生物工程论文参考范文：乳腺癌转移有关基因之生物信息学探讨及功能研究

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1、生物工程论文参考范文：乳腺癌转移有关基因之生物信息学探讨及功能研究前言我国女性乳腺癌论文范文的发病率低于欧美国家，但近年来以每年3%?4°%的增长率急剧上升，城市乳腺癌更是以每年7.5%的速度上升，死亡率则平均每年上升6.9%，且发病年龄早于西方国家10~15年，呈年轻化趋势⑴。尽管乳腺癌的诊断方法、治疗手段和技术水平不断完善，但乳腺癌患者的死亡率仍得不到有效控制。转移是导致乳腺癌患者死亡的主要原因，提高患者生存率，改善其预后的关键在于早期对乳腺癌患者的转移潜能及预后进行准确评估，指导临床实施个体化治疗。乳腺癌细胞转移的途径主要为血道转移和淋巴道转移。癌细胞转移是多因素参与

2、，多步骤、多阶段的复杂生物学过程：癌细胞脱离原发肿瘤，粘附（并侵出基底膜basementmembranes，BM)和侵入细胞外基质（extracellularmatrix，ECM)中；在周围间质中浸润生长的癌细胞与毛细血管或淋巴管内皮细胞粘附，穿过毛细管壁，在血管或淋巴管内存活并转运；肿瘤细胞到达远处器官侵出血管或淋巴管，侵入紀器官的间质组织并驻足生长，最终形成转移癌灶。在肿瘤细胞的转移过程中，涉及了细胞生长和代谢能力增强；细胞间同质粘附能力的降低；细胞与ECM间异质粘附能力的增强；细胞迁移和运动能力的增强；细胞自身产生及诱导宿主细胞产生降解ECM和BM的蛋白酶增加及分泌蛋白酶抑制

3、剂的减少；促肿瘤血管生成能力增强；肿瘤细胞产生器官特异的趋向性；肿瘤细胞逃避宿主的免疫监视等等。同时肿瘤细胞转移过程中的粘附、运动、蛋白水解、血管生成、组织趋向和免疫逃逸等都涉及肿瘤组织内肿瘤细胞自身和肿瘤细胞与肿瘤微环境的相互作用的信号传导的调节。因此，肿瘤细胞转移能力的获得是肿瘤组织细胞的一系列基因改变调控的，包括转移促进基因和转移抑制基因，其中包括部分与肿瘤发生相关的癌基因和抑癌基因，它们在不同患病个体的肿瘤细胞内表达的区别决定了不同患者间转移潜能的不同[24]。肿瘤转移相关基因的蹄选研究是目前肿瘤转移研究领域的热点，它可以为转移机制的研究提供线索，为转移的诊断提供分子标志，

4、为患者的预后评估提供客观指征，为抗转移治疗提供祀点[5-6]。一、乳腺癌转移(Breastcancermetastasis)概况(一）临床特征乳腺癌是一种临床异质性的疾病，大约有10-15%的乳腺癌患者在首次确诊为原发肿瘤后3年都会伴发其它严重疾病或发生远处转移。然而，在初始诊断后10年或更长时间发生远处转移也不罕见，因此，乳腺癌患者终身都会经历乳腺癌转移的风险，乳腺癌转移的异质性特征不仅难以定义治愈该疾病，而且也很难评估转移的风险因素。浸润性乳腺癌已鉴定出多种组织病理类型，其中浸润性导管癌是指不属于任何其它浸润性乳腺癌的一种类型，在乳腺癌中占的比例最大（表0-1)。尽管形态不同，

5、还有一些特殊类型的乳腺癌占所有乳腺癌类型的5-10%。一般情况下，组织学类型仅仅是乳腺癌转移风险一个较弱的预后标志。一旦扩散，乳腺癌转移瘤会在各种组织器官中形成，最常见的转移扩散部位是骨、肺和肝（图0-1)。第一章乳腺癌转移相关基因的蹄选与生物信息学分析乳腺癌是以局部病变为首发症状的全身性疾病[72]。目前临床用于乳腺癌预后预测的主要指标包括原发癌大小、临床分期、病理类型、组织学分级、腋窝淋巴结转移情况和激素受体状态等，但组织病理学和细胞形态学方法难以对肿瘤细胞的转移潜能或转移状态进行准确评估。肿瘤细胞转移生物学过程的复杂性，决定了从基因组水平蹄选与转移表型相关的功能基因成为目前乳

6、腺癌转移预后相关基因研究的主要途径[59]。通常是比较转移与不转移的细胞系，或同一细胞系的高转移与低转移的亚克隆虽然细胞系的遗传单一，蹄选基因的稳定性和可重复性高，但由于细胞体外长期传代，其遗传基因已发生改变，不能客观反应体内的生物学特征。为此，基于乳腺癌病例组织标本，比较转移癌与原发癌或高、低转移潜能原发癌之间的基因表达差异，成为目前蹄选乳腺癌转移相关基因或基因表达特征（geneexpressionsignatures)及乳腺癌生物学特征研究的主要方法[73，74]。结合以上观点，我们利用三组相关的乳腺癌组织标本芯片表达谱数据，采用生物信息学工具蹄选乳腺癌转移相关基因，为阐明乳腺

7、癌发生和转移机制提供线索。1.1材料与方法1.1.1芯片平台GPL96芯片平台（[HG-U133A]AffymetrixHumanGenomeU133AArray)共包含1,000,000条寡核苷酸片段，22283个核酸探针，覆盖39,000个转录变异体，代表33,000条人全长基因。截至2012年3月，GPL96平台总共包含了911个GSE中的30948个样品芯片数据信息。GPL570芯片平台（[HG-U133_Plus2]AffymetrixHumanGenome