河南四地区野生(鱼骨)形态学和遗传多样性研究

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1、STUDIESoNTHEMOI之PHOLOGYANDGENETICDIVERSITYOFHEMIBARBUSMACULATUSINHENANPROVINCEADissertationSubmiaedTotheGraduateSchoolofHenanNormalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterofScienceByBaoZhanmengSupervisor:Prof.LiXuejunMay,2014摘要鲭(Hemibarbu

2、smaculatus)在分类学上属于硬骨鱼纲,鲤形目,晌亚科,鲼属,味道鲜美、生长较慢、肉质细嫩、是一种在我国广泛分布的较为名贵中小型淡水食用鱼类【1】。由于分布广,其生态、行为和形态会出现一些差异,因此,本研究以线粒体细胞色素氧化酶亚基(COI)为分子标记,对河南野生鳓行了分子系统发育及形态学研究以及对C01作为基因条形码是否适用于绚亚科鱼类的分类进行了分析。所得主要研究结果如下:l河南野生鳓形态差异比较数据处理采用了3种多元统计分析方法,主成分分析方法、聚类分析方法、判别分析方法对四种河南鲭类的可量、可数以及框架形态性状

3、进行了对比研究,结果表明:淇河野生鲭在侧线下鳞、侧线上鳞比对中,均高于其它的3个群体,但南阳鱼骨高于信阳鱼旨的侧线鳞数目;信阳鱼骨在体高、头部大小及臀鳍长度方面明显较小;背鳍长度、躯干部长度、体厚和尾部的高度、长度方面有明显优势,相对于南阳鱼骨群体而言,信阳野生鱼旨与驻马店野生鱼胃,群体的亲缘关系较近;淇河鱼骨与其它3群体绚亚科鱼类相比,形态特异性较显著。2河南野生鲋的分子遗传多样性比较本研究对分子条形码技术对四种河南野生鲼的COI基因同时在一个反应中进行特异性扩增,并与纳亚科鱼类进行比对,得出结果:(1)河南野生鱼旨各群体

4、两条趋势线均没有相交并且转换始终大于颠换;颠换的曲线显示随P—distance的增加,颠换的增加接近某一最大值,有达到饱和的趋势。(2)在938bp排列位点中,编码308个氨基酸,A+T平均含量(54.4%)明显高于G+C(45.6%),转换颠换偏倚率(Ts/Tv)为2.6。(3)信阳鳃的G+C含量(46.3%)大于其他三群体的平均G+C含量(45.7%)。(4)DnaSP分析COI基因序列表明,40个个体分属31个单倍型。单倍型多样性、核苷酸多样性、平均核苷酸差异数分别为0.982、0.00871、8.053。(5)以中华

5、倒刺隹巴的线粒体基因组为外群,用单倍型间遗传距离构建的5种河南野生鲭种群系统进化树,经分析得出结论:信阳、驻马店野生鲭群体之间的遗传距离较小,但二者与南阳、淇河群体遗传距离较大。(6)本研究表明,DNA条形码适用于胸亚科鱼类,基于对绚亚科7种10个体的COI基因序列分析,发现在觞亚科鱼类中COI基因序列可以较好地区分各物种。因此,COI基因序列对该亚科的分类是一个行之有效的DNA条形码序列。关键词:鲴I,形态特征,分子条形码技术,遗传多样性IIABSTRACT,nleHemibarbusmaculatus,belongsto

6、Osteichthyesontaxonomy,Cypriniformes,minnowsubfamily,It’Sfamousforthedelicioustaste,tendermeatandwidelydistributedinourcountry.111eyaremoreexpensiveforsmallandmediumfreshwaterconsumptionoffish(CaoWenxuan,1992).Duetowidedistribution,ecology,behaviorandmorphologyvary

7、widely,thelocationofthesubfamilybetweensystems,andthekindsofquestionsmonophylyofphylogeneticrelationships,isstillacontroversialproblem.Inthisstudy,themitochondrialcytochromeoxidasesubunit(coi)iSusedasmolecularmarkersforwildHmaculatesofHenaninmolecularphylogenyandmo

8、rphologicalstudies.111emainresultsobtainedareasfollows:1Morphologicaldifferencescomparisonofwild月:maculatesWeusethreekindsofmultivariatestatistic

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