转录终止及其基因调控你

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1、转录终止及其基因调控生物技术1211徐义英[摘要]转录时基因表达调控的重要环节,转录的基本过程包括模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止,对转录起始和延伸水平已了解甚多,但对转录终止尤其是真核生物的转录终止还知之甚少。已知原核生物转录终止有两种模式:依赖于Rho因子和不依赖于Rho因子,原核生物中还发现基因在转录时提前终止的现象如色氨酸操纵子。近年来真核生物中也提出了两种转录终止模式:依赖poly(A)加工信号和依赖Sen1的转录终止。在噬菌体感染实验中还发现了抗终止作用。[关键词]转录终止;抗终止作用;依赖Rho因子的转录终止遗传信息的传递对于生命体起着至关重要的作用,因此这个过

2、程受到严格的调控。遗传信息从DNA传递到RNA是遗传信息传递的第一步,称为转录,分为三个阶段:起始、延伸和终止。转录由RNAP控制催化完成,原核生物中一种RNA聚合酶几乎负责所有的mRNA、rRNA和tRNA的合成,真核生物中mRNA的转录主要由RNAPⅡ催化合成。在转录的三个阶段中,对转录终止的理解最少,但它在转录中也发挥着重要的作用。1.原核生物的转录终止1969年Roberts发现使转录终止的蛋白质Rho因子,此后将原核生物转录终止分为依赖于非依赖Rho因子两种类型。1.1不依赖于Rho因子的终止此类型中,没有其他任何因子参与,核心酶就能终止基因转录,模板DNA上存在终止转录的特殊信号

3、——终止子,又称内在终止子。内在终止子有两个明显的结构特征①终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区,有这段DNA转录产生的RNA容易形成发夹结构。②在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列,所以转录产物的3’端为寡U,这样的结构特征决定了转录的终止。在新生的RNA中出现发夹结构会导致RNA聚合酶的功能暂停,破坏DNA-RNA杂合链5’端的正常结构。寡U的存在使杂合链的3’端部分出现不稳定的rU.dA区域,两者共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。-6-不依赖于Rho因子的终止效率与二重对称序列和寡U的长短有关,随着发夹结构(至少6bp)和寡U序列(至少4个U)长度的增加,终止效

4、率逐步提高。1.2依赖于Rho因子的终止有些终止位点的DNA序列缺乏共性,而且不能形成强的发夹结构,因而不能诱导转录的自发终止。Rho因子是一个由6个相同亚基组成的六聚体,具有NTP酶和解旋酶活性,能水解各种核苷酸三磷酸,它通过催化NTP的水解促使新生的RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。Rho因子的作用机制可用“穷追”模型来解释。RNA合成起始后,Rho因子即附着在新生的RNA链5’端的某个可能有序列或二级结构特异性的位点上,利用ATP水解产生的能量,沿着5’-3’方向转录泡靠近,其运动速度可能比RNA聚合酶移动的速度快些;当RNA聚合酶移动到终止子而暂停时,Rho因子到达R

5、NA的3'-OH端追上并取代了暂停在终止位点上的RNA聚合酶,塔索具有的RNA-DNA解螺旋活性使转录产物RNA从模板DNA上释放,随后,转录复合物解体,完成转录过程。1.3原核生物的转录提前终止原核生物中的转录与翻译相偶联,当环境中的Trp浓度很低时,缺乏Trp-tRNA,4区被转录完成时,核糖体还滞留在前导肽区(1区),导致2-3区配对,不能形成3-4区配对的终止子结构,RNA聚合酶继续转录色氨酸合成相关结构基因。反之,核糖体顺利通过前导肽区,在4区被转录时,前导链已完成翻译,1-2,3-4区可以分别配对,而形成终止子结构,转录提前终止。2.真核生物的转录终止真核生物的转录终止机制目前了

6、解尚不多,且3种RNA聚合酶转录终止方式不完全相同。2.1POLI转录终止依赖于特定序列POLI催化的转录终止类似于原核生物的两种模式综合,有18nt的终止子,可被辅助因子识别。2.2POLⅡ和Ⅲ的转录终止有依赖于poly(A)或依赖于Sen1的2种模式POLⅡ和Ⅲ-6-的转录终止,在序列上可能有与原核生物不依赖于Rho因子的终止子相似,即有特定序列,形成特征结构。目前的研究表明,POLⅡ转录终止有依赖于poly(A)和依赖Sen1的两种模式。2.2.1依赖于poly(A)的转录终止绝大部分mRNA的转录终止与其3’端加尾(特定位点剪切和聚腺苷酸化)象偶联。这个过程可以分为两个步骤:首先,随

7、着转录的进行,POLⅡ的CTD磷酸化发生变化,当poly(A)加工信号(酵母中富含A和富含U的相邻序列,高等生物为5’-AAUAAA-3’特征序列)转录后,POLⅡ复合物相关因子变构,并可能随之招募新的因子共同参与,使转录暂停,初级转录物在poly(A)加工信号下游被剪切;然后,上游产物在poly(A)聚合酶作用下加上聚腺苷酸,下游产物在5’-RNA外切酶作用下降解,转录随即终止。2.2.2依赖Sen1复合物

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