实验一质粒dna的小量制备

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1、实验一质粒DNA的小量制备一实验原理什么是质粒?质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。根据共价闭合环状质粒DNA与线性DNA在拓扑学上的差异来分离。在pH12.012.5这个狭窄的范围内,线性DNA双螺旋结构解开而被变性。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液使pH恢复中性时,共价闭合环状质粒DNA

2、复性快,而线性的染色体DNA复性缓慢,经过离心与蛋白质和大分子RNA一起沉淀下去。一实验原理分离质粒DNA有三个步骤:培养细菌使质粒扩增,收集和裂解细菌,分离和纯化质粒DNA。一实验原理在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒DNA链发生断裂。所以,多数质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:共价闭合环状DNA(cccDNA):质粒的两条链没有断裂;超螺旋开环DNA(ocDNA):质粒的一条链断裂;松弛的环状分子线形DNA(lDNA):质粒的两条链均断裂;一实验原理pGEX-6p质粒载体菌,LB培养基1000ml

3、(含100ug/ml氨苄青霉素),葡萄糖/Tris/EDTA(GTE)溶液(溶液I),NaOH/SDS溶液(溶液II),KAc溶液(pH4.8)(溶液III),RNaseA,95%乙醇,70%乙醇,TEbuffer(pH8.0)。二实验试剂1氨苄青霉素储存液(无菌水配制5mg/ml,分装后-20C保存),2配制LB培养基(胰化蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl10g加200mLddwater搅拌完全溶解,用约200L5NNaOH调pH至7.0,加ddwater至1L,121C20min灭菌);三实验准备3溶液I(50m

4、mol/L葡萄糖,25mmol/LTrisHClpH8.0,10mmol/LEDTApH8.0);溶液I可成批配制,每瓶约100ml,在10lbf/in2(6.895¡104Pa)高压下蒸气灭菌15分钟,贮存于4℃。溶液II(0.2mol/LNaOH,1%SDS);溶液III(60mL5mol/LKac,加冰乙酸调pH4.8,补ddwater至100ml),三实验准备470%乙醇(-20C保存),5TEbuffer(10mmol/LTrisHClpH8.0,1mmol/LEDTApH8.0);6摇菌试管洗净并盖上棉花塞、1.5

5、ml离心管装入铝制饭盒、移液器吸头装入相应的吸头盒,一起高压灭菌(121C30min)。三实验准备1在超净工作台中取5mlLB(Amp+),加入灭菌的摇菌管中。2取出保存pGEX-6p载体的菌种,在超净工作台上用烧红的接种环刮一下,再把接种环于5ml无菌LB培养液(含100ug/ml氨苄青霉素)中搅拌一下,37C摇床中摇20h。3取1.5ml的菌液于1.5ml离心管中,12000rpm离心1min,弃上清液(尽量弃干净),留沉淀备用。四操作步骤4在沉淀中加入用冰预冷的100l溶液I,盖上盖后立即在涡旋混合器上混匀,室温下静

6、置5min。(等待的同时,取一个塑料盒,装上适量的冰块备用。)须确使细菌沉淀在溶液I中完全分散,将两个微量离心管的管底部互相接触震荡,可使沉淀迅速分散。5加入200l溶液II,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物。应确保离心管的整个内表面均与溶液Ⅱ接触。不要振荡,插入冰中,放置5min。6加入用冰预冷的150l溶液III,盖上盖后上下颠倒几次混匀,插入冰中,放置5min。四操作步骤712000rpm离心5min,小心吸取400l上清液于另一个干净的1.5ml离心管中,(不要将白色沉淀物带入!),加入800l95%乙

7、醇,盖上盖后立即在涡旋混合器上混匀,室温下静置5min。812000rpm离心10min,小心弃掉上清液,加入500l70%乙醇,盖上盖后立即在涡旋混合器上混匀。12000rpm离心10min,小心弃掉上清液,尽量倒置弃干净,9再加入500l70%乙醇,盖上盖后立即在涡旋混合器上混匀。12000rpm离心10min,小心弃掉上清液,尽量倒置弃干净,可将离心管倒置于一张纸巾上,以使所有液体流出。四操作步骤10离心管倒置于37C培养箱中(或室温)空气干燥10分钟。。(管底的沉淀质粒DNA用肉眼几乎看不见!)。11每管加入10

8、LTE缓冲液混匀后收集到一个管中,涡旋混合器上混匀,在离心机中瞬时转一下,使溶液集中在管底。待电泳确认,用记号笔标记后放入冰箱中备用。12在剩余的菌液中倒入少许84消毒液,待溶液变清亮后随废液和剩余的冰块一起倒入下水池。清理桌面,清洗仪器,撰写实验报告四操作步骤

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