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《柑橘黄龙病株不同部位内生细菌群落结构的多样性》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、22柑橘黄龙病株不同部位内生细菌群落结构的多样性刘波1基金项目:中美合作项目--柑橘木虱生防菌与抗虫柑橘品种研究;福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(No.STIF-Y03)。作者简介:刘波(1957—),男,博士,研究员,主要从事微生物生物技术和生物防治研究.E-mail:fzliubo@163.com,通讯作者。,郑雪芳1,孙大光1,2,阮传清1,范国成3,HallD.4,段永平41福建省农业科学院农业生物资源研究所,福州350003;2福建师范大学生命科学学院,福州350003;3福建省农业科学院果树研究所福州
2、,350003;4美国农业部佛罗里达园艺试验室,弗罗里达34945摘要:采用PCC(Pearsoncorrelationcoefficient)、系统聚类和多样性指数研究了柑橘黄龙病(citrushuanglongbing,HLB)植株不同部位叶片、枝条及其根部内生细菌的相互关系及其群落结构多样性。结果表明,从供试柑橘中分离得到26株内生细菌(叶片10株,枝条14株,根部2株)隶属于10个属19个种。Nested-PCR结果显示,柑橘植株不同空间叶片中,黄龙病病原的阳性检出率为58.3%。用LSD法比较显示,柑橘内生细菌在不同器官的分
3、布量大小依次为根>叶>枝条。上、中、下不同部位叶片和枝条内生细菌分布量差异不显著,而东、西、南、北不同方位的叶片和枝条内生细菌分布量差异显著(P<5%)。柑橘内生细菌之间的PCC分析表明,Bacilluspumilus和Bacillusthuringiensis与柑橘黄龙病病原菌呈显著负相关,Bacillusthuringiensis和Bacilluspumilus与Bacillussubtilis呈显著正相关。Bacillusbrevis和Escherichiahermannii与Bacillusvesiculariss存在显著正相
4、关。对柑橘不同器官内生细菌的PCC分析表明,同种器官的内生细菌之间呈正相关,不同器官的内生细菌之间呈负相关。以内生细菌在各器官的分布量为指标分析不同器官之间的相关性,结果表明,叶片与枝条呈正相关,PCC为0.55,叶片与根部、枝条与根部均呈负相关,PCC分别为-0.19和-0.13。16SrDNA序列聚类分析表明,柑橘内生细菌可分为两大类,第I大类为革兰氏阳性菌,第II大类为革兰氏阴性菌。第I大类又可以分为芽孢杆菌属和短小杆菌属两个亚类,第II大类也可以分两个亚类。对柑橘黄龙病病原与叶片内生细菌进行聚类分析,可以分为三类,第I类特征为
5、内生细菌存在所有部位的叶片;第II类特征为内生细菌与黄龙病病原菌存在负相关性;第III类特征为内生细菌只存在特定部位叶片。当马氏距离为27.23时,可将柑橘黄龙病内生细菌群落结构聚为3类,第Ⅰ类特点是在不同部位叶片均有分布,为完全分布类型,且分布量较大,第Ⅱ类特点是在各器官中均为不完全分布类型,且分布量不均匀,第Ⅲ类特点是根部分布特性且分布量较大。分析多样性指数表明,SHANNON(H1)指数在叶片最高,根部最低。SIMPSON(D)指数在枝条最高,根部最低。Pielou指数在根部最高,枝条最低。关键词:柑橘;黄龙病;内生细菌;多样性
6、;群落结构ThepolymorphismofendophyticbacteriacommunitystructureinHuanglongbingPathogen-InfectedCitrusLIUBo1*,ZHENGXue-fang1,SUNDa-guang1,2,RUANChuan-qing1,FANGuo-cheng3,HallD.4,DUANYong-ping41.AgriculturalBioresource.ResearchInstitute,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzh
7、ou350003,China;2.CollegeOfLifeScienceFujiannormaluniversity,Fuzhou350003,China;3.ResearchInstitute.ofPomology,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou350003,China;4.USDA-ARS-USHRL,FortPierce,FL34945,U.S.A22Theanalysesmethodsofpearsoncorrelationcoefficient,hierarchical
8、clusteranalysisanddiversityindexwereusedtostudytherelevancebetweenthecitrushuanglongbingandtheendophyticbacter