山羊thrsp基因多态性与体脂沉积及生态因子的关联性

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1、安徽农业大学硕士学位论文山羊THRSP基因多态性与体脂沉积及生态因子的关联性姓名：秦婕申请学位级别：硕士专业：动物遗传育种与繁殖指导教师：陈宏权201206摘要本研究以圭山，云岭，川东，板角，湘东，马头和安徽白山羊7个中国地方山羊品种以及波尔和萨能2个引入品种为研究对象，采用PCR．RFLP技术结合DNA测序检测9个品种山羊T腿SP基因5’调控区及外显子l的多态性，分析其与山羊栖息地和产脂能力的关联性，为我国山羊品种的保护和利用提供科学依据。研究利用山羊背最长肌脂肪含量评级(ⅧG)和胴体脂肪含量评级(CFG

2、)来评估山羊的脂肪沉积能力，利用山羊栖息地的平均日降雨量(ADR)、海拔高度(E)、平均日照时间(DSD)、纬度(LAT)和经度(LON)、空间系数(SC=E／LAT)，能量系数(EC=ADR×DSD)和生态指数(EI=SC×EC)作为生态因子的评价参数，分析THRSP变异与山羊脂肪沉积能力及栖息地生态因子之间的关联性。结果表明：1、在所有供试山羊中，检测到THRSP基因在5’调控区存在C．233T多态位点，在外显子1中存在G113A和A138G多态位点。经过序列比较，山羊THRSP基因5’调控区核苷酸序列

3、与牛和人类的同源性分别为97％和80％，外显子1与猪和牛的同源性为88％和95％。潜在的启动子区域位于起始密码子ATG上游．81~-32bp。转录因子结合位点分析表明，在5’调控区存在9个E盒、1个CCAAT框和2个ATTGG盒；C-233T位点是NF．KB转录因子的结合位点。在外显子1发现的G113A位点能引起蛋白质发生A曜38Gln氨基酸替换。2、3个多态位点在9个山羊品种中共检测到9种联合基因型，其中TCAAGG、TTGAAG和TTAAGG型的基因型频率均低于0．05；113G和138A在9个山羊品种

4、中均是优势基因，而223C和223T在不同品种中的分布则体现出特异性，湘东黑山羊(0．7155)、圭山山羊(O．6490)和云岭山羊(O．6136)携带233C的频率均在O．6以上。遗传距离分析显示，湘东黑山羊分别与其他山羊品种的距离较大，而圭山山羊、云岭山羊和马头山羊之间的距离则较近。3、CAG单倍型频率(0．8859，P均<0．01)与EC显著相关，TGA单倍型频率与EI显著相关(一O．8377，P均<0．025)。在4个单倍型频率中，CAG单倍型频率和MFG之间存在显著相关(．0．8633，P均<0．

5、025)。本研究结果初步表明THRSP基因的多态性与生态因子和脂肪沉积显著相关。关键词：THRsP基因，多态性，山羊品种，生态因子，脂肪沉积AbstractTbunderstandtheassociationofTHRSPgene、Vithhabitatsandfattydepositsingoatbreeds，thepolymorphismsofgoatTHRSPgene，thefatcomentofgoatcarcassandtheirassociationwiththeecologicalfactor

6、swereinVestigated．TheCllineseindigenousgoatbreedsselectedwereGuisllan，YunliIlg，Chuandong，Ba巧iao，Xiangdong，MatouandAnbai．WhiletheimponedgoatbreedswereBoergoatandSa姐Goat．Thepolymo叩llismsint11e5’regulatoryregionandexon1ofTHRSPgenewereamlyzedusingPCR-RFLP．Thel

7、ongissimusmuscle伍tgrade(^御FG)andcarcassfatgrade(CFG)ofallgoatbreedswereestimated．TheobserveddataofecologicalfhctorswereproVidedbythemeteorologicalobservatoryingoathabitats，whichincludedaVeragedailyrainfall(ADR)，elevation(E)，aVeragedailys眦s11ineduration(DSD

8、)，latitude(LAr)andlongitude．E／LAr，ADR×DSDandSC×ECwrereregardedasspacecoemcient(SC)，energycoefficient(EC)andecologicalindex(EI)，respectiVely．Theresultsasfollows：1．Tllreemutatiomlsites，C_233T，G113AandA138Qwered