应用基因芯片分析红蚰麦白粉菌胁迫条件下的基因表达谱

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1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2009,35(7):1188−1193http://www.chinacrops.org/zwxb/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2009.01188应用基因芯片分析红蚰麦白粉菌胁迫条件下的基因表达谱1,21,2,*1112,3,*王俊美刘红彦徐红明王飞高素霞康振生12河南省农业科学院植物保护研究所,河南郑州450002;西北农林科

2、技大学植保资源与病虫害治理教育部重点开放实验室,陕西杨凌3712100;西北农林科技大学陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌712100摘要:小麦农家品种红蚰麦携带1对显性抗白粉病新基因,暂命名为Pmhym。为了深入了解该品种抗病的分子机制,用豫麦13/红蚰麦的F3代纯合抗病株系构建抗池,采用Affymetrix小麦基因芯片技术,以白粉菌接种0h为对照,分析白粉菌接种后24h的基因表达谱。在61127基因微矩阵点中,有效差异表达Ratio值≥2或≤0.5的基因共5282个,其中上调基因2553个,下调

3、2729个。对上调序列的分类表明,功能明确的序列中39.81%与抗病/防御相关;下调表达基因中以能量代谢和抗病/防御相关基因比例最高,分别占26.71%和19.65%。上调表达在8倍以上的序列中81个的功能已知,其中包括病程相关基因、防卫反应基因、生成或清除活性氧的基因,以及抗病信号转导基因等。选取上调和下调表达8倍以上的共13个探针序列进行实时定量PCR验证,表明基因芯片数据具有良好的重复性。关键词:小麦;抗白粉病基因;基因芯片;表达序列标签;实时定量PCRExpressionProfileofLand

4、raceHongyoumaiInfectedbyBlumeriagraminisf.sp.triticiUsingGeneMicroarray1,21,2,*1112,3,*WANGJun-Mei,LIUHong-Yan,XUHong-Ming,WANGFei,GAOSu-Xia,andKANGZhen-Sheng12InstituteofPlantProtection,HenanAcademyofAgriculturalSciences,Zhengzhou450002,China;KeyLaborato

5、ryofPlantProtectionResources3andPestManagement,MinistryofEducation,NorthwestA&FUniversity,Yangling712100,China;ShaanxiKeyLaboratoryofMolecularBiologyforAgriculture,NorthwestA&FUniversity,Yangling712100,ChinaAbstract:WheatlandraceHongyoumaicarriesonedomina

6、ntresistancegeneforpowderymildew(Blumeriagraminis),tenta-tivelydesignatedPmhym.TofurtherelucidatemolecularmechanismoftheresistancetopowderymildewinHongyoumai,aresis-tantpoolwasconstructedwithfourhomogenousresistantlinesfromtheF3generationofYumai13/Hongyou

7、mai.Thewheatseed-lingswereinoculatedwithsinglesporeisolatesofB.graminisf.sp.tritici,andat0and24hafterinoculationthegeneexpressionprofilewasanalyzedusingAffymetrixwheatmicroarray.Therewereapproximately5282expressedgenes(withlogratio≥2or≤0.5)amongtotal61127

8、genessetinthemicroarrayplate,including2553up-regulatedand2729down-regulatedgenesorexpressedsequenceTags(ESTs).Intheup-regulatedESTswhosefunctionshavebeenknown,39.81%weredisease/defensegenes.Inthedown-regulatedESTs,e

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