京海黄鸡igf-ir igfbp-3基因多态性及其与生产性能的相关性分析

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1、京海黄鸡IGF.IR、IGFBP.3基因多态性及其与生产性能的相关性研究研究生:金崇富导师:王金玉教授专业:动物遗传育种与繁殖(扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009)中文摘要本研究以IGF.IR、IGFBP.3基因作为影响京海黄鸡生产性能的候选基因,采用DNA测序、PCR.SSCP和PCR-RFLP技术分析了2个基因单核苷酸多态性,并与京海黄鸡的生产性能进行相关分析。主要研究结果如下:1.在京海黄鸡IGF—IR基因外显子区共发现7个SNPs位点(G26333A、G26336A、C26639T、G110996

2、C、C111014A、C143082G和A143135G);在IGFBP.3基因共发现3个SNPs位点(T160G、C1087T和C4095T)。2.IGF.IR基因外显子的G26336A和C111014A位点分别导致~uI和HiMI酶切位点的改变。3.IGF.IR基因7个SNPs位点全部位于编码区,突变都未导致氨基酸的改变。鸡群体在IGR3-1位点上偏离Hardy-Weinberg平衡,其余位点符合Hardy.Weinberg平衡。4.IGFBP.3基因3个SNPs其中1个位于内含子区,2个位于外显子非编码区。鸡群体

3、在IBP2—1位点上偏离Hardy—Weinberg平衡,其余位点符合Hardy.Weinberg平衡。5.IGF.IR基因IGR2-1和IGRl6(IGRl6.1、IGRl6.2)位点对京海黄鸡300日龄产蛋数有显著的影响(氏O.05),推测IGF.IR基因可能是影响京海黄鸡繁殖性状的的主效基因或与主效基因相连锁的一个标记。在IGR2.1位点上,AA和AB基因型个体在300日龄产蛋数上显著高于BB型个体(闷.05),IGR2.1位点在京海黄鸡300日龄产蛋数的标记辅助选择方面具有很大的应用潜力。6.IGF.IR基因I

4、GR2.1、IGR2.2(A1uI)、IGR2.3、IGR3.2(HinlI)和IGRl6II(IGRl6.1、IGRl6.2)位点对京海黄鸡的生长性状具有显著的影响(尸<0.05),推测IGF.IR基因可能是影响京海黄鸡生长性状的主效基因或与主效基因相连锁的一个标记。在IGR2.2(AluI)位点上,DD基因型个体在8周龄体重显著高于CC基因型个体(氏0.05),DD基因型个体在12周龄体重显著高于CC和CD基因型个体(P

5、力。7.IGF.IR基因连锁不平衡结果显示,IGRl6.1与IGRl6.2为完全连锁不平衡;IGR3.2与IGRl6.1为强连锁不平衡。8.IGFBP.3基因IBPl和IBP2.1位点对京海黄鸡开产日龄具有显著的影响(火O.05),IBPl位点对京海黄鸡的生长性状具有显著的影响(P

6、ngleNucleotidePolymorphismoflGF—IRandIGFBP-3GeneAssociatedwithProductionPerformanceinJinghaiYellowChickenPh.MCandidate:JinChong—FuSupervisor:Pro£WangJin—YuMajor:AnimalGenetics,BreedingandReproduction(CollegeofAnimalScienceandTechnology,YangzhouUniversity,Yangzho

7、u225009)ABSTRACTInthisresearch,IGF.IRandIGFBP一3genewereselectedascandidategeneswhichaffectcorrelatetraitsinJinghaiyellowchicken.PCR—SSCP,PCR-RFLPandDNAsequencingwereusedtOdetecttheSNPsofcandidategenesinordertoanalysetheirrelationshipwithproductiontraitsinJinghai

8、yellowchicken.Themainresultsalelistedasfollows:1.Sevenmutations(G26333A,G26336A,C26639T,G110996C,C111014A,C143082GandA143135G)weredetectedinexonsoftheIGF-mgeneinJingh

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