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《桉树焦枯病菌abc转运蛋白的鉴定与分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、檢树焦枯病菌ABC转运蛋白的鉴定与分析刘宏毅陈全助叶小真陈慧洁李慧敏冯丽贞福建农林大学林学院福建农林大学金山学院摘要：［口的］利用生物信息学方法探讨ABC转运蛋口在焦枯病菌对桜树侵染过程屮的解毒作用，为揭示枝树焦枯病致病机制奠定基础。［方法］本文利用BLAST.HMMER、Pfam数据库、TCDB数据库在全基因组内对桜树焦枯病菌的ABC转运蛋白进行鉴定和分类，并通过ProtCamp和IBS分别进行亚细胞定位和结构域图绘制,依据同源性对其功能进行推测分析。［结果］表明:扌安树焦枯病菌共有70个ABC转运蛋白，它们分属于8个亚族。71%的转运蛋白位于细胞膜，10%位于液泡，其余部
2、分位于线粒体、过氧化物酶体、内质网等内膜系统上。枝树焦枯病菌ABC转运蛋白包含全分子、四分之三分子、半分子及四分之一分子。根据同源性推测桜树焦枯病菌ABC转运蛋白与MDR、PDR、HMT、MPE、STE、P-FAT等几种转运蛋白具有较高相似性，同时还与核糖体合成、翻译、过氧化物酶体合成的ABC转运蛋白具有较高相似性。［结论］桜树焦枯病菌ABC转运蛋白除作为外排泵转运外源化学物质、疏水性化学分子等物质。还参与细胞代谢、翻译、核糖体的合成、mRNA的输出、B氧化，并通过为辅酶Q的辅助因子增强呼吸代谢等多项生命活动为焦枯病菌的侵染提供能量。关键词：核树;焦枯病菌;ABC转运蛋口；结
3、构域;亚细胞定位;作者简介：刘宏毅（1990—）,男，硕士研究生•主要从事森林病理学研究.E-mail:fjliuhongyi@126.com作者简介：叶小真，女，讲师.主要从事森林病理学研究.E-meii1:lisayxz@163・com收稿日期：2016-07-14基金:福建省财政厅项目(K81150002>K81139238、K8112004A)IdentificationandAnalysisofABCTransporterinCalonectriapseudoreteaudiiLIUHong-yiCHENQuan-zhuYEXiao-zhenCHENHui-jieL
4、IHui-minFENGLi-zhenForestryCollege,FujianAgricultureandForestryUniversity;JinshanCollege,FujianAgricultureandForestryUniversity;Abstract：[Objective]UsingbioinformaticsmethodtoinvestigatethedetoxificationofABCtransportersinCalonectriaduringtheprocessinfectingEucalyptus,andtoprovidereferences
5、forrevealingthepathogenicmechanismofCalonectria.[Method]UsingBLAST,HMMER,Pfamdatabase,TCDBdatabasetoindentifyandclassifytheABCtransporterofCalonectriawithinthewholegenome,domainstructureschemeandtopredictsubcellularlocalizationandthewithProtCampandTBS,respectively.[Result]Calonectriahasatot
6、alof70ABCtransporters,whichbelongto8subfamilies.71%ofthetransportersarelocatedinthecellmembrane,10%inthevacuole,andtherestinthemitochondria,peroxisome,endoplasmicreticulumandotherendometrialsystems.CalonectriaABCtransporterhas4typesofmolecules,containsfull-sizemolecules,3/4molecules,halfmol
7、eculesand1/4molecules.AccordingtothehomologyitisestimatethatCalonectriaABCtransportershashighsimilaritywithMDR,PDR,HMT,MPE,STE,P-FATandothertransporters.ItalsohashighsimilaritywiththeABCtransportersrelatedtothesynthesisofribosome,translationandsynthesiso
