癌蛋白质组学技术及其应用

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1、万方数据2008年10月第28卷第10期基础医学与临床Basic&ClinicalMedicineOctober2008V01．28No．10文章编号：1001．6325I2008)10-1107．04癌蛋白质组学技术及其应用魏晓丽，王悦’(南开大学医学院，天津300071)短篇综述摘要：蛋白质组学的研究由二维电泳的引进揭开序幕，而近年来质谱技术和蛋白质芯片的广泛引入使得蛋白质组学技术得到越来越多的应用，尤其是应用在肿瘤研究中。癌蛋白质组学以整个肿瘤特异性蛋白信号网络为靶标，已应用到多种癌症的研究中，成为

2、肿瘤研究的重要工具。本文将对癌蛋白质组学技术原理以及近年来在肿瘤研究中的应用加以综述。关键词：癌蛋白质组学；二维电泳；质谱技术；蛋白质芯片中图分类号：R730文献标志码：AOncoproteomicsanditsapplicationWEIXiao—li，WANGYue‘(SchoolofMedicine，NankaiUniversity，Tianjin300071，ChiM)Abstract：Proteomicresearchfimtcanletothefore试tlltheintroductionof

3、two—dimensionalgelelectrophoresisandproteomicshasbeenincreasinglyappliedtocancerresearch诵tIlthewide—spreadintroductionofmassspectrometryandproteinchip．Asimportantresearchtools，oncopreteomicsthattargetstheentirecancer—specificproteinnetworkhasalreadybeen印p

4、liedincancerresearch．Inthisarticlethedevelopmentoftheoncoproteomicsanditsapplyingincancerisreviewed．Keywords：oncoproteomics；twodimensional；electrophoresis1111188spectrometry；proteinchip癌蛋白质组学(oncoproteomics)是应用蛋白质组学技术对癌细胞中蛋白质及其相互作用的研究，是针对整体蛋白质组的分析。定量蛋白质组学

5、，高分辨率、高通量、高敏感度质谱技术，蛋白芯片以及生物信息学的发展使精确研究细胞内蛋白质水平的变化成为可能，进一步促进基础研究的成果推向临床应用。蛋白质组学的方法应用于肿瘤研究促进我们对肿瘤病理学的理解，推进了肿瘤诊断以及抗肿瘤药物的研究。为发现早期诊断肿瘤的新的蛋白质标志物，监测肿瘤的发展进程，估计一种新治疗方法的有效性和安全性，检测肿瘤抗性从而寻找更特异性的治疗等都具有重要作用。1二维电泳(tWOdimensionalelectrophore-sis，2-DE)和质谱分析法【massspectrome

6、-try，MS)1．12·DE与MS技术。2．DE：只有将复杂的蛋白质样品有效分离才能比较正常状态与癌症状态下蛋白质的差异，进而精确鉴定蛋白质。二维电泳第一向根据蛋白质等电点收稿日期：2008一01一03修回日期：2008—04一01基金项目：国家高技术研究发展计划(863计划2007AA021010)教育部留学归国科研基金’通信作者(correspondingauthor)：wangyue@nankai．edu．cn万方数据1108基础医学与临床Basic&ClinicalMedicine2008．28

7、(10)(垂直向)的不同，第二向根据蛋白质的分子质量(水平向)不同将蛋白质进行分离。迄今为止二维电泳仍是分离蛋白质的最好方法。MS：二维电泳本身只是一个单纯的描述性技术，必须和分析方法联合使用(例如质谱分析法MS)。目前MS的基础方法包括：用序列特异性的蛋白酶(如胰蛋白酶)从2D胶上消化并提取蛋白质；然后将这些特殊的蛋白水解衍生的肽段进行蛋白质鉴定。质谱仪以质荷比(nlas8．to—charge，m／z)为基础，形成、分离和检测分子离子。将肽离子化从而进行MS分析，两个最普遍的方法就是基质辅助激光解析电离

8、(matrix—assistedlaserdesertion／ioniza-tion，MALDI)技术和电喷射离子化作用(electrosprayionization，ESI)。1．2MS的使用及蛋白质鉴定MS质谱分析仪包括3个基本元件：一个离子源，—个质谱分析仪和一个检测器。质谱分析仪根据某种物理性质如：电荷、磁场或是飞行时间(time．of-flightTOF)分离特定m／z值的离子。离子通过质谱分析仪时被电子倍增器类的仪