荷斯坦牛耐热性rapd 和scar 标记的研究

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时间:2018-11-24

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1、荷斯坦牛耐热性RAPD和SCAR标记的研究收稿日期:2008-02-18基金项目:国家十一五科技支撑计划(2006BAD04A01);湖南省重大科技攻关专项(05NK2004)。作者简介:苏光华(1981-),男,苗族,湖南靖州人,硕士,主要从事动物分子数量遗传学研究,Tel;023-49842269,E-mail:ghsu81@yahoo.com.cn通讯作者:肖兵南(1949-),男,汉族,湖南宁乡,硕士,研究员,硕士研究生导师,主要从事畜禽生物技术研究,Tel:0731-4615348,E-mail:bingnanxiao@yeah.net苏光华1,2,胡雄

2、贵2,燕海峰2,肖兵南2*,张元跃3(1.重庆市种畜场,重庆江北400020;2.湖南省畜牧兽医研究所,湖南长沙410131;3.湖南农业大学动物科技学院,湖南长沙410128)摘要:以52头高产耐热组和41头高产不耐热组中国荷斯坦牛的DNA为材料,选用200条RAPD引物,利用RAPD-PCR技术,对荷斯坦牛的耐热性进行研究。结果发现,使用S441引物和S463引物在高产耐热组中分别发现了581bp(RAPD-S441标记)和680bp(RAPD-S463标记)2条特异性的片段。通过测序和序列比较显示:581bp的片段与KCNN2基因的同源性达90%;680bp

3、片段与NW_001024067.1

4、BtUn_WGA9442_2同源性达99%。根据已知KCNN2基因的功能,初步判断KCNN2基因为耐热性能的候选基因。得到Genbank登录号EF123743和EF123744。利用NCBI的ORFfinder在581bp中没有发现ORF,与预测其是KCNN2基因的内含子3的结论相符合。在680bp中发现4个ORF,分别为ORF1、ORF2、ORF3、ORF4。这4个阅读框分别编码48AA、34AA、45AA、34AA。根据RAPD-S441、RAPD-S463标记的测序结果,利用Premier5.0软件设计对应的SCAR引物。

5、成功将RAPD-S441标记转化为耐热SCAR标记。关键词:荷斯坦;耐热性;RAPD-PCR;KCNN2基因中图分类号:Q75文献标识码:A文章编号:StudyonRAPDandSCARMarkersforHeat-ToleranceinHolsteinSUGuang-hua1,2,HUXiong-gui2,YANHai-feng2,XIAOBing-nan2*,ZHANGYuan-yue3(1.ChongqingBreedingStockFarm,Chongqing400020,China;2.HunanInstituteofAnimalandVeterinar

6、yScience,Changsha410131,China;3.CollegeofAnimalScienceandTechnology,HunanAgriculturalUniversity,Changsha410128,China)Abstract:TheheattoleranceoftheChineseHolstein(52herdshighyieldandheat-tolerance,togetherwith41herdshighyieldandheat-sensitivity)wasstudiedusingRAPD-PCR(200RAPDprimers).

7、Itindicatedthatthe581bp(primerS441)and680bp(primerS463)fragmentswerefoundinheat-tolerancegroups.Thehomologybetween581bpfragmentandKCNN2genegotto89%,aswellasthehomologybetween680bpfragmentandNW_001024067.1

8、BtUn_WGA9442_2gotto99%.AccordingtoitsfunctionitseemsasifthattheKCNN2genewasacand

9、idateofheat-tolerancegene.The581bpfragmentand680bpfragmentweresubmittedtoGenBankandtheaccessionnumbersofEF123743andEF123744weregotrespectively.TheORFwasnotfoundin581bpfragment,however,4ORFs(ORF1,coding48AA;ORF2,coding34AA;ORF3,coding45AA;ORF4,coding34AA)in680bpgenefragmentwerefound.Us

10、ingth

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