dna条形码在生态学研究中的应用与展望_罗亚皇

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1、植物分类与资源学报2013，35(6):761～768PlantDiversityandＲesourcesDOI:10．7677/ynzwyj201313192*DNA条形码在生态学研究中的应用与展望1，2，3，411＊＊1，2＊＊罗亚皇，刘杰，高连明，李德铢(1中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室，云南昆明650201;2中国科学院西南野生生物种质资源库，云南昆明650201;3中国科学院大学，北京100049;4云南大学生命科学学院，云南昆明650091)摘要:DNA条形码是利用标准的DNA片段对物种进行快速鉴定的技术，已在生物学各相关领

2、域得到广泛应用。随着DNA条形码技术的不断发展和完善，已成功应用于生态学领域的相关研究中。本文综述了DNA条形码在物种快速鉴定和隐存种发现、群落系统发育重建和生态取证、群落内物种间相互关系研究等方面的应用，并介绍了DNAmetabarcoding技术和环境DNA条形码在生物多样性和生态学研究领域中的应用。最后，结合新的测序技术和未来大科学装置的发展，在相关数据库逐渐完善，新分析方法和计算模型不断开发使用的情景下，对DNA条形码在生态学相关领域的应用前景进行了展望。关键词:生物多样性;群落系统发育;DNAmetabarcoding;环境DNA条形码;第二代测序技术

3、中图分类号:Q948，Q781文献标识码:A文章编号:2095－0845(2013)06－761－08ApplicationsandAdvancesofDNABarcodinginEcologicalStudies1，2，3，411＊＊1，2＊＊LUOYa-Huang，LIUJie，GAOLian-Ming，LIDe-Zhu(1KeyLaboratoryofBiodiversityandBiogeography，KunmingInstituteofBotany，ChineseAcademyofSciences，Kunming650201，China;2Germp

4、lasmBankofWildSpeciesinSouthwestChina，KunmingInstituteofBotany，ChineseAcademyofSciences，Kunming650201，China;3UniversityofChineseAcademyofSciences，Beijing100049，China;4SchoolofLifeSciences，YunnanUniversity，Kunming650091，China)Abstract:DNAbarcodingisatechniqueusedtoidentifyspecies，whic

5、hisnowwidelyemployedindifferentbiologi-caldisciplines．WiththedevelopmentandmodificationofDNAbarcoding，ithasbecomeausefultoolforecologicalstudies．Here，wereviewtheusesofDNAbarcodingforquickspeciesidentificationand/ornewandcrypticspeciesdiscovery，incommunityphylogeneticreconstructionand

6、ecologicalforensics，andininteractionnetworksamongspecieswithinacommunity．ThetechniquesofDNAmetabarcodingandenvironmentalDNAmetabarcodingusedinecologicalresearchsuchasdietanalysisandbiodiversityassessmentarealsoexamined．Finally，wediscussthefu-tureprospectsofDNAbarcodinginecologicalres

7、earchfollowingthedevelopmentofnext-generationsequencingtech-nologies，improvementofLarge-scaleScientificFacilities，anduseofnewmodelsandsoftwarefordataanalysis．Keywords:Communityphylogeny;EnvironmentalDNAbarcoding;DNAmetabarcoding;Biodiversity;Nextgener-ationsequencing随着社会的进步和经济的快速发展，人

8、类越来越关注，而物种的准