生物信息学习题new

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1、第一章生物信息学引论（问题与练习）1、什么是生物信息学？2、生物信息学的主要研究任务是什么？3、我国生物信息学的主要发展方向是什么？4、简述你所了解的人类基因组计划5、简述你所了解的生物信息学的基本方法和前沿技术6、生物信息学目前的主要研究内容第二章生物学基础（问题与练习）1、细胞学说的基本内容2、简述细胞分裂周期的全过程3、细胞分裂有哪些方式？4、说明细胞的分类5、简述原核细胞的基本内容6、真核细胞的基本结构7、陈述蛋白质的生物学功能8、试按你的理解对20种氨基酸进行分类9、画图说明肽键的形成过程10、何谓蛋白质一级结构？11、何谓蛋白质二级结构？12、何谓蛋白质超二级结构？1

2、3、何谓蛋白质四级结构？14、描述核酸的基本组成15、叙述DNA结构的基本内容16、图示目前公认的中心法则17、何为蛋白质剪切18、何为GT-AG规则?19、说明原核、真核生物基因的结构特征20、阐述DNA复制机制的最新进展21、阐述基因转录调控模型22、总结蛋白质转译的基本机制23、总结遗传密码破译的过程24、何谓操纵子？25、叙述基因表达调控的几个层次第三章生物信息学资源与数据挖掘工具（问题与练习）一、单项选择题（从每题的A、B、C、D四个被选答案中选择一个最佳答案。）1、如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用A、NDB数据库B、SWISS-PROT数据库C、GenBan

3、k数据库D、PDB数据库2、如果试图确定一个新蛋白质序列属于哪一个蛋白质家族，或该序列可能包含何种结构域或功能位点，应使用A、PROSITE数据库B、DDBJ数据库C、PDB数据库D、PIR数据库3、在蛋白质一级数据库基础上，构建二级数据库应使用A、近邻归并法B、序列比对C、基因融合法D、Entrez4、做DNA结构分析可使用A、GenBank数据库B、PIR数据库C、NDB数据库D、BLOCKS数据库5、向核酸数据库GenBank/EMBL/DDBJ提交数据，应使用下列哪个软件A、BLASTB、SequinC、SRSD、TreeBASE6、在蛋白质序列数据库中比较查询蛋白质序列

4、，应使用A、BLASTnB、BLASTpC、tBLASTnD、BLASTx7、Profiles数据库是A、蛋白质序列数据库B、核酸序列数据库C、蛋白质二级数据库D、蛋白质结构数据库8、TreeBASE系统主要用于A、发现新基因B、系统生物学研究C、类群间系统发育关系研究D、序列比对二、问答题1、为什么说SWISS-PROT是最重要的蛋白质一级数据库？2、构建蛋白质二级数据库的基本原则是什么？3、构建蛋白质二级数据库的主要方法有哪些？4、叙述SCOP数据库对蛋白质分类的主要依据5、试陈述GenBank数据库中一条记录下的主要信息6、解释正则表达式C-Y-X2-[DG]-G-X-[S

5、T]的含义三、填空题1、目前国际上最常用的核酸序列数据库有、和。2、列举至少四种权威的蛋白质二级数据库、、和。3、列举至少五种NCBI的服务项目、、、和等四、名词解释1、基序（motif）2、SNP3、基因家族4、概念性翻译第四章序列分析（问题与练习）一、名词解释1、可读框（ORF）2、剪切变体3、表达标签序列（EST）4、电子克隆5、同义置换6、“垃圾”DNA（junkDNA）7、概念性翻译二、运算题1、按照5'-端到3'-端的顺序写出下列核苷酸的互补序列：5'－ATGCTTGCGGATAGA－3'。2、若一条mRNA序列5'－AUGGGAUGUCGCCGAAAC－3'被核糖体

6、翻译，将形成怎样的氨基酸的序列？若将第一个核苷酸删掉而将另一个A加到mRNA序列的3'-端，又将形成怎样的氨基酸序列？三、问答题1、有哪些信息可用于发现基因？2、陈述BLASTn、BLASTp和BLASTx软件的用途3、解释正则表达式C-Y-X2-[DG]-G-X-[ST]的含义4、试从密码子使用偏向性角度说明编码区和非编码区的区别第五章序列比对（问题与练习）一、名词解释序列比对直系同源并系同源二、问答题序列对位排列的主要用途三、填空题1、蛋白质得分矩阵类型有、、、和等。2、对位排列主要有局部比对和三、运算题1、画出下面两条序列的简单点阵图。将第一条序列放在x坐标轴上，将第二条序

7、列放在y坐标轴上。TGAACTCCCTCAGATATTACGAACCCTCACATATTAGCG2、对两个核酸序列ACACACTA和AGCACACA进行全局比对第六章分子系统发生分析（问题与练习）1、构建系统发生树，应使用A、BLASTB、FASTAC、UPGMAD、Entrez2、构建系统树的主要方法有、、等。3、根据生物分子数据进行系统发生分析有哪些优点？4、在5个分类单元所形成的所有可能的有根系统发生树中，随机抽取一棵树是反映真实关系的树的可能性是多少？从这些分类单元所有可