血红蛋白结构分析

《血红蛋白结构分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。

1、动物血红蛋白结构分析1、研究进展脊椎动物hemoglobin（Hb）蛋白有4个亚基构成，为a2P2结构，每个亚基均有1条多肽链和具有1个亚铁离子的血红素分子构成，含有1个血红素基团和1个氧结合部位，形成珠蛋白，结合4个血红素基团之后变形成了血红蛋白⑴。当血红蛋白与氧结合时，形成氧合血红蛋白，从而使得血液呈鲜红色⑵。血红蛋白的载氧功能与其亚基结构的2种状态有关，在缺氧组织（如肌肉组织）中，亚基处于紧张状态（T状态），使氧不能与血红素结合，所以在需氧组织里可以快速地脱下氧，将氧气释放，而在含氧丰富的肺或鲍中，亚基结构呈松弛

2、状态（R状态），使氧极易与血红素结合，从而迅速地结合氧气，将氧运载至需氧组织叭人血红蛋白自身可以产生NO,可以帮助把氧气输送到各种人体组织，起到扩张血管和稳定血压的作用⑶。血红蛋白可以维持机体内环境的酸碱稳定，具有波尔效应⑴。人血红蛋白的研究在疾病方面也较多：如利用血红蛋白可以作为检测一些疾病的指标等。啮齿类动物等的脑血红蛋白行使贮存氧气的功能，以保证当氧气供应不足时，大脑的氧气浓度的暂时恒定⑷。2、立体依据动物血红蛋白不仅具有运载氧气的功能，还具有氧化酶活性、过氧化物酶活性和抗菌等功能。动物血红蛋白功能及结构千差万别

3、，尤其是无脊椎动物，保守性较低•但是其主要功能一一氧运载蛋白功能没有改变；由于血红蛋白的某些结构的变化，从而可以使得血红蛋白获得新的功能。研究动物血红蛋白的结构对揭示生物进化具有重要意义⑸。3、研究内容对血红蛋白进行基本性质分析、亚细胞定位分析、跨膜性质分析、二级结构预测、三级结构预测等。4、研究方案4.1血红蛋白序列的获得进入BCBI主页选择protein搜索hemoglobin,以fasta格式保存。4.2基木性质分析4.2.1进入网址：expasy.org/tools/#proteome；4.2.2选择Prima

4、rystructureanaslysis的ProtParam程序；4.2.3在对话框屮输入血红蛋白原序列，点击分析；4.2.4记录结果并分析。4.3亚细胞定位4.3.1进入PS0RT主页:http://psort.nibb.ac.jp；4.3.2将血红蛋白原序列输入对话框，点击分析；4.3.3记录结果并分析。4.4跨膜性质预测4.4.1进入网址：http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM；4.4.2在对话框中输入血红蛋白原序列，点击分析；4.4・3记录结果并分析。4.5二级结构分析4.5.

5、1进入JPred主页，点击Email结果提交方式，输入血红蛋白原序列；4.5.2设置各项参数，点击Run提交；4.5.3在邮箱中找到结构地址，进行查看；4.5・4记录结果并分析。4.6三级结构分析4.6.1进入SWTSS-MODLE三级结构预测服务器；4.6.2填写Email地址，选择FirstApproachmode4.6.3在Resultoption选择Awiss-PdbViewermode；4.6.4提交序列；4.6.5将邮箱中返回的PDB文件用rasmol软件浏览，用Awiss-PdbViewer软件进行简单分

6、析。5、结果分析与评价5.1血红蛋口序列>gi11607971gb

7、AAA29796.1hemoglobin[Pseudoterranovadecipiens]MHSSIVLATVLFVAIASASKTRELCMKSLEHAKVGTSKEAKQDGIDLYKHMFEHYPAMKKYFKHRENYTPADVQKDPFFIKQGQXILLACHVLCATYDDRETFDAYVGELMARHERDHVKVPNDVWNHFWEHFIEFLGSKTTLDEPTKHAWQETGKEFSHETSHHGRHSVRDHCMNSLEYTA

8、TGDKEHQKQNGTDLYKHMFEHYPHMRKAFKGRENFTKEDVQKDAFFVNKDTRFCWPFVCCDSSYDDEPTFDYFVDALMDRH1KDD1HLPQEQWHEFWKLFAEYLXEKSIIQIILTEAEKIIAWSTIGEDFAI1EADKI1AKAEKD1IIIEGEIIKEEIII15.2基木性质分子式:Ci772H2616N490O515S16总原子数：5409；氨基酸数:333；相对分子质量:39536.2；等电点：5.96；负电荷氨基酸数：60,正电荷氨基酸数：42,呈酸性。

9、各氨基酸数量及所占比例：氨基酸AlaArgAsnAspCysGinGluGlyHislieLeu个数24119277113312331418比例％7.23.32.7&12.13.39.93.69.94.25.4氨基酸LysMetPheProSerThrTrpTyrVaiPylSec个数31922915147121500比例％9.3