用materialstudio构建材料表面

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1、用MaterialStudio构建表面模型作者：Elizerbe…文章来源：本站原创点击数：1960更新时间：2006-10-21童收藏止顷MaterialStudio是一款功能强大的软件，其功能当然不仅仅限于构造模型。在这里，我们就牛刀小试,用MaterialStudio来构建我们所感兴趣的吸附表面。最简单的(111)或考(100)面比较容易，但是稍微复杂点的，比如(110)面的构造如果是手工就要稍花力气。而MaterialStudio这套软件可以轻易的构造大多数晶体的任意切面。我们以构造Pt(110)表面为例，主要过程如下：第一，import一个晶格体系，在structure目录

2、里可以选择metal/pure-metal,找到Pt的晶格文件.倒入后，我们可以看到Pt是fee密堆结构。第二，选择bui.1d->clcavesurface.然后在cleaveplane对话框里设定需要解理的晶面指数，这里我们选择110o第三，选择layer的厚度，就在depth里选择fraction,也就是重复的晶面数，注意这里不是周期数。如杲是三层的在depth里设定6就好了。没有把握的话，可以随便设定一定depth值，cleave之后还可以根据厚度来recleave.设定真空层厚度。第四，同样在bu订d->crystal选项里选择bulid->vacuumslab在这里，我们

3、设定真空层厚度为10A。到这里就差不多已经搞定Pt(110)表面的构筑了。构造完的Pt(110)表面如下图所示真空层M⑴表面最后，我们可以用F订e$rightarrow$Export菜单把它导!JU成cif或者pdb文件。以pdb文件为例，以下是导出的pdb文件REMARKREMARKCRYST1ATOM-11.772ATOMPT1MOLMaterialsStudioPDBfileCreated:SatOct213.9242.7751PT1MOL0.0001.000.002206:15:0025.2602PacificStandardTime200690.0090.0090.00P

4、l-7.848Pt-7.848-7.8480.0001.000.00ATOM3PT1MOL2PtATOM4PT1MOL2PtATOM5PT1MOL2PtATOM6PT1MOL2PtATOM7PT1MOL2PtATOM8PT1MOL2PtATOM9PT1MOL2PtATOM10PT1MOL-11.7721・9621.00ATOM11PT1MOL2PtATOM12PT1MOL2PtTERPt-9.810Pt1.9621.000.001.9621.000.00-3.924-7.848-3.924-3.9240.000-3.9240.0000.000-7.848-9.810-3.924-5.

5、8860.000-1.96220.00-5.886-7.848-1.962-3.9240.0001.000.000.0001.000.000.0001.000.000.0001.000.001.9621.000.001.9621.000.001.9621.000.00可见，文件屮从第6列到第8列的坐标即为相应的Pt的直角坐标，而第三行中的内容分别是基矢的长度和相对的夹角。有了这些信息，我们就可以非常容易的将Pt的结构信息用到VASP等其他程序的输入文件中。