基于不同策略构建辣椒核心种质的研究

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1、基于不同策略构建辣椒核心种质的研究  摘要:核心种质的构建为作物种质资源的高效利用提供了便利条件。以420份辣椒(CapsicumannuumL.)种质为试材,采用混合线性模型分析方法无偏地预测11个数量性状的基因型值,利用马氏距离计算种质间的遗传距离,分别采用3种聚类方法(中间距离法、类平均法和离差平方和法)、3种抽样方法(随机抽样法、优先抽样法和偏离度抽样法),按照25%的抽样比率构建辣椒核心种质库,采用均值、方差、极差和变异系数4个指标评价不同方法构建核心种质库的优劣。结果表明,类平均法优于中间距离法和离差平方和法,偏离度抽样法优于随机抽

2、样法和优先抽样法。基于马氏距离、类平均法、偏离度抽样法获取的105份辣椒核心种质资源能够代表原群体的遗传多样性,为辣椒种质资源的高效利用提供了重要的理论依据。  关键词:辣椒(CapsicumannuumL.);基因型值;核心种质;抽样策略;聚类方法  中图分类号:S641.3文献标识码:A文章编号:0439-8114(2016)10-2567-05  DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.10.029  Abstract:Theconstructionofcropcoregermplasmscouldf

3、acilitatetheeffectiveutilizationofgeneticresources.Taking420chilipepper(CapsicumannuumL.)germplasmsas12materials,thegenotypicvalueof11quantitativetraitswaspredictedaccordingtomixedlinearmodelanalysismethod.ThegeneticdistanceamonggermplasmswascalculatedusingMahalanobisdistanc

4、ebasedongenotypicvalue.Coregermplasmswereconstructedby3clustermethods(median,UPGMAandward'smethod)and3samplingstrategies(randomsampling,preferredsamplinganddeviationsampling)with25%samplingratio.Thegeneticvariationbetweencoregermplasmsandinitialgermplasmswascomparedthroughev

5、aluatingthemean,variance,rangeandcoefficientofvariation.TheresultsshowedthatUPGMAwasbetterthanmedianandward'smethod;whiledeviationsamplingwasbetterthanpreferredsamplingandrandomsampling.105coregermplasmsobtainedbasedonMahalanobisdistance,UPGMAanddeviationsampling,couldrepres

6、entthegeneticdiversityofinitialgermplasmsadequately.Thisstudycouldprovideimportanttheoreticalbasisforefficientutilizationofchilipeppergermplasms.  Keywords:chilipepper(CapsicumannuumL.);genotypicvalue;coregermplasms;samplingstrategy;clustermethod  辣椒(Capsicumannuum12L.)原产于南美

7、洲[1],因其适应性强,现在已广泛栽培于世界各地。大量研究表明,辣椒果实中含有丰富的维生素C[2]、维生素A[3]和类胡萝卜素[4],并且辣椒中的辣椒素类物质具有缓解疼痛[5]、消炎[6]、预防记忆衰退[7]、促消化[8]、抗肿瘤[9]等功效。所以在蔬菜种类产量方面,辣椒仅次于番茄,位居第二[10],属于高产蔬菜。  种质资源是作物新品种选育和种质创新的重要物质基础。在作物种质资源的收集过程中,由于不够系统,各类样品的遗传多样性状况不均衡[11]。另外,随着种质资源的不断收集和积累,种质资源库变得越来越大;面对巨大的种质资源数量,不仅保存困难,

8、而且很难对其进行深入细致地研究并加以有效利用。为解决这一问题,Frankel等[12]提出并与Browna[13]完善了核心种质的概念。核心种质的提出

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