红螯螯虾(cherax+quadricarinatus)微卫星标记筛选及群体遗传学分析

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1、论文摘要红螯螯虾(Cheraxquadricarinatus)是原产于澳大利亚的重要淡水经济虾类。按照地理群态可分为“东”、“西”两个分支，据资料表明，只有“东”区分支被各国引种养殖(包括中国)。微卫星DNA是目前被广泛采用的一类分子标记，相关技术的成熟使我们获取微卫星标记的成功率越来越高。本文采用磁珠富集法构建了红螯螯虾微卫星标记的富集文库，并从中先后筛选到48个微卫星标记位点，并利用这些微卫星位点对一个群体(36个个体)进行多态性分析，分型结果显示有7个位点显示为单态位点。余下的41个位点都具有较高的多态性，等位基因总数为157，每个位点

2、的等位基因2．10个不等，平均值为3．8。表观杂合度在0．1724到O．9846之间，期望杂合度从0．3405到O．8687。其中两个位点CQ24、CQ32偏离了哈迪．温伯格平衡(a=0．0012，k=41，Bonferroni检测)。由于微卫星分子标记在近缘种中具有较高的通用性，我们还利用18个红螫螯虾微卫星位点进行通用性扩增，为近缘物种种群遗传学研究提供了更多的分子标记。另外，本研究还选用了28个微卫星标记对我国三个主要养殖群体进行了遗传学分析，这三个养殖群体分别取自中国的福建厦门、广东广州和上海崇明。此研究主要是为了加强对我国红螯螯虾主

3、要养殖群体的分子遗传特征的了解。研究结果表明，与原产地野生种群相比，我国养殖群体虽然尚未出现种质退化，但其遗传多样性水平已有所下降；厦门养殖群体和广州养殖群体之间存在较大的遗传分化。关键词：红螯螫虾、微卫星标记、跨种扩增、群体分析ABSTRACTTheredclawcrayfishCheraxquadricarinatusaccountsfortheentirecommercialproductionoffreshwatercrayfishinAustralia．Twoformshavebeenrecognised，an‘Eastern’fo

4、rminnorthernQueenslandanda‘Western’formintheNorthernTerritoryandfarnorthernWesternAustralia，TodateonlytheEasternformthathasbeenexportedoverseasforculture(includingtoChina)．MicrosateUiteDNAisawidelyusedmolecularmarker．Thesuccessrateofisolatingmicrosatellitelocifromaspecified

5、speciesisgettinghigherandhigherasaresultoftheadvanceofrelatedtechnology．Inthisstudyweisolated48microsatellitelocifromCheraxquadricarinatusbyusingthreegenomicenrichedlibrarys，andtestedthepolymorphismonapopulation．Thescreeningresultsshowedthatsevenlociweremonomorphic．Theremai

6、ningforty-onemicrosatellitelocidisplayedhighlevelsofpolymorphism．Atotalof157alleleswastestedwith3．8perlocus(rangingfrom2tolO)．Theobserved(Ho)andexpectedheterozygosities(HE)rangedfromO．1724to0．9846and0．3405to0．8687．respectively．Twomicrosatelliteloci(CQ24andCQ32)revealedsigni

7、ficantdeviationsfromHardy—WeinbergequilibriumafterBonferronicorrectionformultipletests(adjusteda=0．0012，k=41)．Inaddition，18microsatellitemarkersofCquadricarinatusweretestedforpotentialcross—amplificationinrelatedspecies，providingmoremolecularmarkersonstudyingpopulationgenet

8、icsincloselyrelatedspecies．ThegeneticstructureofthreeChineseredclawcrayfishculture