hpv阳性和阴性宫颈癌细胞系基因表达谱的研究

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1、HPV阳性和阴性宫颈癌细胞系基因表达谱的研究摘要目的探讨HPV阳性和HPV阴性宫颈癌细胞系基因表达谱的差异，筛选可能与HPV感染相关的差异表达基因。方法常规培养I-IPV阳性宫颈癌细胞系(HeLa和Caski)和HPV阴性宫颈癌细胞系(HT-3和C．33A)，提取细胞总RNA并纯化，采用Agilent人类全基因组表达谱芯片检测基因表达水平，比较HPV阳性和HPV阴性宫颈癌细胞系基因表达谱差异，对差异表达基因进行聚类分析、功能注释和生物反应通路分析，实时荧光定量PCR(Real-timequantitativePCR，qRT-PCR)验证芯片结果。结果①聚类热图和散点图分析，HPV

2、阳性和HPV阴性宫颈癌细胞系之间基因表达谱有明显差异。②芯片检测结果显示，肿V阳性和I-IPV阴性宫颈癌细胞系之间差异表达基因721条，其中401条基因在HPV阳性富颈癌细胞系中表达上调，320条基因表达下调。与肿瘤相关的差异表达基因涉及翻译转录、信号转导、细胞增殖和细胞死亡及凋亡等多种生物学过程。③选取AKRlC3、TREXl、WNT5A、RASSFl、BCLllA、DKK3、FHIT、IGFBP2和IGF2共9条差异表达基因进行验证，qRT-PCR结果与芯片结果基本一致。结论HPV感染可导致I-IPV阳性和HPV阴性宫颈癌细胞系基因表达的差异，差异表达基因涉及多种生物学过程，

3、提示HPV可能通过不同的生物反应通路参与宫颈癌的发生发展。通过对全基因组水平大量差异表达基因综合分析，可为进一步寻找可能的HPV相关肿瘤分子标记物以及宫颈癌早期诊断提供实验基础和理论依据。硕士研究生：于啸(妇产科学)指导教师：王言奎教授关键词：宫颈肿瘤；人乳头瘤病毒；基因表达谱；微芯片GeneexpressiondifferencesinHPV-positiveandHPV-negativecervicalcarcinomaAbstractObjectiveToinvestigatedifferencesofgenome—wideexpressionprofileinhumanp

4、apillomavirus(HPV)positivecervicalcarcinomacelllinesandHPVnegativecervicalcarcinomacelllines．Toscreenthedifferentially—expressedgenesassociated、^，i血HPVinfection．MethodsAgilentexpressionprofilechipswasusedtodetectedgenome-widegeneexpressioninHPV．．poshive(HeLaandCaski)andHPV-negative(nw-3andC一3

5、3A)cervicalcarcinomacelllines．Thedifferentiallyexpressedgenesintwodifferentcelllineswerevalidatedbyquantitativereal—timePCR．Results@HeatmapandscatterplotanalysisshoweddistinctlydifferentgeneexpressionprofileinHPV-positiveandHPV-negativecervicalcarcinomacelllines．②Data．found721genesexpressedsi

6、gnificantdifferentlyinHPV-positiveandHPV-negativecervicalcarcinomacelllineswasobservedhierarchicalclusteranalysisofgeneexpression，401geneswereup-regulatedand320genesweredown-regulated．Genesmayrelatedwithneoplasminvolvevariousbiologicalprocess，includingtranscription，translation，signaltransduct

7、ioncellproliferation，celldeathandcellapoptosis．@SomeofthesedifferentiallyexpressedgenesincludingAKRlC3，TREXl，WNT5A，RASSFl,BCLl1A，DKK3，FHIT,IGFBP2andIGF2werevalidatedbyquantitativereal—timePCR，andtheresultinaccordance、析t11themicroarraychips．Co