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1、微生物学通报Apr.20,2017,44(4):881−889MicrobiologyChinahttp://journals.im.ac.cn/wswxtbcntongbao@im.ac.cnDOI:10.13344/j.microbiol.china.160603专论与综述从微生物组到合成功能菌群1,2111,2*刘炜伟吴冰向梅春刘杏忠(1.中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101)(2.中国科学院大学生命科学学院北京100049)摘要:微生物组是指特定微环境中的微生物群落及其组学,自然
2、界中的生物过程几乎都是通过微生物组完成的。随着测序技术的发展和成本降低,微生物组已经成为微生物生态学研究的热点领域。继合成生物学之后,基于微生物组的合成功能菌群研究正在兴起,在人类健康、农业、工业和生态等领域都有广泛的应用前景。本文从微生物组到合成功能菌群的角度系统论述了其在不同领域的研究现状与发展趋势,为微生物组从理论研究到应用提供思路。关键词:微生物群落,功能微生物,合成菌群,生态学,宏组学Frommicrobiometosyntheticmicrobialcommunity1,2111,2*LIUWei
3、-WeiWUBingXIANGMei-ChunLIUXing-Zhong(1.StateKeyLaboratoryofMycology,InstituteofMicrobiology,ChineseAcademyofSciences,Beijing100101,China)(2.SchoolofLifeSciences,UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,China)Abstract:Microbiomedescribesthemicrobia
4、lcommunityandits-omicsthatresideinaspecificniche,andalmostallthebiologicalprocessesinnatureareconductedbycertainmicrobiome.AlongwiththedevelopmentandcosteffectivenessofDNAsequencingtechnique,microbiomehasbecomeahotresearcharea.Aftersyntheticbiology,syntheti
5、cmicrobialcommunitybasedonthemicrobiomewillincreaseourabilitytoharnessthepowerofmicrobialcommunitiesinbiotechnologyandtomanipulatesuchcommunitiestopromotehumanhealth,agriculture,industryandenvironment.Thispaperreviewstheresearchprogressandapplicationofmicro
6、biomeinvariousfieldsfromaviewpointof‘frommicrobiometosyntheticmicrobialcommunity’,andprovidesideasfromthetheoreticalresearchtoapplicationofmicrobiome.Keywords:Microbialcommunity,Functionalmicroorganism,Syntheticmicrobialcommunity,Ecology,Meta-omicsFoundatio
7、nitem:BeijingMunicipalScienceandTechnologyProject(No.D151100003915002);NationalNaturalScienceFoundationofChina(No.31670014)*Correspondingauthor:Tel:86-10-64807505;E-mail:liuxz@im.ac.cnReceived:August18,2016;Accepted:November09,2016;Publishedonline(www.cnki.
8、net):December05,2016基金项目:北京市科技计划项目(No.D151100003915002);国家自然科学基金项目(No.31670014)*通讯作者:Tel:86-10-64807505;E-mail:liuxz@im.ac.cn收稿日期:2016-08-18;接受日期:2016-11-09;优先数字出版日期(www.cnki.net):2016-12-05882微生物学通报Mi