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时间:2018-11-15
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1、猪胎盘组织印记基因表达谱概述及基因网络创建第一章文献综述1.1基因组印记的研究进展1.1.1基因组印记的概念及其发现基因组印记的概念最早提出于20世纪60年代,在Sciara昆虫的研究中,HelenCrouse等[3]发现,两条X染色体中等位基因的表达活性存在差异,未出现双等位基因表达的现象。20世纪80年代,哺乳动物中首个基因印记现象被发现,McGrath等[4]利用细胞核移植技术发现,若小鼠受精过程的生殖细胞仅存在雄原核或雌原核,则发育形成的将分别为胚胎组织或胎盘组织,并且两种组织均不能形成完整个体以完成生长发育过程。另
2、外,在小鼠配子传递过程中添加专一性的化学修饰,可导致某些等位基因出现遗传信息的单方表达乂1991年,DeChiam等利用基因敲除技术证实了小鼠中胰岛素生长因子II(insulin-likegrodash;22];llpl5.5印记基因簇至少包括PHLDA2、H19、INS-2、IGF2、SLC22A1LS、MASH2和CDKN1C等印记基因[23_3g];15qll-ql3印记基因簇包括UBE3A、ATP10A、NECD、SNRPN、MAGEL2、IPKRN3和SNURF等Pi-36],并且发现该印记基因簇与Prader-E
3、ST基因可作用于胎盘和胚胎的生长发育及功能形成,并具有调节哺乳动物行为的功能[86];PLAGL1基因涉及一个有关胎儿生长发育的印记基因调控网络[87];IGF2基因与猪的生长速度和背膘厚等产肉性状有关,是影响猪瘦肉率性状的主要候选基因[88_89];DLK1基因参与负调控脂肪细胞的分化和肌肉生长,敲除后的小鼠出现生长迟缓、骨豁畸形等缺陷根据印记基因具有的物种保守性特征,本研究选取在人类和小鼠中对胎盘和胚胎生长发育具有重要作用的29个印记基因,选取具有高遗传性状的梅山猪作为研究对象,研究29个基因在猪怀孕不同时期胎盘中的表达
4、情况及在猪胎盘生长发育中的可能作用,并选取部分基因进行组织表达谱分析,以期发现29个基因在猪胎盘效率、胎盘功能形成、胚胎生命活动及生产性状等方面的可能影响,对进一步的功能机制研究及遗传育种工作提供新的参考理论依据,具有重要的现实意义。第三章材料与方法.........113.1实验材料.........113.2实验方法.........13第四章结果与分析.........214.1基因本体论、基因通路和小鼠同源基因.........214.2总RNA的提取和cDNA的制备.........244.2.1总RNA的提取..
5、.......244.2.2cDNA的制备与检测.........244.3梅山猪怀孕不同时期胎盘组织.........254.4构建基因调控网络结果.........264.5梅山猪部分目的基因的组织表达分析.........27第五章讨论.........335.1实时荧光定量PCR.........335.2胎盘生长发育相关候选印记基因.........335.3相关基因的调控网络.........355.4部分目的基因组织表达分析.........365.5印记基因与动物遗传育种.........38结论印记基因的蹄
6、选、发现、鉴定、所具有的特性及对其功能的深入研究,是对传统遗传育种理论的进一步拓展和补充。研究印记基因对胎盘发育的表达调控作用,对于提高母猪的产仔数、提高繁殖性能、降低生产成本、增加养猪业效益具有极其重要的现实意义。印记基因作为动物遗传育种的新型分子辅助标记,将成为家畜改良和育种的有力工具,为家畜遗传育种工作提供了新的可能和依据,具有重要的现实意义和参考价值。印记基因大多是调控家畜生长发育的主基因,这些基因对家畜胚胎早期发育与出生后的生长速度、产肉量、瘦肉率、饲料效率等数量性状有极大影响。研究发现,29个目的基因涉及多个影响
7、生长性状和产肉性状的QTL区域,在细胞增殖、分化及个体生长发育过程中发挥着重要作用。IGF2、PEG3、PEG10和GRB10基因在调控胎盘形成以及胚胎的生长发育过程中发挥重要作用;IGF2、P0N2、NECD和PHLDA2基因参与猪的生长速度和背願厚等产肉性状的调控;IGF2、PEG10、P0N2和PHLDA2基因调节脂肪生长,可能是调节脂肪沉积的主要因子之一。
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