利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建、重要性状qtl发掘及近等基因系创制

利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建、重要性状qtl发掘及近等基因系创制

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时间:2019-02-26

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1、万方数据SichuanAgriculturalUniversityMasterDissertationConstructionofGeneticMapUsingGenotypingChips,QTLdetectionofimportanttraitsandcreatingofNILsByHong—JunMoDirectedbyProf.Yu--MingWeiDr.Y-a.XiLiuJune,2014万方数据论文独创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知,除了文中特别加以

2、标注和致谢的地方外,学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:pz肜年\/关于论文使用授权的声明,阳rf日本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传

3、播学位论文的全部或部分内容。碱蚣名移导师签名:名锄易ff年6月‘1日伤僻<月“日万方数据摘要小麦是世界重要的粮食作物。小麦的许多重要农艺性状(旗叶性状、穗部性状、籽粒性状)和品质性状是由多基因控制的数量性状。构建高密度遗传图谱,进行小麦性状的基因定位,有助于开发分子标记辅助选择的实用性标记,进行利于相关基因的挖掘和利用。本研究以H461xCNl6的重组白交系(recombinantinbredlineI吼)群体为作图群体,利用90k小麦SNP基因芯片技术,对包含188个家系的RIL群体(F7)进行多态性分析,构建高密度遗

4、传图谱,并利用MapQTL5.0的多QTL模型(MQM),对29个重要农艺性状(分蘖数、旗叶长、穗粒数、籽粒性状表面积、周长等)及9个品质性状(蛋白质含量、籽粒硬度,淀粉含量等)共38个性状进行了QTL定位分析;通过H461xCNl6的多次自交,在高世代后代中选育目标性状为分蘖数的近等基因系。取得的主要结果如下:1、构建了包括43个连锁群的分子遗传图谱,成功连锁到除2D、5D、6D外的18条染色体,该图谱共含有6573个多态性SNP标记,覆盖的遗传距离长2647.02cM,标记间平均距离小0.4cM。A组标记共2696个

5、,占总标记数41%,总长1130.92cM,平均间距0.42cM,共建立19个连锁群;B组包含最多标记,占总标记数47.1%,共3094个,总长1164.82cM,平均间距0.38cM,共建立18个连锁群;D组共684个,占总标记数10。4%,共684个,总长330。44cM,平均间距0.48cM,共建立5个连锁群;99个标记同时位于2A/2B/2D染色体,构建一个连锁群。2、利用遗传图谱,运用作图软件MapQTL5.0的MQM作图法,对2013年-2014年,温江、雅安2个环境下的表型进行QTL分析,共检测到124个加

6、性效应QTL,分布在除1A、3A、5A、7A、3B、3D、5D、6D的13条染色体,单个QTL可解释表型变异率6%.19.5%,共41个主效QTL。12个QTL在雅安、温江点同时被检测到,其中四个主效QTL。3、农艺性状QTL。共检测到共77个与田间农艺性状相关的QTL,12个QTL在温江、雅安可同时被检测到,共检测到26个主效QTL。所有QTL位于2A、4A、6A、2B、4B、5B、2D、4D、7D9条染色体上,单个QTL可解释表型变异率7.4%.19.5%,62个QTL加性效应来自亲本H461,其余来自CNl6。分蘖

7、数、旗叶长、穗下节问长、穗颈节长、小穗数检测到新的QTL位点。共检测到13个籽粒性状QTL,分布于1B、7B、1D三条染色体,单个QTL可解释表型变异率6.2%.10.7%,5个QTL加性效应来自亲本H461,8个来自CNl6。共检测到2个主效QTL。万方数据4、品质性状QTL。共检测到34个品质性状QTL。分布于3B、5B染色体,单个QTL可解释表型变异率7.9%.11.3%,26个QTL加性效应来自亲本H461,8个来自CNl6。共检测到13个主效QTL。籽粒硬度、Zeleny沉降值、面团形成时问、面团最大拉伸阻力、

8、面包体积检测到新的QTL位点。5、“一因多效”QTL区段。在7条染色体上(2A、2B、2D、4B、5B、7B、7D)共形成13个“一因多效”QTL区段。如,同时影响分蘖数、小穗数、小穗密度的区段;同时控制籽粒曲线长与籽粒投影面积的区段;可同时控制zeleny沉降值与面团形成时间的区段。6、近等基因系创制。成功获得两对

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