常见鳗鲡品种rapd分析和鉴定

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1、福建农林大学硕士学位论文摘要目的：搜集6种鳗苗：日本鳗鲡、欧洲鳗鲡、美洲鳗鲡、花鳗鲡、莫桑比克鳗鲡、西里伯斯鳗鲡。应用传统形态学分类方法，计测这6种鳗鲡的主要形态学性状，通过统计比较，结合鳗苗实际产地，并对照鳗鲡种类分布的相关文献，从形态学上对6组鳗鲡苗种进行种类鉴定。用随机引物扩增多态性DNA技术对鳗鲡基因组DNA进行多态性分析，从分子生物学上确立这6个鳗鲡品种的分类和遗传关系。方法：采集相关鳗鲡品种，按照产地分组编号，用电子分析天平称量体重后，于载玻片上平直放置鳗苗，用游标卡尺直接测量鳗苗全长、头长、眼

2、间距，显微镜载物台游标尺测量背鳍与臀鳍前端基部之间的距离后，将其压制成透明水封片，在显微镜下观察计测其总脊椎骨数。记录其体重、全长、头长、眼间距、背鳍与臀鳍前端基部之间的距离、脊椎骨数，进行统计分析比较，结合鳗苗实际产地，并对照鳗鲡种类分布的相关文献，从形态学上对6组鳗鲡苗种进行种类鉴定。方法：剪取鱼尾，提取6个种类的鳗鲡组织基因组DNA，摸索聚合酶链反应体系组分和反应条件。选择32条不同的随机排列碱基序列的多聚核苷酸单链为引物，进行RAPD-PCR扩增反应，将产物通过琼脂糖凝胶电泳，制备DNA多态性图谱。通

3、过种间多态性比较分析，从分子生物学上确立这6个鳗鲡种类的分类；同时，对扩增的条带进行统计，计算6个鳗鲡种类的遗传相似系数和遗传距离。结果：根据测定的６组鳗苗的形态学数据：脊椎骨数量、长鳍型和尾鳍扇圆形，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离、体长、体重、头长、体高、眼间距等统计结果，结合鳗苗实际产地，并对照TonyRobinet等对鳗鲡种类分布的描述确定了各组鳗鲡的种类。日本组鳗鲡产地在北半球太平洋，靠近日本，为长鳍型，脊椎骨数为116.15±0.62，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离占全长的7.12～9.08%，鉴定为日

4、本鳗鲡；欧洲组鳗鲡产地在大西洋欧洲沿海，为长鳍型，脊椎骨数为115.90±0.34，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离占全长的10.6～11.3％，鉴定为欧洲鳗鲡；美洲组鳗鲡产地在大西洋北美洲沿海，为长鳍型，脊椎骨数为103～110，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离占全长的7.8～8.2％，鉴定为美洲鳗鲡；太平洋组鳗鲡产地赤道附近太平洋，为长鳍型，脊椎骨数为104.27±0.65，背鳍与臀鳍前端基部1福建农林大学硕士学位论文之间的距离占全长的12.8～15.2％，鉴定为花鳗鲡；南非组鳗鲡产地在印度洋南非东部沿海，为长鳍

5、型，脊椎骨数为103.37±0.35，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离占全长的13.5～14.4％，鉴定为莫桑比克鳗鲡；菲律宾组鳗鲡产地在菲律宾沿海，为长鳍型，脊椎骨数为104.09±0.62，背鳍与臀鳍前端基部之间的距离占全长的9.27～10.7％，鉴定为西里伯斯鳗鲡。经过RAPD电泳条带分析，筛选出13个扩增产物谱带清晰、多态性较好的引物，用这13个引物共扩增出129条条带，片段大小范围为250～2500bp。其中莫桑比克鳗鲡和西里伯斯鳗鲡产生的条带最多，出现了28条带，其他组产生条带数目依次为花鳗鲡25条带

6、，日本鳗鲡20条带，美洲鳗鲡17条带，欧洲鳗鲡11条带。其中引物S21可单独作为6个鳗鲡种类的种间分子标记。根据公式对获得的条带进行遗传距离分析，统计得到6种鳗鲡的种间相似性系数和遗传距离：莫桑比克鳗鲡与日本鳗鲡相似性系数为0.4762，与花鳗鲡相似性系数为0.4905，与美洲鳗鲡相似性系数为0.1952，与欧洲鳗鲡相似性系数为0.2262，与西里伯斯鳗鲡相似性系数为0.2524；日本鳗鲡与花鳗鲡相似性系数为0.4333，与美洲鳗鲡相似性系数为0.2738，与欧洲鳗鲡相似性系数为0.3333，与西里伯斯鳗鲡相

7、似性系数为0.2833；花鳗鲡与美洲鳗鲡相似性系数为0.2429，与欧洲鳗鲡相似性系数为0.2667，与西里伯斯鳗鲡相似性系数为0.4262；美洲鳗鲡与欧洲鳗鲡相似性系数为0.5833与西里伯斯鳗鲡相似性系数为0.2976；欧洲鳗鲡与西里伯斯鳗鲡相似性系数为0.1595。将遗传距离实验数据输入计算机，用NTSYS软件进行聚类分析，采用UPGMA法构建6个鳗鲡种类的亲缘关系图。聚类分析显示欧洲鳗鲡与美洲鳗鲡亲缘关系最近，首先聚为一类；花鳗鲡与莫桑比克鳗鲡有较近的亲缘关系，日本鳗鲡与之也较接近，而西里伯斯鳗鲡关系

8、稍远，这4种鳗鲡聚为一类。本结果说明鳗鲡亲缘关系与鳗鲡的地理分布密切相关，除受地理分布影响外，可能还受洋流运动的影响。关键词：鳗鲡种类形态学RAPD鉴定　　　　　　　2福建农林大学硕士学位论文AbstractObjective:Applyingatraditionmethodbasisonthemorphologyclassification,countandmeasurethemainmorpho