辣椒种质资源的srap分析

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1、福建农林大学2009届硕士学位论文1前言1．1辣椒的起源与遗传演化背景1．1．I辣椒概述辣椒营养丰富，尤其维生素C的含量在蔬菜中名列前茅，是中国人名很喜爱的蔬菜和调味品，可鲜食、炒食、油煎或腌渍供食，也可制成辣椒粉、辣椒油、辣椒酱等加工品。干辣椒是畅销的出口农产品，著名的云南邱北辣椒、陕西秦椒、河南永城辣椒和福建宁化辣椒等，远销美国、加拿大、新西兰、日本、新加坡、马来西亚、斯里兰卡和缅甸等国，深受国际市场欢迎。辣椒为茄科(Solanaceae)辣椒属(Capsicum)多年生灌木、半灌木或一年生草本植物。辣椒原产中、南美洲、墨西哥、秘鲁等地。公元前6500．5000年，在墨西哥中部拉瓦堪山的

2、遗迹中曾有辣椒种子出土；Safford(1926)在南美秘鲁公元前2000年的古墓中，发现干辣椒和栽培种子。直到现在，还有一些印第安人采集野生椒，拿到市场上出售。野生椒是古代印第安人喜欢的食物，其重要性仅次于当时粮食作物中的玉米和木薯。直到16世纪欧洲人才知道辣椒。哥伦布旅行返回时将辣椒引入了西班牙。1548年由地中海区域栽培扩展到了英格兰。16世纪末传到中欧(Boswen，1949)。1885年以前，葡萄牙人从巴西把辣椒带到印度。我国虽然不是辣椒的原产地，但在20世纪70年代在云南西双版纳原始森林中发现野生椒中的小米椒。从分类学来讲，我国辣椒种质资源分属于C．annuum和C．futesc

3、en两个种。我国几乎所有的栽培种包括甜椒、辣椒、朝天椒、簇生椒等都属于C．annuum。庄灿然(1995)[1】认为与亚热带地区也可能是辣椒的起源地之一，归属于亚洲热带起源中心。1．2辣椒种质资源研究现状辣椒起源并在世界范围内的传播过程中，发生了分化，现今辣椒品种资源丰富，类型多种多样，为辣椒资源的开发利用提供了宝贵的遗传资源。辣椒的分类研究是认识和利用辣椒资源的基础。因而，加强辣椒种质资源的研究，对于促进；辣椒种质资源的有效利用具有非常重要的意义。目前辣椒的分类总结起来主要有形态学分类、细胞学分类、生物化学和分子生物学的现代分类。辣椒种质资源的分类早期主要采用系统分类法，其依据主要是辣椒的

4、形态性4福建农林大学2a09届硕士学位论文状、尤其是成株期生殖器官的形态特征，目前应用的仍然很多，但这些形态特征往往易受环境条件的影响，从而使结果产生误差。随着现代细胞学、生物化学等的发展，辣椒分类及种间关系的研究进入了一个新阶段，人们试图应用现代细胞学、生物化学和植物化学手段来进一步完善辣椒的分类。Egawa(1984，1986)口】运用细胞学的手段分析辣椒种、变种、品种之间的关系，结果说明C．fruutescens与Cchinense关系较近，与C．annuum关系次之，与C．annuum与C．baccatum关系最远。Market和Moiler(1959)指出了同工酶的概念。随着对同工

5、酶的结构功能、基因表达、染色体基因定位等研究的深入展开，它在植物遗传育种中的应用也越来越广泛。在形态学性状分类基础上，人们试图用同功酶法研究辣椒的类型差异和亲缘关系，Mcleod(1983)131第一次采用同工酶技术分析了辣椒属的种质资源，发现Est-7是区分白花组和紫花组的特征酶带，其后他们又采用多种酶系对多种材料进行了研究，认为C．cardenasii及C．eximium应该归属于同一种。马德华(1987)【4】在研究了辣椒过氧化物同工酶、儿茶酚酶同工酶、细胞色素氧化酶同工酶种间酶谱特征差异的基础上，根据不同种不同酶带出现频率的高低，与聚类法相结合，研究了7个种及6个变种间的亲缘关系。他

6、们的研究结果表明，由于同工酶足基因表达的直接产物，其分析能够较直接判断基因的存在及其表达规律，比较不同对象之间的基因差异。但是由于同工酶是基因表达的直接产物，易受环境、栽培条件和植物生长阶段的影响，同工酶标记的基因位点数目少，多态性水平低，重复性不好等，因此，同工酶对鉴定辣椒种质的亲缘关系也存在许多不足之处。1980年Botstein等首次提出了DNA限制片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPofymorphism，I心LP)的概念，并指出IULP可作为遗传标记，从此开创了利用DNA多态性进行分子标记的新阶段。随着DNA聚合酶链式反应PCR技术的诞生，推动产生了

7、许多新型的分子标记，如随机扩增多态DNA(RandomAmplifiedPolymorphismDNA，RAPD)标记、微卫星DNA(SimpleSequenceRepeats，SSR)标记等。分子标记技术在DNA水平上反映性状的遗传差异，不受季节和环境条件等影响，分析手段快速简便，与发育时期也无关，结果可靠，可提供完整的遗传信息，被广泛应用于遗传图谱的构建、基因定位与筛选及遗传多样性分析等各方面研究。福建农