关于hrm及其在植物育种中的应用展望

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1、中国农学通报2011,27(03):10-14ChineseAgriculturalScienceBulletinHRM及其在植物育种中的应用展望罗文龙,郭涛,王慧,刘永柱,张建国,陈志强(国家植物航天育种工程技术研究中心,广州510642)摘要:HRM(highresolutionmelting,高分辨率熔解曲线)分析基于监测双链DNA升温变性解链的熔解曲线,是新发展起的一种基因突变扫描及SNPs(singlenucleotidepolymorphisms,单核苷酸多态性)鉴定技术。由于在灵敏度和准确性上具有突出的优点,HRM近几年来在突变扫描、基因

2、分型、DNA甲基化研究中得到广泛应用。本文简述了HRM的原理及特点,同时结合HRM分析植物群体的实例,对HRM在植物育种中的应用进行了展望。关键词:HRM;植物育种;展望中图分类号:S330文献标志码:A论文编号:2010-2188ApplicationofHighResolutionMeltingAnalysisinPlantBreedingLuoWenlong,GuoTao,WangHui,LiuYongzhu,ZhangJianguo,ChenZhiqiang(NationalEngineeringResearchCenterofPlantSpa

3、ceBreeding,Guangzhou510642)Abstract:HRM(highresolutionmeltinganalysis),whichbasedonmonitoringmelting(dissociation)curvesofdouble-strandDNA,isarecentadvanceforthedetectionofmutationsandSNPs(singlenucleotidepolymorphisms).Duetoitsoutstandingperformanceatsensitivityandaccuracy,HRMh

4、asbeenlargelyusedformutationscanning,genotypingandDNAmethylationresearchinrecentyears.Inthispaper,themechanismandfeatureofHRMwereintroducedbriefly;furthermore,theprospectsofitsapplicationinplantbreedingwereprovidedbycombiningwiththecasesofHRMinanalyzingplantpopulations.Keywords:

5、HRM;plantbreeding;prospect0引言1HRM的原理及操作流程HRM(highresolutionmeltinganalysis,高分辨率1.1原理及发展历程熔解曲线分析)是由犹他大学和爱德华科技公司合作核苷酸双链的热稳定性由其碱基组成、长度和开发的一种SNP(singlenucleotidepolymorphism,单核GC含量决定,序列改变会引起升温过程中双链核苷[1-2]苷酸多态性)以及突变研究的工具,这种检测方法因酸解链行为的改变。结合实时PCR技术,实时监测核其操作简便快速,成本低结果准确,并且实现了真正的苷酸双链熔解过程

6、荧光信号的积累,就能直观地看到闭管操作而受到普遍的关注。目前,HRM的应用研究双链熔解随温度变化曲线的差异,可对PCR产物的差[3]主要集中在人及微生物上,在植物育种中的研究报道异进行分析,即实时PCR熔解曲线分析。在仪器精较少。鉴于HRM的操作与后期数据分析简单易懂,密度提高的基础上,配合饱和染料就出现了HRM分将其应用到植物育种中,可极大提高种质资源的筛选析技术。利用、基因分型、SNP标记开发的效率,具有广阔的应在较早期的实时PCR技术中,SYBRGreenI是双用前景。链DNA最常用的荧光标记物,但是SYBRGreenI是基金项目:国家自然科学基

7、金“水稻赤霉素传导抑制突变基因iga-1的分子定位及功能研究”(30771313)。第一作者简介:罗文龙,男,1987年出生,在读硕士,研究方向:植物航天育种。通信地址:510642广东广州市天河区华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心,E-mail:lovenlong@163.com。通讯作者:陈志强,男,1956年出生,教授,博士生导师,硕士,主要从事水稻遗传育种研究。通信地址:510642广东广州市天河区华南农业大学科技楼713室国家植物航天育种工程技术研究中心,Tel:020-85280005,E-mail:chenlin@scau.ed

8、u.cn。收稿日期:2010-07-16,修回日期:2010-09-03。罗文龙等:HRM及其

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