实验七dna体外重组技术

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1、实验七DNA体外重组技术一.概念DNA重组:指不同来源的DNA片段共价连接,通过重新组合,构成了具有两个DNA分子遗传信息的新的重组体DNA。DNA体外重组技术:是在分子水平上,根据人们的需要以人工的方法感兴趣的目的基因,在体外与载体DNA分子重组,然后将重组子转入受体细胞,并筛选出表达重组DNA的活细胞,加以纯化、扩增、成为克隆,这一过程称为DNA体外重组技术。DNA体外重组技术是基因工程的核心内容。二.基本过程分、切、连、转、筛1.分:分离出要克隆的目的基因及载体。①目的基因的来源:ⅰ。直接分离

2、适于遗传背景了解比较清楚的细菌染色体、质粒及病毒DNA的提取分离。首先通过组建几种限制性内切酶的物理图谱进行基因定位,然后用DNA的酶切片段电泳分离DNA,应用相应DNA探针确定目的DNA后,从胶中回收DNA。ⅱ。人工合成序列明确的短DNA片段,可用DNA合成仪合成。ⅲ。由mRNA逆转录合成cDNA细胞总RNA分离mRNA分离目的基因mRNA的纯化cDNA第一链的合成cDNA第二链的合成cDNA发卡环的消化cDNA的克隆ⅳ。从基因组文库中筛选目的基因首先构建基因组文库(G文库)或cDNA文库(C文库

3、),需要时利用探针技术将所需目的基因“钓”出来。ⅴ。PCR②载体:可容忍外源性DNA片段插入,可在细胞间转移并能在细胞内自主复制的DNA分子。理想的质粒克隆载体应具有的特性:ⅰ.能在宿主细胞中独立复制,并能携带DNA片段一同扩增ⅱ.具有多种常用的限制性内切酶的单酶切位点,即多克隆位点(MCS,multiplecloningsites),便于进行克隆ⅲ.分子量小,可插入较大的外源DNA而不影响复制ⅳ.易于导入受体细胞具有容易操作的检测表型。如抗生素抗性、α-互补显色反应(蓝白斑筛选)ⅴ.表达型载体应配

4、备与宿主细胞相适应的启动子,前导序列,增强子等调控元件ⅵ.生物安全性好目前常用的载体有质粒、噬箘体、病毒等。2.切:用限制性内切酶切割目的基因和载体,使其产生便于连接的末端。3.连:将切割后的目的基因和载体用T4DNA连接酶连接。4.转:把连接好的重组载体转化入感受态细胞的过程(细菌:E.coli,真菌:Yeast,昆虫细胞或哺乳动物细胞)。5.筛:在不同层次上、不同水平上进行筛选,鉴定所需的特异性重组子。使用各种方法,将带有重组载体的宿主菌从培养基中筛选出来。例如:载体大小,酶切结果,筛选标记等。

5、实验质粒DNA提取一.原理1.定义独立于染色体外的,能自主复制且稳定遗传的遗传因子。是一种环状的双链DNA分子。可赋予宿主细胞一定生物学性状,如:抗生素抗性Ampr等。2.来源存在于细菌、放线菌、真菌以及一些动植物细胞中,在细菌细胞中最多。3.分类质粒按复制方式分为两种类型:松弛型质粒和严紧型质粒①严紧型质粒(Stringentcontrol)严紧型质粒只在细胞周期的一定阶段进行复制,当染色体不复制时,它也不能复制,通常每个细胞内只含有1个或几个质粒,如F因子。②松弛型质粒(Relaxedcontr

6、ol)松弛型质粒在整个细胞周期中随时可以复制,在每个细胞中有许多拷贝,一般在20个以上,如Col质粒。松弛型质粒的复制不需要质粒编码的功能蛋白,完全依赖于宿主提供的半衰期较长的酶。即使蛋白质合成受抑制,质粒的复制依然进行。当抑制蛋白质合成并阻断细菌染色体复制的氯霉素等抗生素存在时,质粒的拷贝数可达2000-3000拷贝。4.构型质粒构型:超螺旋型(SC),开环形(OC),线型(LC)5.碱裂解法提取质粒原理碱裂解法提取质粒DNA的原理是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA的分子大小和结构差异

7、来实现分离的。在pH12-12.5时,线性DNA被彻底变性,但共价闭环质粒DNA虽然H键也发生断裂,但两条互补链仍会紧密缠绕结合在一起。当在溶液体系中加入pH4.8的KAC时,溶液恢复中性,质粒DNA迅速复性,染色体DNA则由于变性而相互混乱缠绕,不能复性,从而离心即可以把变性的染色体DNA沉淀和蛋白-SDS复合物沉淀分离出来。质粒DNA染色体DNA分子量小(1.5kb-15kb或60kb-120kb)大结构超螺旋,共价,闭环线性,双螺旋变性pH>12.6氢键断裂,两条互补链不完全分离双螺旋完全打开

8、复性pH中性恢复原始构象不能复性二.实验试剂溶液Ⅰ50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-Cl(pH8.0)10mmol/LEDTA(pH8.0)溶液Ⅱ0.4mol/LNaOH2%SDS临用前1:1混合贮存液即为II液.溶液Ⅲ5mol/L醋酸钾60ml冰醋酸11.5ml水28.5ml(最终pH4.8)三.操作步骤1.10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。2.加入100ml溶液1,振荡至彻底悬浮。3.加入200ml溶液2,立

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