镜鲤酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的qtl分析

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101082上海海洋大学硕士学位论文题目：镜鲤酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的QTL分析MappingQTLsofactivityofacidphosphataseand英文题目：alkalinephosphataseforcommoncarp专业：水产养殖研究方向：鱼类遗传育种姓名：尹森指导教师：孙效文二O一二年四月十五日上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不

2、包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指

3、导教师签名：日期：年月日日期：年月上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注严云勤东北农业大学教授主席孙仲武东北林业大学教授委员滕春波东北林业大学教授委员张晓锋黑龙江水产研究所副研究员秘书答辩地点黑龙江水产研究所答辩日期2012-5-25上海海洋大学硕士学位论文镜鲤酸性磷酸酶和碱性磷酸酶的QTL分析摘要本研究以镜鲤(CyprinuscarpioL.)全同胞家系为材料，利用微卫星（SSR）标记进行基因组扫描，构建鲤鱼遗传连锁图谱，并采用半同胞家系的分析策略对肠组织的酸性磷酸酶（ACP）活性和肠肝两组织的碱性磷酸酶(ALP

4、)活性进行了QTL定位分析。研究结果如下：1.遗传连锁图谱的构建通过JoinMap4.0软件对分子标记进行连锁分析，偏分离标记315个，偏分离比例占28%，其中992个SSR标记发生连锁，共组成51个连锁群，覆盖基因组总长度为5183.9cM，标记间平均距离为5.22cM，谱的覆盖率为88.8％。构建连锁群中最大的为第51连锁群，由9个标记组成，图距为148.8cM；最小连锁群为第9连锁群，由9个标记组成，图距为42.2cM；其中第1连锁群具有最高分辨率，由40个标记覆盖72.4cM，标记间平均距离为1.85cM。2．鲤鱼肠组织和肝脏组织

5、中碱性磷酸酶活性及肠组织酸性磷酸酶活性QTL定位研究肠组织碱性磷酸酶分析，检测到2个与碱性磷酸酶活性相关的QTL区间均为95%染色体水平显著性，其中一个QTL位于LG8(HLJ2634-HLJ3465)，95%置信区间为0-2cM，可解释表形变异率为7.3%；另一个QTL位于LG13(CA2278-CA246)，95%置信区间为23-28cM，可解释表形变异率为7%。肝脏组织中碱性磷酸酶分析，检测到2个与碱性磷酸酶活性相关的QTL区间均为95%染色体水平显著性，其中一个QTL位于LG8（HLJ1244-2-HLJ1897），95%置信区间

6、为72-76cM，可解释表形变异率为20.1%；另一个QTL位于LG41(CA642-HLJ495)，95%置信区间为52-54cM，可解释表形变异率为8.3%。肠组织酸性磷酸酶分析，检测到5个与酸性磷酸酶活性相关的QTL区间。与酸性磷酸酶活性相关的5个QTL中，1个QTL为99%基因组水平显著性，位于LG28（CA2263-HLJ2873），99%置信区间为18-43cM，可解释表型变异率为39.9%；4个QTL为95%染色体水平显著性，分别位于LG2（CA2049-CA2371），I上海海洋大学硕士学位论文LG14（HLJ3275-C

7、A174）和（CA1276-CA2208）、LG25（HLJ2941-HLJ3946），95%置信区间分别为0-10cM、84-86cM、96-103cM和71-84Cm,可解释表型变异分别为10.0%、8.3%、8.1%和9.9%。3.肝脏组织碱性磷酸酶活性连锁的微卫星标记的BLAST比对结果通过BLAST将与肝脏ALP活性相关的QTL两端的SSR标记与斑马鱼全基因-10组序列数据库进行序列比对，取期望值≤1e的基因注释，结果显示：第8连锁群定位的QTL区间两端的微卫星标记HLJ1897和HLJ1244分别与斑马鱼13号染色体的NW00

8、1877335.3和NW001877356.3同源；同样比对第41号连锁群定位的QTL区间两端微卫星标记HLJ3948和HLJ495分别与斑马鱼13号染色体NW001877341.3和NW00