高斯软件-基础应用教程教案

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1、

2、GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。菜单栏§【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件§【Ed

3、it】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等

4、§【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等§【Calculate】直接向Gaussian提交计算§【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果§【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等§【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;

5、 【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基

6、、异丁基等

7、【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】

8、【键角调整】

9、【二面角调整】

10、【查询已有结构】

11、【增加化学键】

12、【删除化学键】

13、【翻转原子】

14、【单个选择】

15、【框选】

16、【去除选择】

17、【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具

18、GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。1、开启G

19、view2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现)

20、用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】

21、元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】双击图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的【H】即可

22、至此,分子式已经构建完成,Gview存储个人常用分子的功能,双击view上的图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)

23、查看分子坐标:单击Gview界面的图标,查看分子的坐标。至此,我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】——【Save】然后选择保存路径即可。GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好

24、了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。点击Gview界面上的【Calculate】——【GaussianCalculateSetup】

25、从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下

26、【JobType】工作类型:【Energy能量】

27、【Optimization优化】

28、【Frequency频率】

29、【Opt+Freq优化+频率】

30、【Scan扫描】

31、【Stability稳定性】

32、【NMR核磁】,这里我们选择【NMR】核磁【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可【Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命

33、名【Link0】给检查点文件命名其它选择默认即可选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。(最好存到安装文件所在磁盘)

34、系统会询问是否提交至Gaussian,选择【OK】,Gaussian会自动开启并计算,计算时间因硬件配置而异计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【是】

35、计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。这里我们选择.chk文件【Ok】接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView的主界面点击【Results】——【Summa

36、ry】可以看到刚才的计算总结,点击【ViewFile】可以看到日志文件。

37、因为我们刚才选择计算模式是【NMR】核磁,所以我们点击【Results】——【NMR】,随

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