宽皮柑橘citrus reticulate blanco的遗传多样性及系统发育研究

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1、IIIIIIIrIrI[IIIIIIIIIIY1812624华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权书趁如需保密，解密时间占础年／a1月-．2／日学位论文是否保密独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果．尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得华中农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，指导教师对此进行了审定．与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明，并表示了谢意．研究生签名：疬I

2、1象冬时问：&坩／年，≯

3、月材日学位论文使用授权书本人完全了解“华中农业大学关于保存、使用学位论文的规定”，即学生必须按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本；学校有权保存提交论文的印刷版和电子版，并提供目录检索和阅览服务，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文．本人同意华中农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容．注：保密学位论文在解密后适用于本授权书．学位敝储挠杏蚴岛导师张蝌如签名日期：c2卵俾堋珈签名日期：抄，年，L／月刁日注：请将本表直接装订在学位论文的扉页和目录之间目录Ej录．．1摘要．．3Abstract．．5缩略语

4、表71．研究目的和意义81．1研究意义．81．2研究目的一91．3技术路线92．文献综述．10．2．．1SSR标记及其在柑橘种质研究的应用102．2分子系统学概述ll2．2．1植物分子系统学分析方法．122．2．2分子系统学中常用的叶绿体基因组DNA序列标记．．142．2．3分子系统学常用的核基因组DNA序列标记。152．2．4分子系统学常用的线粒体基因组DNA序列标记一162．3柑橘类果树种质的研究进展．．172．3．1真正柑橘类植物起源与演化．．182．3．2柑橘属果树的分类．202．3．3柑橘属及部分种的起源与演化．202．3．3．1大翼橙

5、类与柑橘属的起源212．3．3．2柚222．3．3．3枸橼222．3．3．4甜橙和酸橙232．3．3．5藜檬．232．3．3．6柠檬242．3．3．7莱檬242．3．3．8葡萄柚．242．3．3．9粗柠檬242．3．3．10四季橘一252．3．3．1l香橙．．252．3．4宽皮柑橘类各品种问的遗传多样性及系统演化研究．252．3．4．1宽皮柑橘的分类252．3．4．2宽皮柑橘的演化272．3．4．3宽皮柑橘一些生物型的起源．292．3．5我国野橘种质的研究进展．．292．3．6柑橘分子系统发育研究进展．303．材料与方法．323．1实验材料323

6、．1．1SSR分析用的实验材料。323．1．2测序分析用的实验材料．333．2DNA的提取．353．3SSR乡手析．．353．3．1PCR扩增及SSR标记的检测353．3．2SSR数据的统计分析363．4DNA序列性状分析363．4．1目的基因片段的扩增363．4．2序列片段的回收与克隆、测序383．4．3序列比对和处理383．4．4数据集fBJ的相容性检验．．393．4．5最大简约树的构建393．4．6最大似然树的构建．．393．4．7邻接距离树的构建403．4．8系统发育树的KHTest和SHTest分析．．404．结果与分析414．1遗传多

7、样性研究的结果与分析4l4．1．1核基因组SSR检测到的宽皮柑橘及野橘的多念性．4l4．1．2叶绿体基因组SSR检测到的宽皮柑橘及野橘的多态性．．434．1．3基于核基因组SSR的宽皮柑橘及野橘的聚类分析．．444．1．3．1地方品种的聚类分析444．1．3．2野橘群体的聚类分析．464．1．4基于叶绿体基因组SSR的宽皮柑橘及野橘的聚类分析．46．4．1．5基于SSR的宽皮柑橘及野橘间的亲缘关系．464．2DNA序列性状研究的结果与分析．．5l4．2．1叶绿体基因组matK基因片段的变异分析514．2．2叶绿体基因组trnL．trnF基因片段的

8、变异分析524．2．3核基因组LEAFY第二个内含子(FLint2)序列变异的分析．524．2．4数据集I’日J的相容性．．534．2．5叶绿体基因组trnL．trnF基因片段的MP、ML和NJ系统树534．2．6叶绿体基因组matK基因片段的MP、ML和NJ系统树614．2．7叶绿体基因组trnL．trnF和matK联合数据集构建的MP系统树．．644．2．8核基因组LEAFY第二个内含子序列(FLint2)的MP、ML和NJ系统树7l5．讨论795．1地方品种及野橘种质问的遗传差异795．2野橘种质与宽皮柑橘的亲缘关系795．3一些柑橘生物型

9、的起源805．4大翼橙类与现代柑橘的起源825．5DNA序列与柑橘系统发育研究82参考文献84垂

10、【谢．．102附录一在读期间发表的论文