水稻光壳基因gl-1的图位克隆和功能初探

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1、RICELIGHTSHELLGENEGL-1MAP-BASEDCLONINGANDFUNCTIONSWEREDISCUSSED水稻光壳基因gl-1的图位克隆和功能初探指导老师DIRECTPROFESSOR^:刘自强副教授队伍成员TEAMMATES^超晓禹、代羽、陈越0X035/12574303♦.翻：Abstract：1—>BOW2(―)研究意义2(二)国A外研究现状21、水稻基因组的测序为基因的图位克隆提供了条件22、水稻光壳基因的研究进展2二、实验内容及步骤4(―)实验N容41、水稻光壳基因的7个候选基因测序4(二)实验步骤41、W才41、PCR43、电

2、泳：扩增产物用1.2%的琼脂糖凝胶进行电泳5三、结果及分析5(-)關5側6摘要:光壳稻是世界稻种资源中的重要组成部分，本项n组从来源于美国光壳稻晶种“Starbonnet99"的以华粳籼74为背景的单R段代换系（SSSL）鉴定出1个控制稻谷光壳性状的基因gl-1，并将其候选区域界定在35.9kb的物理区域内，共包含7个候选基因。本项R拟在此工作的基础上，通过对7个候选基因进行测序分析，将候选基因范围缩小到2个，为进一步确定H标菇因，进而为丫解水稻稃毛发育的遗传葙础、探明水稻稃毛发育的分了机理和杏效利用光壳稻资源奠定基础。关键词光売稻图位克隆稃毛发育基因测序F

3、inemappingandcandidategeneanalysisofgenecontrollingtrichomeformationinrice(XiaoyuZhao,YuDai，YueChen)(CollegeofAgriculture,SouthChinaAgriculturalUniversity)Abstract：Glabrousriceisanimportantingredientofworldseedriceresources.Inourstudy,weidentifiedgl-1gene,whichcontrolstrichomeforma

4、tioninriceleavesandhulls,fromasinglesegmentsubstitutionline(SSSL)derivedfromcrossesbyusingHJX74astherecurrentparentandStarbonnet99asthedonor.Finemappingandhigh-resolutionlinkageanalysiswerecarriedout,andthegenewaslocalizedtoa35.9kbgenomicregionthatcontainssevenannotatedgenesaccordi

5、ngtothegenomesequenceofjaponicaNipponbare.Bysequencingthesevencandidategenes,wenarroweddownthecandidategenesfromseventotwo,greatlypromotingthefinalsuccessfulcloningofthisgene,elucidatingthemechanismsoftrichomeformationinriceandfacilitatingitsutilizationinagriculture.KeywordsGlabrou

6、srice;Finemapping;Trichomedevelopment;Genesequencing（一）研究意义光壳稻是世界稻种资源中的一个重要组成部分，我国的云贵高原、印尼爪哇和非洲都冇原始品种（严宗卜，1998）。普通栽培稻屮的光壳稻（nuda）属粳亚种A的一个生态群，是籼粳分化不彻底的热带粳稻，因其颖壳和叶片光滑无毛（无稃毛）而取名为光壳稻或光身稻（Glabrousrice）（程侃声，1993）。它不仅适合于现代农业的机械化操作，而且比宥稃毛品种可增加10%〜15%的仓贮景（郭龙彪等，1999）。很研究者发现许多光壳稻品种对籼稻和梗稻均具有良好的

7、亲和性（严宗卜,1998；郭龙彪等，1999；秦发兰等，1994；刘建昌等，1996；曾亚文等,1998、1999；胡培松等,1999；张培江等，1999；刘文炳等，2003）。光壳稻的光壳基因的闷位克隆，对进-•步弄清水稻稃毛发育的分子机理及有效利用光壳稻资源具有重要意义。（二）国内外研究现状1、水稻基因组的测序为基因的图位克隆提供了条件水稻基因组的测序积累了大M的序列数裾，为大规模分子标记的发展提供了可能。McCouchetal.（2002）根据水稻基因组中的微卫星序列发展了2240个微卫星标记，使水稻基因组中可以利用的微卫呈标记的总数达到了2740个。

8、Shenetal.（2004）根据籼粳亚种问的序列差