正常和子痫前期胎盘的dna甲基化组学研究

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1、後旦大擎万方数据博士学位论文正常和子痫前期胎盘的DNA甲基化组学研究院专姓系：生物医学研究院业：生物化学与分子生物学名：相玉倩指导教师：贺林教授、赵欣之副研究员完成日期：2014年4月6日万方数据目录英文缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯3ABSTRACT⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．7序言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11第l部分孕早期母血和胎盘DNA甲基化谱分析揭示用于无创性产前诊断

2、的胎儿DNA标志物⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l5前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯115一日U舌⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．333讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯56第2部分子痫前期的致病机制研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．59前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯59日U舌⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯’9第一节子痫前期DNA甲基化谱分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．621材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．622结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯673讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯84第二节子痫前期胎盘组织表达谱分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．871材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．872结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．1013讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．116参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯119附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯131附录1：本论文第一部分补充表格(表S．1、表S．2)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯133附录2：攻读博士学位期间论文发表情况和基金⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．171附录3：攻读博士学位期间所获荣誉和奖励⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172附录4：攻读博士学位期间参加会议和培训情况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯173万方数据英文缩略词表缩略词英文、中文全称BMIbpCdCscDNACDSbodymassindex体重指数basepair碱基对criduchatsyndrome猫叫综合征complementaryDNA互补DNAcodingDNAsequence编码DNA序列cffDNAcellfreefetalDNA胎儿游离DNACGIchrCVSDAVIDddH20DEPCDMRDMSEOPETFBSGFPIPALOPETCpGislandCpG岛chromosome染色体chorionicvilluss

6、ampling绒毛膜取样thedatabaseforannotation，visualizationandintegrateddiscovery注释、可视化和整合发现数据库double．distilledwater双蒸水diethylpyrocarbonate二乙基焦碳酸盐differentiallymethylatedregion差异甲基化区域differentiallymethylatedsite差异甲基化位点early-onsetpre—eclampsia早发型子痫前期fetalbovineserum胎牛血清greenfuorescentprotein绿色荧光

7、蛋白IngenuityPathwayAnalysisIngenuity通路分析软件late—onsetpre—eclampsia晚发型子痫前期MALDI-TOF-MSmatrix-assistedlaserdesorption／ionizationtimeofflightmassspectrometry基质辅助激光解析电离飞行时间质谱MeDIP·ChipmethylatedDNAimmunoprecipitationchip甲基化DNA免疫共沉淀芯片1万方数据一墨呈奎兰堕主兰垡丝奎MeDIP—SeqmethylatedDNAimmunoprecipitation