欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:27195561
大小:263.00 KB
页数:21页
时间:2018-12-01
《dna提取及常见问题分析和对策》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、完美WORD格式DNA提取和常见问题分析及对策主讲人:关锰整理分享完美WORD格式DNA简单介绍DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象。为了进行测序、杂交和基因的表达,获得高分子量和高纯度的DNA是非常重要的前提。整理分享完美WORD格式DNA提取原则.保证DNA结构的完整性.纯化后不应存在对酶有抑制作用的物质.排除有机溶剂和金属离子的污染.蛋白质、多糖、酚类等降低到最低程度.排除其他核酸分子的污染整理分享完美WORD格式DNA提取的几种方法一、染色体DNA的提取CTAB法S
2、DS法其它整理分享完美WORD格式DNA提取的几种方法二、非染色体DNA的提取整理分享完美WORD格式质粒DNA的提取•碱裂解法•煮沸法整理分享完美WORD格式线粒体、叶绿体DNA的提取•差速离心结合SDS裂解法整理分享完美WORD格式CTAB法原理(植物DNA提取经典方法)CTAB(hexadecyltrimethylammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合物。该复合物在高盐溶液中(>0.7mol/LNaCl)是可溶的,通过有机溶剂抽提,去除
3、蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇或异丙醇沉淀即可使核酸分离出来。注:CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。整理分享完美WORD格式CTAB法流程图整理分享完美WORD格式植物材料裂解液异丙醇沉淀整理分享完美WORD格式整理分享完美WORD格式液氮研磨抽提离心洗涤DNA溶液整理分享完美WORD格式整理分享完美WORD格式细胞裂解上层溶液干燥溶解整理分享完美WORD格式CTAB中各个组分的作用CTAB提取缓冲液的经典配方.Tris-
4、HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;.EDTA螯合Mg2+离子或Mn2+离子,抑制DNase活性;.NaCl提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;.CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;.β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。整理分享完美WORD格式CTAB提取缓冲液的改进配方PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。整理分享完美WORD格式
5、除蛋白质:?氯仿/异戊醇抽提(氯仿可使蛋白质变性并有助于液相与有机相的分离;异戊醇则有助于消除抽提过程中出现的气泡)。?使用变性剂变性(SDS.异硫氰酸胍等)?高盐洗涤?蛋白酶处理整理分享完美WORD格式除多糖:>高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5MNaCl,高盐可溶解多糖。>用多糖水解酶将多糖降解。>在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖。整理分享完美WORD格式除酚类物质:>在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:β-巯基乙醇.抗坏血酸.半胱氨酸.二
6、硫苏糖醇等>加入易与酚类结合的试剂:如PVP.PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合整理分享完美WORD格式除盐离子:70%的乙醇洗涤整理分享完美WORD格式TE中成分的作用>TE中的EDTA能螯和Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase>pH值为8.0,可防止DNA发生酸解整理分享完美WORD格式称取样品,液氮研磨,加入预热的(65℃)CTAB及β-巯基乙醇保温1h,期间不停的摇均吸取上清液,移至新的离心管中,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),轻缓颠倒混匀,10000rpm,1
7、0min取上清液,移至新的离心管中,加等体积氯仿:异戊醇,颠倒混匀,10000rpm,10min取上清液,加入0.6-0.7V的异丙醇(预冷),后4℃/-20℃保温沉淀10000rpm,10min离心取沉淀,70%乙醇清洗两次,吹干用TE溶解DNA,然后低温保存整理分享完美WORD格式应注意的问题材料准备:最好使用新鲜材料,低温保存的样品材料不要反复冻融。液氮研磨:研磨样品时要有液氮的保护,在整个过程中都不要让液氮挥发干净。避免材料回温和反复冻融带来的降解。此外尽量将样品研磨的很细,这样可以提高DNA产量。细胞
8、裂解:材料应适量,过多会影响裂解,导致DNA量少,纯度低。高温温浴时,定时轻柔振荡。整理分享完美WORD格式应注意的问题DNA沉淀:用乙醇或异丙醇都可以。异丙醇沉淀的效率要高于无水乙醇,试验中只需要0.6倍体积的异丙醇沉淀;而需要2倍体积的无水乙醇。但是异丙醇沉淀容易将盐成分一起沉淀,且在DNA沉淀中异丙醇难以挥发除去。DNA干燥:晾干DNA,让乙醇充分挥发。DNA溶解:若长期储存建议
此文档下载收益归作者所有