肝螺杆菌幽门螺杆菌功能基因组比较分析修改

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1、-南方医科大学成人高等教育毕业论文题目：肝螺杆菌与幽门螺杆菌的功能基因组比较分析作者姓名：曾秋银专业：高级护理年级：2008级专升本.---摘要:肝螺杆菌(Helicobacterhepaticus，Hh)是迄今为止发现与肝脏疾病相关的5种螺杆菌之一。Hh株ATCC51449的全基因组测序已经完成。分析发现Hh有和幽门螺杆菌(Hp)一样的尿素酶、鞭毛蛋白和粘附素同源基因，而编码趋化蛋白及细胞致死性肿胀毒素(CDT)的特性则与空肠弯曲菌类似。Hh缺乏大多数与Hp同源的定植和毒力因子如cag致病岛。此外Hh还有一个与霍乱弧菌相似的致病岛HHGI1。上述基因特点该菌肠道定植的适应性

2、与致病潜能。关键词:肝螺杆菌幽门螺杆菌基因组AnalysisoffunctionalgenomeofHelicobacterhepaticusincomparisonwiththatofHelicobacterpylori.NIULing-yun，LIJingBAIYang，WANGJi-de*.*DepartmentofDigestiveMedicine，Nanfanghospital，SouthernMedicalUniversity，Guangzhou510515,ChinaAbstract:Helicobacterhepaticus(H.hepaticus)isone

3、ofthefivehepaticpathogenichelicobactersidentifieduptonow.GenomicsequenceofH.hepaticusATCC51449hasbeempublished.HomologuegenestoH.pyloriincludingurease,flagellinproteinandadhesionshavebeenfoundinH.hepaticus.Otherfunctionalgenessuchaschemotacticproteinandcytolethaldistendingtoxin(CDT)aresimil

4、artothatencodedbycampylobacterjejuni.H.hepatiusdoesnotencodesomewellknowncolonizationorvirulentfactorsofH.pylorisuchascagpathogenicityisland.Onthecontrary,itcontainsaspecificclusterofgenedesignatedas.---HHGI1(Helicobacterhepaticusgenomicisland)thatencodesaproteinsimilartotheHcp(hemolysin-co

5、regulatedprotein)ofVibriocholerae.ThegenomicfeaturesofH.hepaticusmayreflectthecapacityofcolonisationandpathogenicityofthisbacterium.KeyWord:Helicobacterhepaticus,Helicobacterpylori,Genome自1989年提出螺杆菌属以来，已经正式命名了20种，根据它们喜好的定居部位，可被分为胃螺杆菌和肠肝螺杆菌。肝螺杆菌(HelicobacterHepaticus，Hh)是一种肠肝螺杆菌，定植于下消化道,包括盲肠

6、,结肠以及肝胆管系统，目前为止还没有在胃内找到。该菌的自然宿主是鼠类,但在人类组织也有检出的报道。研究表明该病原可以引起慢性活动性肝炎和盲肠结肠炎［1-3］，也与结肠癌及肝胆管腺瘤及癌有关[4-5]，此外肝螺杆菌的感染还可在某些免疫缺陷小鼠中诱导炎症性肠病(IBD)的发生[6-7]。一株肝螺杆菌(ATCC51449)的基因组序列已经公布，是含有1799146个碱基对的环状染色体，可以编码1875种蛋白质，它缺乏大多数已知的Hp毒力因子同源物，如粘附素，VacA细胞毒素，几乎所有的cag致病岛蛋白，但是含有与空肠弯曲菌(Campylobacterjejuni,Cj)同源的粘附素

7、PEB1和细胞致死性肿胀毒素(Cytolethaldistendingtoxin,CDT)。此外还包括基因岛HHGI1和其它几个基因小岛，它们的特点是G+C含量与其余的基因有所不同。目前研究表明肝螺杆菌具有很少的特征性标志，只有一些基因有特点，如16sRNA基因可以编码18kDa的致免疫蛋白[8]，cdtABC可以编码CDT，.---ureABC的部分序列编码尿素酶结构亚单位[9]。本文以Hp为比较，就该菌的基因组作一简要分析，以利于明确该菌潜在的致病产物与机制。1.肝螺杆菌基因的一般特性肝螺杆菌ATC