不同处理油松cdna-srap pcr体系建立及基因表达差异分析

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1、EstablishmentofcDNA-SRAPPCRReactionSystemandGeneExpressionDifferenceAnalysisofChinesePinewithDifferentTreatmentsCandidate:LiuYangSupervisor.Prof.GaoBaojiaMajor:.EcologyAbstractInthisstudy,Chinesepine俨切淞tabulaeformisCarr)forestsindifferentstandtypesinPingquanCountyofChengdeCity,Hebeiprovin

2、cewastakenaStheresearchobject,bycombiningtheanalysisoffieldtestandmolecularexperiment.Wesetthecontroltreatment,treatmentofChinesepinefedby10pinecaterpillars(Dendrolimustabulaeformis)perplant,treatmentofChinesepinefedby30pinecaterpillarsperplantandtreatmentofcuttingleavies(thedamagedegreee

3、qualstothetreatmentofChinesepinefedby30pinecaterpillarsperplant).CombinatingofeDNASRAPmethodsforgeneexpressiondifferenceanalysismethod,wepreliminarystudiedthegeneexpressiondifferenceofChinesepineunderdifferentstandtypesanddifferenttreatments,analyzedthereasonofthedifferences,predictedthef

4、unctionofthegeneandprovidedtheevidenceofgenelevelfortheinducedresistancemechanismwhichgeneratedbytherelationshipbewteenChinesepineandpinecaterpillarundertheinteractionofforesttypesandChinesepinecaterpillarherbivory.111emainresultsareasfollows:(1)ThesystemofPCRwasoptimizedinfourleveloffive

5、factors,whichWasTaqDNApolymerase,Template,primer,M92+anddNTPbyusingorthogonaldesignL16(45).Theresults,generatedbySRAP-PCRwereanalyzedbysoftwareSPSS,showedthattheeffectsofthefivefactorsontheamplificationsystemdecreasedinthefollowingorder:dNTP>cDNAtemplate>TaqDNApolymerase>primer>M92+.Asuit

6、ableSRAP-PCRsystemforChinesepinethatiscontaining2.0UTaqDNApolymerase,80~120ngcDNAtemplate,0.4I.tmol/Lprimer,1.5mmol/LM92+,0.2mmol/LdNTPintotal20oLreactionsystem.ThisoptimizedsystemforChinesepinewouldbeusefulindifferentialgeneexpressionanalysisbyusingthecDNA—SRAPtechnique.Reaction:Protocol

7、Wasinitiallydenaturedat94"Cfor5min;denatuered94℃f10r50S,annealedat35"Cfor50S,extensedat72℃forlmin,5cycles;denatueredat94℃for50S,annealedat50℃for50S,extensedat72℃forlmin,35cycles;extensedat72℃for7min;storedat4"C(2)UsingtheoptimizedsystemofcDNA-SRAP,225pairsofSRAPprim

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