核酸检测篇5-RACE技术

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1、编号：2-5主题：RACE技术概述：近年来随着生物技术的不断发展，出现了许多克隆新基因的方法和手段，cDNA末端快速扩增技术（rapidamplificationofcDNAends，RACE）是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3'末端的有效方法，以其简单、快速、廉价等优势而受到越来越多的重视。目的：1.可用于cDNA文库的构建及筛选。2.应用RACE克隆已知片段的旁侧内部序列。3.RACE可用于克隆同源基因的同源片段，为寻找同源基因提供了一种手段。4.RACE技术与生物信息学,例如EST库相结合,具有快速,高效克隆新基

2、因的特点。原理：RACE是采用PCR技术由已知的部分cDNA顺序来扩增出完整cDNA5’和3’末端，是一种简便而有效的方法,包括单边PCR和锚定PCR。操作步骤：1、3’RACE-PCR3’-RACE的步骤是:利用mRNA的3’末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点，以连有SMART寡核营酸序列通用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准第一链cDNA。然后用一个基因特异引物GSP1(genespecificprimer,GSP)作为上游引物，用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,U

3、PM)作为下游引物，以cDNA第一链为模板,进行PCR循环，把目的基因3’末端的DNA片段扩增出来。2、5’RACE-PCR5‘-RACE的步骤是先利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点，以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下，反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性，在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3-5个(dC)残基，退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后，转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头。然后用一

4、个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作为上游引物，用一个基因特异引物2(GSP2genespecificprimer,GSP)作为下游引物，以SMART第一链cDNA为模板，进行PCR循环，把目的基因5‘末端的cDNA片段扩增出来。最终，从2个有相互重叠序列的3'/5‘-RACE产物中获得全长cDNA，或者通过分析RACE产物的3‘和5‘端序列，合成相应引物扩增出全长cDNA。