水稻耐淹涝性状的遗传分析和ssr标记的研究

水稻耐淹涝性状的遗传分析和ssr标记的研究

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1、遗传HEREDITAS(Beijing)28(12):1562~1566,2006研究报告DOI:10.1360/yc-006-1562水稻耐淹涝性状的遗传分析和SSR标记的研究1~32312陈永华,赵森,柳俊,严钦泉,肖国樱(1.湖南农业大学农学院,长沙410128;2.中国科学院亚热带农业生态研究所,长沙410125;3.中南林业科技大学资源与环境学院,长沙410004)摘要:淹涝胁迫对水稻生产造成了严重影响,发掘可应用于耐淹涝辅助选择的分子标记(MAS),将有助于水稻耐淹涝性状的遗传改良。应用耐淹涝材料FR13A和淹涝敏感材料IR39595-503-2-1-2为亲本做正反交获得

2、F1和F2代群体。对正反交的F1群体的耐淹涝性状进行遗传分析,发现正反交的F1代群体在耐淹涝性状上没有显著差异,说明耐淹涝性状是核基因控制。从两次淹涝处理中F2代群体的分离情况来看,来源于FR13A的耐淹特性表现出数量-质量性状遗传的特点。当淹涝胁迫压力比较轻时表现为数量性状遗传,具有微效多基因的作用。当淹涝胁迫压力增大时,表现为主效基因控制的质量性状。在SSR分析中,187对SSR引物中有73对引物在两亲本间有明显的差异,差异率为39%。用这73对差异引物,对F2群体进行多态筛选,结果筛选到一个与耐淹涝性状连锁的标记RM219,验证了耐淹涝性状确实由主效基因Sub1控制,因此,RM

3、219在水稻耐淹涝育种中具有利用价值。关键词:水稻;耐淹涝;SSR标记中图分类号:Q953文献标识码:A文章编号:0253-9772(2006)12-1562-05GeneticAnalysisandSSRMarkerofTolerancetoSubmergenceinRice1~32312CHENYong-Hua,ZHAOSen,LIUJun,YANQin-Quan,XIAOGuo-Ying(1.HunanAgricultureUniversity,Changsha410128,China;2.InstituteofSubtropicalAgriculture,ChineseAca

4、demyofSciences,Changsha410125,China;3.CollegeofResourcesandEnvironment,CentralSouthUniversityofForestryandTechnology,Changsha410004,China)Abstract:Submergencestresshassevereharmtorice(OryzasativaL.)production.Itisimportanttoidentifymolecularmarkersassociatedwithtolerancetosubmergenceformarker-a

5、ssistedselection(MAS).F1andF2populationswareobtainedfromreciprocalcrossesbetweensubmergencetolerantparentFR13AandsubmergencesensitiveparentIR39595-503-2-1-2.NodifferenceinreciprocalcrossesinF1populationwasdetectedfortolerancetosubmergence.Thisindicatesthatthesubmergencecharacteriscontrolledbynu

6、cleicfactor(s).TolerancetosubmergencederivedfromFR13Aappearedtobeaquantitative-qualitativetraitasrevealedbythesegregationofF2populationintwosubmergentexperiments.Underlightsubmergencestress,multipleminorgenesmightworkandthetraitinheritedquantitativelyitappearedaquantitytrait,Whileunderseveresub

7、mergencestress,itexhibitedaqualitativeinheritancecontrolledbyamajorgene.Amongthe187pairsofSSRprimers,73(39%)werepolymorphicbetweenthetwoparentsandwereusedtotagsubmergenceintheF2population.PrimerRM219wasdetectedtobe收稿日期:2006-04-15;

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