小鼠卵巢不同发育阶段的转录组学研究

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1、分类r勺-1‘VDC硕士学位论文密级小鼠卵巢不同发育阶段的转录组学研究TranscriptomeStudiesofMouseOvariesatDifferentDevelopmentalStages作者姓名：罗阳学科专业：发育生物学学院(系、所)：生殖与干细胞工程研究所指导教师：林戈论文答辩日期墨堕三二鱼驾答辩委员会主席中南大学二0一二年五月原创性声明本人声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢的r地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研

2、究成果，也不包含为获得中南大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。作者签名：孥随日期：』生年』月翌日学位论文版权使用授权书本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留学位论文并根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文，允许学位论文被查阅和借阅；学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以采用复印、缩印或其它手段保存学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并通过网络向社会公众提供信息服务。

3、作者签名：＼韭导师签名监日期：盟年』月旦日硕士学位论文中文摘要摘要工作目的：卵巢作为雌性哺乳动物的生殖器官，发挥排卵和分泌类固醇激素的功能，卵巢及其中生殖细胞的发育具有相当的复杂性与重大的意义，迄今为止，其发育过程中还有许多机制和调控机理仍不甚明了。本实验将进行小鼠卵巢及生殖细胞关键发育时期卵巢组织的转录组学研究，通过最新的数字基因表达谱升级版测序(RNA．Seq)及相关生物信息学分析，找出与卵巢和生殖细胞发育相关的基因及分子，为揭示卵巢发育及功能衰老的机制和相关机理提供有用的线索。研究方法：考虑到卵巢和生殖细胞

4、发育的系统性与复杂性，我们将首次全面而系统地将生殖细胞的增殖、形成生殖包囊，到包囊重组产生原始卵泡，以及原始卵泡的早期发育形成初级卵泡，至次级卵泡，最后与卵巢中卵泡基本耗竭的老年小鼠卵巢联系起来；选取涉及上述卵巢及生殖细胞发育关键事件时间点的小鼠卵巢组织，包括胚胎发育第12．5天、出生后第2天，第5天、第10天以及老年小鼠卵巢组织；首先对每个阶段卵巢组织发生的关键发育事件进行验证分析，然后进行卵巢(生殖嵴)组织水平的数字基因表达谱升级版测序(RNA—Seq)及相关信息分析，从而找出与卵巢和生殖细胞发育相关的基因及

5、分子。成果：(1)成功地全面系统验证了实验中所取各阶段卵巢(生殖嵴)本课题受以下基金资助：1．中南大学前沿研究计划前瞻布局研究重大项目：卵巢衰老的分子机制研究(201021200070)硕士学位论文中文摘要组织的关键发育特点。结果显示在胚胎发育第12．5天的生殖嵴中，有大部分的生殖细胞正进行增殖，并以生殖包囊的形式存在；在出生后第2天的小鼠卵巢中，有着大量位置相邻、接触紧密的原始卵泡，表明生殖包囊刚完成重组形成了原始卵泡；在第5天的小鼠卵巢中，原始卵泡仍占有大部分比例，但也有大量的初级卵泡处于发育之中；在出生后第

6、10天的卵巢中同时具有原始卵泡、初级卵泡和次级卵泡的发育；而老年小鼠(16个月)的卵巢中已基本没有卵泡；(2)整个实验中鉴定出有表达的基因有18915个，占小鼠基因总数的63．05％，我们从中得到了大量测序质量良好的差异表达基因：(3)我们完成了差异表达基因的初步筛选和富集工作，进行了一些生殖发育相关基因的特性描述，分析了实验中每个时期的阶段特异性表达特点；(4)发现了一些阶段特异性表达的生殖相关基因，在此基础做进一步的深入细致研究，为阐明雌性哺乳动物生殖发育提供大量有价值的线索。结论：通过RNA．Seq对特定阶

7、段小鼠卵巢组织进行转录组学分析，得到了大量与卵巢及生殖细胞发育相关的基因和分子信息。相信通过进一步的深入研究，有望为阐明卵巢发育及衰老研究提供大量有用的线索。关键词：卵巢，生殖发育，衰老，RNA—Seq，差异表达基因硕士学位论文英文摘要ABSTRACTObjective：Asthereproductiveorgansofthefemalemammals，ovariesplaythefunctionofovulationandsecretingsteroid．Thedevelopmentofovariesandth

8、egermcellshavegreatcomplexity●-●一一●一-andsigniticance．Sotar,manymechanismsinthedevelopmentalprocessareyetuncertain．inthisstudy,wewillmakethetranscriptomestudyofovariantissuesthatatthekeyde