

3、研究对象多为欧美人群。为此，我们对中国汉族人群特发性肌萎缩侧索硬化(sALS)进行全基因组扫描，以期发现新的易感基因。方法：收集200名临床确诊中国汉族sALS患者和200健康中国汉族人血样，提取基因组DNA，每个试验亚组样品DNA等量混合，构建病例组和对照组DNA混合池，通过全基因组SNP芯片高密度杂交分型，比较分析病例／对照各位点的等位基因频率差异。找出与sALS相关差异有显著统计学意义的基因位点。结果：①经临床资料分析，病例组平均发病年龄(48．5士8．4)岁，40岁以前和80岁以后发病少见，男女发病比例1．5：l；对照组平均年龄(59．8士11．6)岁，男女比例1．3：1

4、：②通过质量控制的有基因诠释信息的SNPs位点859311个，无基因诠释信息的SNPs位点12670个；发现8个新的可疑sALS风险基因位点：INPP5B(kgp15327256)，IQCF5／IQCF1(rS1605070)，ITGA9(rs9825420)，LOC727878／PFKP(rs9329300)，MYO18B(kgpS087771)，LOC100287880／ALCAM(rS2685056)，LOClOOl28095／OPCML(rs711708)，GPRl33(rsll061269)。⑨pathway分析发现3个通路可能与sALS相关，共361个基因。结论：经全

5、基因组关联分析(GWAS)和Pathway分析研究，发现新的8个可疑sALS易感基因位点，3个可能通路，361个候选基因。说明中国汉族人群和欧美人群的致病基因是有区别的。为今后发现sALS的发病机制及致病基因功能研究进一步研究提供基础。关键词：中国汉族；散发性肌萎缩侧索硬化；全基因组关联分析；pathway分析AbstractABSTRACTObjective：Amyotrophiclateralsclerosisisoneofmotorneurondiseases，thepathogenesisisnotunderstoodclearly．Butgeneticfactormay

6、playanimportantroleinthedisease．Genomescreeningisaneffectivewaytodiscovernewgene．EuropeansandAmericanshavefindsomeaccoaitedgenesinprelimnarystudies．Hence，wehaveconductedagenome-wideassociationstudy(GWAS)inChineseHanpeople，todiscoverwhetherthesearesomedifferentgenesbetweenChineseHanpeopleandEu

7、ropeansandAmericans．Methods：Theclinicaldatesandperipheralvenousbloodof200casesofconfmnedsALSand200controlsofhealthywerecollected，extractedthegenomicDNA，thenDNAwasmixedwimanequalamountofeachtestsubgrouptoconstructcasesandcontrolsDNAmixedpools，