湖州师范学院基因工程复习提纲

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1、基因工程复习重点一、载体PTXBIMetAlaSerSerArgVaiAspGlyGlyArgGluPheLeuGluGlySerSerCATATGGCTAGCTCGCGAGTCGACGGCG<3CCGCGAATTCCTCGAGGGCTCTTCCT7promotorT7启动子是最强的启动子,指导传录起始。Lacopterator乳糖操纵基因,可被LacI编码的阻遏蛋口结合抑制转录。SD原核生物翻译起始时核糖体的识别序列位于mRNA上MCS多克隆位点可插入外源基因,不影响其复制。内含多个酶切位点、如图。Intein内含肽CBDchitinbindingdo

2、main(儿丁质结合位点)可与Tag(亲和标记)结合Stopcode终止密码子Amp氨茉抗性基因可用作抗性筛选的重要标记LacI乳糖调控基因编码阻遏蛋白二、质粒提取原理:答:三种溶液:溶液1:50mmol/1葡萄糖维持渗透压,防止DNA受机械损伤降解;25mmol/1Tri-Cl(pH8.0)—维持pH;10mmol/1EDTA(pH8.0)——螯合Ca2+,DNase失活,保护DNA溶液2:0.2mol/NaOH核酸变性(pH>12或pH<3)(解链)1%SDS蛋白变性,裂解细胞。溶液3:7.5mol/LNH4AC(pH7.6)・…-■沉淀蛋白,大分子

3、核酸,调节pH,使小分子核酸复性(可溶)。其它溶液:(1)2MNH4AC沉淀蛋白,溶解核酸;(2)异丙醇沉淀质粒(3)70%乙醇沉淀质粒,除去异丙醇,盐分。(4)RNase除去细菌RNA过程及作用:(1)1.5ml菌液,12000rpm*1min,弃上清(repeat)收集细菌(2)溶液1(200ul),剧烈混匀提供缓冲液⑶溶液2(400ul),温柔混匀,冰中5min;裂解细胞,蛋白核酸变性(4)溶液3(300ul),温柔混匀,冰中10min;质粒复性(5)13000rpm*5min,取上清;除去细菌蛋白,基因DNA(6)540ul异丙醇,室温10min

4、;沉淀质粒(7)14000rpm*10min,弃上清;除去可溶性杂质(8)100ul2MNH4AC(9)13000rpm*5min,取上清;(10)100ul异丙醇,室温10min;(11)14000rpm*10min,弃上清;(12)70%乙醇500ul,14000rpm*10min,弃上清;除去异丙醇,盐分(13)烘干10-30min,除去乙醇(14)50ulddH2O(含0.1mg/mlRNase),37°C*30min.除去细菌RNA(15)电泳鉴定三、连接反应答:1、总体积为10ul;2、16°C连接过夜;(为什么是16°C?答:连接反应包括两

5、步一是将碱基50%连接(变性):Tm=2(A+T)+4(G+C),一般在8°C左右。二是将连接末端、DNA连接酶最适温度在37°C左右。综上,要两个同时很好的进行,就将温度调到16°C左右。)3、基因mol/载体mo®10;【平端~15】四、重组克隆的筛选,各方法的优缺点。答:1、抗性筛选;原理:利用载体上具有的抗性基因,进行筛选。优点:可确定有无载体转入。缺点:不能保证外源基因插入,空载体不能被检测出来。2、蓝白斑筛选;原理:LacZ由4个亚基构成;细菌表达一部分(无活性),载体表达一部分(无活性),合在一起构成有活性的LacZ,可分解培养基平板中的底

6、物X-gal,牛成蓝色物质。(需要IPTG诱导表达)一一蓝斑;外源基因插入载体后,使载体部分LacZ失活,无法进行a互补一一白斑。优点:未转入载体的细菌也会形成白斑,需同时用抗性筛选缺点:无法确定基因插入的方向;基因过小,H读框正确,可能无法使载体部分LacZ失活,将产生Q互补,产生蓝斑。3、酶切电泳筛选(*);原理:选用不同的酶切组合,通过电泳检测DNA片断的大小。优点:可鉴定外源基因的重组和插入方向。缺点:结果可靠但操作比较麻烦;无法检测基因内部的突变。4、PCR筛选;原理:通过特界引物扩增,电泳检测,筛选重组质粒优点:可用2ul菌液做模板,快速,方

7、便,可批量检测重组子。缺点:不能检测基因插入方向;不能检测基因内部突变。5、测序验证;原理:选取阳性克隆,送公司测序;优点:最可靠的检测方法。可确定基因的重组,插入的方向,基因内部的突变等。缺点:价格贵,适于1〜2个克隆的验证。6、表达筛选;SDS-PAGE原理:小量诱导表达;全菌液裂解后进行SDS-PAGE电泳;重组的表达克隆将在特定的位置出现较浓的蛋白条带。(需加不诱导的对照)优点:可检测外源基因的表达。(一般基因的插入,方向,读框都正确)缺点:无法筛选不能有效表达的重组质粒。亲和筛选:原理:50ml菌液诱导表达,超声破菌,用少量亲和beads吸附上

8、清;SDS-PAGE检测,在特点位点将出现一条蛋白带。优点:适用于有亲和Taq的

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