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时间:2019-02-19
《山羊thrsp基因多态性与体脂沉积及生态因子的关联性》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、安徽农业大学硕士学位论文山羊THRSP基因多态性与体脂沉积及生态因子的关联性姓名:秦婕申请学位级别:硕士专业:动物遗传育种与繁殖指导教师:陈宏权201206摘要本研究以圭山,云岭,川东,板角,湘东,马头和安徽白山羊7个中国地方山羊品种以及波尔和萨能2个引入品种为研究对象,采用PCR.RFLP技术结合DNA测序检测9个品种山羊T腿SP基因5’调控区及外显子l的多态性,分析其与山羊栖息地和产脂能力的关联性,为我国山羊品种的保护和利用提供科学依据。研究利用山羊背最长肌脂肪含量评级(ⅧG)和胴体脂肪含量评级(CFG
2、)来评估山羊的脂肪沉积能力,利用山羊栖息地的平均日降雨量(ADR)、海拔高度(E)、平均日照时间(DSD)、纬度(LAT)和经度(LON)、空间系数(SC=E/LAT),能量系数(EC=ADR×DSD)和生态指数(EI=SC×EC)作为生态因子的评价参数,分析THRSP变异与山羊脂肪沉积能力及栖息地生态因子之间的关联性。结果表明:1、在所有供试山羊中,检测到THRSP基因在5’调控区存在C.233T多态位点,在外显子1中存在G113A和A138G多态位点。经过序列比较,山羊THRSP基因5’调控区核苷酸序列
3、与牛和人类的同源性分别为97%和80%,外显子1与猪和牛的同源性为88%和95%。潜在的启动子区域位于起始密码子ATG上游.81~-32bp。转录因子结合位点分析表明,在5’调控区存在9个E盒、1个CCAAT框和2个ATTGG盒;C-233T位点是NF.KB转录因子的结合位点。在外显子1发现的G113A位点能引起蛋白质发生A曜38Gln氨基酸替换。2、3个多态位点在9个山羊品种中共检测到9种联合基因型,其中TCAAGG、TTGAAG和TTAAGG型的基因型频率均低于0.05;113G和138A在9个山羊品种
4、中均是优势基因,而223C和223T在不同品种中的分布则体现出特异性,湘东黑山羊(0.7155)、圭山山羊(O.6490)和云岭山羊(O.6136)携带233C的频率均在O.6以上。遗传距离分析显示,湘东黑山羊分别与其他山羊品种的距离较大,而圭山山羊、云岭山羊和马头山羊之间的距离则较近。3、CAG单倍型频率(0.8859,P均<0.01)与EC显著相关,TGA单倍型频率与EI显著相关(一O.8377,P均<0.025)。在4个单倍型频率中,CAG单倍型频率和MFG之间存在显著相关(.0.8633,P均<0.
5、025)。本研究结果初步表明THRSP基因的多态性与生态因子和脂肪沉积显著相关。关键词:THRsP基因,多态性,山羊品种,生态因子,脂肪沉积AbstractTbunderstandtheassociationofTHRSPgene、Vithhabitatsandfattydepositsingoatbreeds,thepolymorphismsofgoatTHRSPgene,thefatcomentofgoatcarcassandtheirassociationwiththeecologicalfactor
6、swereinVestigated.TheCllineseindigenousgoatbreedsselectedwereGuisllan,YunliIlg,Chuandong,Ba巧iao,Xiangdong,MatouandAnbai.WhiletheimponedgoatbreedswereBoergoatandSa姐Goat.Thepolymo叩llismsint11e5’regulatoryregionandexon1ofTHRSPgenewereamlyzedusingPCR-RFLP.Thel
7、ongissimusmuscle伍tgrade(^御FG)andcarcassfatgrade(CFG)ofallgoatbreedswereestimated.TheobserveddataofecologicalfhctorswereproVidedbythemeteorologicalobservatoryingoathabitats,whichincludedaVeragedailyrainfall(ADR),elevation(E),aVeragedailys眦s11ineduration(DSD
8、),latitude(LAr)andlongitude.E/LAr,ADR×DSDandSC×ECwrereregardedasspacecoemcient(SC),energycoefficient(EC)andecologicalindex(EI),respectiVely.Theresultsasfollows:1.Tllreemutatiomlsites,C_233T,G113AandA138Qwered
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